240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3327 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_3327  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
361 aa  754    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2629  aminoglycoside phosphotransferase  77.81 
 
 
368 aa  600  1.0000000000000001e-171  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0566206  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3076  aminoglycoside phosphotransferase  77.5 
 
 
361 aa  602  1.0000000000000001e-171  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.986116  normal  0.214027 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1912  aminoglycoside phosphotransferase  80.61 
 
 
363 aa  599  1e-170  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.143156  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2960  aminoglycoside phosphotransferase  79.78 
 
 
363 aa  595  1e-169  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3286  aminoglycoside phosphotransferase  74.24 
 
 
361 aa  577  1e-164  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4307  aminoglycoside phosphotransferase  75.83 
 
 
362 aa  579  1e-164  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0855792  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1778  aminoglycoside phosphotransferase  75.62 
 
 
361 aa  568  1e-161  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.221845  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1944  aminoglycoside phosphotransferase  75.35 
 
 
361 aa  566  1e-160  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2171  aminoglycoside phosphotransferase  67.41 
 
 
362 aa  521  1e-147  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0620475  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1847  aminoglycoside phosphotransferase  67.41 
 
 
362 aa  522  1e-147  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.00532112 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3187  putative tyrosine protein kinase/aminoglycoside phosphotransferase  67.04 
 
 
368 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1952  hypothetical protein  70.22 
 
 
363 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.126845 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1007  aminoglycoside phosphotransferase  65.83 
 
 
358 aa  512  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0972  aminoglycoside phosphotransferase  66.39 
 
 
358 aa  511  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0454764 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1368  aminoglycoside phosphotransferase  66.76 
 
 
368 aa  512  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544786  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2016  hypothetical protein  65.74 
 
 
358 aa  508  1e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120817  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1986  aminoglycoside phosphotransferase  64.9 
 
 
368 aa  496  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1805  phosphotransferase enzyme family protein  64.44 
 
 
368 aa  488  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113334  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1460  phosphotransferase family protein  64.44 
 
 
368 aa  488  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0714  phosphotransferase enzyme family protein  64.44 
 
 
368 aa  488  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.701125  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0437  phosphotransferase enzyme family protein  64.44 
 
 
368 aa  488  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1154  phosphotransferase enzyme family protein  64.44 
 
 
368 aa  488  1e-137  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.119269  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1323  phosphotransferase enzyme family protein  64.17 
 
 
368 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1084  phosphotransferase enzyme family protein  64.17 
 
 
368 aa  486  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1314  phosphotransferase enzyme family protein  64.44 
 
 
368 aa  487  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  52.75 
 
 
364 aa  398  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0625  aminoglycoside phosphotransferase  52.94 
 
 
354 aa  396  1e-109  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.149436 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  56.64 
 
 
346 aa  390  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  52.94 
 
 
352 aa  387  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  56.05 
 
 
346 aa  386  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  51.54 
 
 
352 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3209  aminoglycoside phosphotransferase  52.38 
 
 
391 aa  371  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79954  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3709  aminoglycoside phosphotransferase  49.86 
 
 
352 aa  368  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3481  aminoglycoside phosphotransferase  51.54 
 
 
353 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0724682  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  51.91 
 
 
345 aa  364  1e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0011  aminoglycoside phosphotransferase  53.54 
 
 
337 aa  363  3e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477677  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  53.67 
 
 
359 aa  362  6e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0994  aminoglycoside phosphotransferase  50.14 
 
 
358 aa  360  2e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.739164  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1706  aminoglycoside phosphotransferase  52.26 
 
 
355 aa  358  6e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.9599  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5523  aminoglycoside phosphotransferase  53.94 
 
 
354 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1478  aminoglycoside phosphotransferase  52.01 
 
 
353 aa  355  5.999999999999999e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5287  aminoglycoside phosphotransferase  48.48 
 
 
353 aa  354  1e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599023  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  49.86 
 
 
344 aa  354  1e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6367  aminoglycoside phosphotransferase  48.2 
 
 
353 aa  350  2e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  50.29 
 
 
352 aa  350  2e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  48.21 
 
 
344 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3072  aminoglycoside phosphotransferase  48.03 
 
 
388 aa  336  5e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267154  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2658  aminoglycoside phosphotransferase  48.99 
 
 
348 aa  333  3e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  47.47 
 
 
356 aa  331  1e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  46.29 
 
 
344 aa  325  1e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  48.48 
 
 
352 aa  323  2e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3218  aminoglycoside phosphotransferase  48.82 
 
 
343 aa  323  3e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4490  aminoglycoside phosphotransferase  46.86 
 
 
344 aa  323  3e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5019  aminoglycoside phosphotransferase  48.82 
 
 
343 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4338  aminoglycoside phosphotransferase  48.82 
 
 
343 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5841  aminoglycoside phosphotransferase  48.82 
 
 
343 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6405  aminoglycoside phosphotransferase  47.63 
 
 
343 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5078  aminoglycoside phosphotransferase  48.82 
 
 
357 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114652  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3038  aminoglycoside phosphotransferase  48.08 
 
 
343 aa  320  3e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145633  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  48.17 
 
 
353 aa  311  7.999999999999999e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5046  aminoglycoside phosphotransferase  46.88 
 
 
342 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  46.9 
 
 
343 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5718  aminoglycoside phosphotransferase  45.7 
 
 
343 aa  297  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1018  aminoglycoside phosphotransferase  45.06 
 
 
358 aa  297  2e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0182  aminoglycoside phosphotransferase  49.03 
 
 
339 aa  291  9e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2810  aminoglycoside phosphotransferase  46.58 
 
 
336 aa  290  2e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541387  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  41.28 
 
 
358 aa  278  1e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00272  Phosphotransferase enzyme family domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G02880)  36.16 
 
 
364 aa  239  6.999999999999999e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0403488 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44815  predicted protein  37.85 
 
 
401 aa  235  1.0000000000000001e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1003  aminoglycoside phosphotransferase  42.39 
 
 
337 aa  232  8.000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.083137  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03575  conserved hypothetical protein  36.21 
 
 
382 aa  228  2e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000000000417881  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  39.64 
 
 
339 aa  207  3e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  36.6 
 
 
341 aa  189  5.999999999999999e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5980  aminoglycoside phosphotransferase  36.75 
 
 
353 aa  189  9e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  36.28 
 
 
344 aa  188  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  33.63 
 
 
338 aa  187  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40103  predicted protein  40.75 
 
 
264 aa  187  2e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7669  phosphotransferase family protein  35.76 
 
 
349 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  36.22 
 
 
359 aa  182  7e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  35.12 
 
 
338 aa  182  9.000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  33.93 
 
 
348 aa  181  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3418  aminoglycoside phosphotransferase  33.43 
 
 
355 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.949755  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1885  aminoglycoside phosphotransferase  35.01 
 
 
347 aa  177  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4576  aminoglycoside phosphotransferase  36.14 
 
 
357 aa  176  5e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02490  conserved hypothetical protein  31.47 
 
 
428 aa  176  7e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40880  hypothetical protein  32.95 
 
 
356 aa  175  9e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2075  aminoglycoside phosphotransferase  32.58 
 
 
355 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0283964  normal  0.0813065 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2209  aminoglycoside phosphotransferase  33.14 
 
 
350 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375246  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2202  aminoglycoside phosphotransferase  30.92 
 
 
354 aa  173  3.9999999999999995e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0249474  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3467  hypothetical protein  32.67 
 
 
356 aa  173  5e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  33.23 
 
 
348 aa  172  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3865  aminoglycoside phosphotransferase  34.03 
 
 
350 aa  171  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0767712  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  36.93 
 
 
344 aa  170  4e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33361  protein serine/threonine kinase activity  31.67 
 
 
408 aa  170  4e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.814262 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2457  aminoglycoside phosphotransferase  31.74 
 
 
355 aa  169  5e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00764802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  34.95 
 
 
348 aa  170  5e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4129  aminoglycoside phosphotransferase  33.53 
 
 
358 aa  169  6e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.682336  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4969  aminoglycoside phosphotransferase  36.6 
 
 
338 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5350  aminoglycoside phosphotransferase  36.6 
 
 
338 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>