246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1844 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  100 
 
 		 339 aa  674    Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  68.79 
 
 		 338 aa  441  9.999999999999999e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  63.69 
 
 		 341 aa  404  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  60.82 
 
 		 344 aa  380  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2476  aminoglycoside phosphotransferase  60.66 
 
 		 338 aa  368  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000012289  decreased coverage  0.00166754 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  58.53 
 
 		 354 aa  364  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3865  aminoglycoside phosphotransferase  58.53 
 
 		 350 aa  363  3e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0767712  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  59.16 
 
 		 315 aa  358  6e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  58.48 
 
 		 356 aa  349  4e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  53.31 
 
 		 338 aa  344  1e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1831  aminoglycoside phosphotransferase  54.95 
 
 		 451 aa  335  5e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  53.14 
 
 		 359 aa  322  4e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7669  phosphotransferase family protein  52.23 
 
 		 349 aa  307  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5980  aminoglycoside phosphotransferase  53.8 
 
 		 353 aa  305  6e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1885  aminoglycoside phosphotransferase  49.25 
 
 		 347 aa  296  4e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5350  aminoglycoside phosphotransferase  49.38 
 
 		 338 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4969  aminoglycoside phosphotransferase  49.38 
 
 		 338 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5057  aminoglycoside phosphotransferase  49.38 
 
 		 338 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  52.2 
 
 		 344 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13793  acyl-CoA dehydrogenase fadE36  45.82 
 
 		 351 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.384329 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5603  aminoglycoside phosphotransferase  46.36 
 
 		 339 aa  270  4e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764833 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1204  aminoglycoside phosphotransferase  46.94 
 
 		 340 aa  261  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4518  aminoglycoside phosphotransferase  47.13 
 
 		 339 aa  257  3e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1559  aminoglycoside phosphotransferase  41.03 
 
 		 344 aa  248  8e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2519  aminoglycoside phosphotransferase  44.38 
 
 		 349 aa  238  1e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177703  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  41.87 
 
 		 348 aa  231  1e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  42.86 
 
 		 348 aa  230  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  38.6 
 
 		 356 aa  226  5.0000000000000005e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4129  aminoglycoside phosphotransferase  41.72 
 
 		 358 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.682336  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2064  aminoglycoside phosphotransferase  40.85 
 
 		 361 aa  224  2e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  41.39 
 
 		 359 aa  223  3e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  41.51 
 
 		 348 aa  223  3e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  41.64 
 
 		 352 aa  222  7e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  37.39 
 
 		 344 aa  221  9e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18680  predicted aminoglycoside phosphotransferase  39.06 
 
 		 357 aa  221  1.9999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.571289 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2075  aminoglycoside phosphotransferase  39.88 
 
 		 355 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0283964  normal  0.0813065 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0164  aminoglycoside phosphotransferase  40.23 
 
 		 357 aa  220  3e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0116  aminoglycoside phosphotransferase  40.82 
 
 		 379 aa  220  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0994  aminoglycoside phosphotransferase  39.74 
 
 		 358 aa  219  3.9999999999999997e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.739164  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3072  aminoglycoside phosphotransferase  38.46 
 
 		 388 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2202  aminoglycoside phosphotransferase  37.39 
 
 		 354 aa  219  3.9999999999999997e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0249474  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  40.66 
 
 		 364 aa  219  5e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  39.1 
 
 		 345 aa  218  1e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  43.38 
 
 		 352 aa  218  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  40.89 
 
 		 352 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2658  aminoglycoside phosphotransferase  40.54 
 
 		 348 aa  216  4e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2209  aminoglycoside phosphotransferase  40.92 
 
 		 350 aa  216  5e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375246  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2171  aminoglycoside phosphotransferase  43.13 
 
 		 362 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0620475  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1847  aminoglycoside phosphotransferase  43.13 
 
 		 362 aa  215  8e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.00532112 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2724  hypothetical protein  41.5 
 
 		 355 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3418  aminoglycoside phosphotransferase  39.25 
 
 		 355 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.949755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3209  aminoglycoside phosphotransferase  40.89 
 
 		 391 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2397  aminoglycoside phosphotransferase  44.34 
 
 		 362 aa  214  1.9999999999999998e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2908  aminoglycoside phosphotransferase  41.83 
 
 		 347 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.1681 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3467  hypothetical protein  39.29 
 
 		 356 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  37.13 
 
 		 344 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40880  hypothetical protein  39.29 
 
 		 356 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0222  aminoglycoside phosphotransferase  40.88 
 
 		 355 aa  213  4.9999999999999996e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.193801  normal  0.0244768 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1108  aminoglycoside phosphotransferase  40.77 
 
 		 362 aa  212  5.999999999999999e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1393  aminoglycoside phosphotransferase  36.84 
 
 		 363 aa  212  7.999999999999999e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0927  aminoglycoside phosphotransferase  35.35 
 
 		 351 aa  212  7.999999999999999e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.993496  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2903  aminoglycoside phosphotransferase  41.14 
 
 		 353 aa  212  7.999999999999999e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  37.79 
 
 		 352 aa  211  1e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2337  aminoglycoside phosphotransferase  40.57 
 
 		 353 aa  210  2e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1149  aminoglycoside phosphotransferase  42.01 
 
 		 337 aa  210  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2514  aminoglycoside phosphotransferase  40 
 
 		 365 aa  210  3e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2016  hypothetical protein  43.35 
 
 		 358 aa  209  5e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120817  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3559  aminoglycoside phosphotransferase  38.94 
 
 		 355 aa  209  6e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595969  normal  0.25426 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0972  aminoglycoside phosphotransferase  40.18 
 
 		 358 aa  208  9e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0454764 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3925  aminoglycoside phosphotransferase  39.09 
 
 		 355 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138496  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1910  aminoglycoside phosphotransferase  38.67 
 
 		 355 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2457  aminoglycoside phosphotransferase  38.01 
 
 		 355 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00764802 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1805  aminoglycoside phosphotransferase  36.67 
 
 		 352 aa  207  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3327  aminoglycoside phosphotransferase  39.64 
 
 		 361 aa  207  3e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1007  aminoglycoside phosphotransferase  42.17 
 
 		 358 aa  206  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1035  aminoglycoside phosphotransferase  39.14 
 
 		 353 aa  206  4e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5523  aminoglycoside phosphotransferase  41.4 
 
 		 354 aa  206  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1368  aminoglycoside phosphotransferase  42.01 
 
 		 368 aa  205  8e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544786  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4490  aminoglycoside phosphotransferase  38.94 
 
 		 344 aa  205  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5046  aminoglycoside phosphotransferase  38.41 
 
 		 342 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1986  aminoglycoside phosphotransferase  41.82 
 
 		 368 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1944  aminoglycoside phosphotransferase  41.39 
 
 		 361 aa  203  3e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1778  aminoglycoside phosphotransferase  41.69 
 
 		 361 aa  203  3e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.221845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  39.83 
 
 		 343 aa  203  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5078  aminoglycoside phosphotransferase  40.52 
 
 		 357 aa  203  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3214  aminoglycoside phosphotransferase  37.88 
 
 		 355 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.457678 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3481  aminoglycoside phosphotransferase  39.41 
 
 		 353 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0724682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0618  putative phosphotransferase  38.63 
 
 		 350 aa  202  6e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172758  normal  0.0703036 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3286  aminoglycoside phosphotransferase  39.71 
 
 		 361 aa  202  9e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3709  aminoglycoside phosphotransferase  38.8 
 
 		 352 aa  202  9e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6405  aminoglycoside phosphotransferase  37.17 
 
 		 343 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  39.25 
 
 		 358 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  38.46 
 
 		 353 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3218  aminoglycoside phosphotransferase  40.9 
 
 		 343 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3187  putative tyrosine protein kinase/aminoglycoside phosphotransferase  41.19 
 
 		 368 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1459  aminoglycoside phosphotransferase  35.01 
 
 		 354 aa  199  5e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.049097  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5718  aminoglycoside phosphotransferase  39 
 
 		 343 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4338  aminoglycoside phosphotransferase  39.7 
 
 		 343 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0011  aminoglycoside phosphotransferase  34.83 
 
 		 337 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477677  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5019  aminoglycoside phosphotransferase  39.7 
 
 		 343 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>