239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6367 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007336  Reut_C6367  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
353 aa  719    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5287  aminoglycoside phosphotransferase  97.17 
 
 
353 aa  699    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599023  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1706  aminoglycoside phosphotransferase  68.7 
 
 
355 aa  498  1e-140  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.9599  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1478  aminoglycoside phosphotransferase  63.08 
 
 
353 aa  460  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0625  aminoglycoside phosphotransferase  55.65 
 
 
354 aa  412  1e-114  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.149436 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1847  aminoglycoside phosphotransferase  53.59 
 
 
362 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.00532112 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3481  aminoglycoside phosphotransferase  54.15 
 
 
353 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0724682  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0972  aminoglycoside phosphotransferase  53.93 
 
 
358 aa  391  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0454764 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2171  aminoglycoside phosphotransferase  53.59 
 
 
362 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0620475  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3187  putative tyrosine protein kinase/aminoglycoside phosphotransferase  55.4 
 
 
368 aa  390  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3286  aminoglycoside phosphotransferase  53.46 
 
 
361 aa  390  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2016  hypothetical protein  54.99 
 
 
358 aa  387  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120817  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1007  aminoglycoside phosphotransferase  53.39 
 
 
358 aa  387  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  56.16 
 
 
352 aa  387  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1368  aminoglycoside phosphotransferase  54.83 
 
 
368 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544786  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1084  phosphotransferase enzyme family protein  56.57 
 
 
368 aa  381  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3209  aminoglycoside phosphotransferase  54.15 
 
 
391 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79954  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3709  aminoglycoside phosphotransferase  53.3 
 
 
352 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  50.98 
 
 
364 aa  377  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  52.72 
 
 
352 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3076  aminoglycoside phosphotransferase  52.49 
 
 
361 aa  374  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.986116  normal  0.214027 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1805  phosphotransferase enzyme family protein  56 
 
 
368 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113334  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1460  phosphotransferase family protein  56 
 
 
368 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1323  phosphotransferase enzyme family protein  55.71 
 
 
368 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1314  phosphotransferase enzyme family protein  56 
 
 
368 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1986  aminoglycoside phosphotransferase  53.71 
 
 
368 aa  368  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0714  phosphotransferase enzyme family protein  56 
 
 
368 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.701125  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0437  phosphotransferase enzyme family protein  56 
 
 
368 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1154  phosphotransferase enzyme family protein  56 
 
 
368 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.119269  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  52.74 
 
 
359 aa  368  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1778  aminoglycoside phosphotransferase  52.35 
 
 
361 aa  360  2e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.221845  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1944  aminoglycoside phosphotransferase  52.08 
 
 
361 aa  359  3e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0994  aminoglycoside phosphotransferase  51.87 
 
 
358 aa  356  2.9999999999999997e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.739164  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2629  aminoglycoside phosphotransferase  49.72 
 
 
368 aa  356  3.9999999999999996e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0566206  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4307  aminoglycoside phosphotransferase  52.1 
 
 
362 aa  354  1e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0855792  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3327  aminoglycoside phosphotransferase  48.2 
 
 
361 aa  350  2e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1952  hypothetical protein  49.86 
 
 
363 aa  350  3e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.126845 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2960  aminoglycoside phosphotransferase  51.12 
 
 
363 aa  344  1e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3072  aminoglycoside phosphotransferase  50.29 
 
 
388 aa  339  5e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267154  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4490  aminoglycoside phosphotransferase  50 
 
 
344 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  47.6 
 
 
345 aa  334  1e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1912  aminoglycoside phosphotransferase  48.6 
 
 
363 aa  334  2e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.143156  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  48.7 
 
 
344 aa  333  3e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  50.62 
 
 
346 aa  328  8e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2658  aminoglycoside phosphotransferase  49.7 
 
 
348 aa  328  1.0000000000000001e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  50.99 
 
 
352 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  50 
 
 
346 aa  324  1e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5046  aminoglycoside phosphotransferase  51.04 
 
 
342 aa  323  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5019  aminoglycoside phosphotransferase  50.9 
 
 
343 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5841  aminoglycoside phosphotransferase  50.9 
 
 
343 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3038  aminoglycoside phosphotransferase  50.45 
 
 
343 aa  315  5e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145633  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  46.88 
 
 
356 aa  315  8e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4338  aminoglycoside phosphotransferase  50.6 
 
 
343 aa  315  9e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0011  aminoglycoside phosphotransferase  46.98 
 
 
337 aa  314  9.999999999999999e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477677  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  49.85 
 
 
343 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3218  aminoglycoside phosphotransferase  50.46 
 
 
343 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5078  aminoglycoside phosphotransferase  50.15 
 
 
357 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114652  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  47.2 
 
 
353 aa  309  4e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  43.88 
 
 
344 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  44.71 
 
 
344 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6405  aminoglycoside phosphotransferase  49.38 
 
 
343 aa  301  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  45.29 
 
 
352 aa  300  3e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5523  aminoglycoside phosphotransferase  46.67 
 
 
354 aa  299  6e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5718  aminoglycoside phosphotransferase  48.18 
 
 
343 aa  298  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  46.53 
 
 
358 aa  281  1e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2810  aminoglycoside phosphotransferase  47.59 
 
 
336 aa  269  5.9999999999999995e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541387  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0182  aminoglycoside phosphotransferase  46.51 
 
 
339 aa  264  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1018  aminoglycoside phosphotransferase  44.71 
 
 
358 aa  264  2e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1003  aminoglycoside phosphotransferase  46 
 
 
337 aa  242  7.999999999999999e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.083137  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44815  predicted protein  38.96 
 
 
401 aa  235  7e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00272  Phosphotransferase enzyme family domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G02880)  38.07 
 
 
364 aa  226  5.0000000000000005e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0403488 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03575  conserved hypothetical protein  39.01 
 
 
382 aa  218  2e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000000000417881  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  41.88 
 
 
348 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  38.27 
 
 
344 aa  195  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  37.5 
 
 
341 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  38.16 
 
 
339 aa  189  8e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  34.78 
 
 
348 aa  189  8e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2908  aminoglycoside phosphotransferase  36.87 
 
 
347 aa  189  9e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.1681 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  35.51 
 
 
338 aa  187  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40103  predicted protein  41.54 
 
 
264 aa  186  7e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7669  phosphotransferase family protein  36.48 
 
 
349 aa  182  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  37.1 
 
 
356 aa  182  7e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  34.99 
 
 
359 aa  181  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  38.44 
 
 
354 aa  179  4.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2724  hypothetical protein  34.8 
 
 
355 aa  179  7e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  38.83 
 
 
338 aa  179  7e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4576  aminoglycoside phosphotransferase  38.15 
 
 
357 aa  179  9e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3418  aminoglycoside phosphotransferase  34.86 
 
 
355 aa  177  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.949755  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2216  aminoglycoside phosphotransferase  34.37 
 
 
355 aa  176  4e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2075  aminoglycoside phosphotransferase  34.76 
 
 
355 aa  177  4e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0283964  normal  0.0813065 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2209  aminoglycoside phosphotransferase  34.34 
 
 
350 aa  176  5e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375246  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2457  aminoglycoside phosphotransferase  34.77 
 
 
355 aa  176  6e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00764802 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  34.06 
 
 
348 aa  176  6e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  37.42 
 
 
315 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3467  hypothetical protein  33.43 
 
 
356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2064  aminoglycoside phosphotransferase  36.49 
 
 
361 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449993  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02490  conserved hypothetical protein  32.26 
 
 
428 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40880  hypothetical protein  33.14 
 
 
356 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1885  aminoglycoside phosphotransferase  35.87 
 
 
347 aa  170  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2337  aminoglycoside phosphotransferase  33.53 
 
 
353 aa  170  3e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>