224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0618 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0618  putative phosphotransferase  100 
 
 
350 aa  708    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172758  normal  0.0703036 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0370  aminoglycoside phosphotransferase  58.21 
 
 
345 aa  373  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.380981  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1885  aminoglycoside phosphotransferase  52.1 
 
 
354 aa  344  1e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2652  aminoglycoside phosphotransferase  52.38 
 
 
353 aa  330  2e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000355622  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6361  aminoglycoside phosphotransferase  51.62 
 
 
342 aa  318  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00784596  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4318  aminoglycoside phosphotransferase  43.47 
 
 
350 aa  248  1e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136216  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1805  aminoglycoside phosphotransferase  43.07 
 
 
354 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.726443  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1852  aminoglycoside phosphotransferase  43.07 
 
 
354 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.906902  normal  0.283402 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1786  aminoglycoside phosphotransferase  42.6 
 
 
354 aa  245  6.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0286679  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2028  aminoglycoside phosphotransferase  44.69 
 
 
350 aa  233  5e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00704541  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2450  aminoglycoside phosphotransferase  41.01 
 
 
343 aa  231  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3748  aminoglycoside phosphotransferase  39.71 
 
 
350 aa  224  3e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4201  aminoglycoside phosphotransferase  40.38 
 
 
343 aa  222  6e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0861  aminoglycoside phosphotransferase  40.71 
 
 
354 aa  221  9.999999999999999e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.622757  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3736  aminoglycoside phosphotransferase  39.42 
 
 
350 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3809  aminoglycoside phosphotransferase  39.42 
 
 
350 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.274581 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2519  aminoglycoside phosphotransferase  41.35 
 
 
349 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177703  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  40.62 
 
 
354 aa  208  9e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0097  aminoglycoside phosphotransferase  37.57 
 
 
340 aa  207  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.92974  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  38.63 
 
 
339 aa  202  7e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  40 
 
 
356 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  38.15 
 
 
338 aa  196  4.0000000000000005e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  35.69 
 
 
338 aa  194  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  38.65 
 
 
344 aa  192  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  37.13 
 
 
341 aa  191  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7669  phosphotransferase family protein  37.03 
 
 
349 aa  186  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  39.29 
 
 
344 aa  186  6e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2476  aminoglycoside phosphotransferase  38.73 
 
 
338 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000012289  decreased coverage  0.00166754 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  34.62 
 
 
315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1108  aminoglycoside phosphotransferase  38.12 
 
 
362 aa  181  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  36.99 
 
 
359 aa  177  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2903  aminoglycoside phosphotransferase  33.13 
 
 
353 aa  175  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1393  aminoglycoside phosphotransferase  31.89 
 
 
363 aa  174  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2064  aminoglycoside phosphotransferase  35 
 
 
361 aa  173  5e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449993  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2658  aminoglycoside phosphotransferase  33.92 
 
 
348 aa  172  7.999999999999999e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5980  aminoglycoside phosphotransferase  34.81 
 
 
353 aa  171  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0222  aminoglycoside phosphotransferase  35.28 
 
 
355 aa  171  2e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.193801  normal  0.0244768 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1035  aminoglycoside phosphotransferase  34.04 
 
 
353 aa  171  2e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  35.63 
 
 
344 aa  170  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  34.62 
 
 
348 aa  169  7e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4490  aminoglycoside phosphotransferase  35.2 
 
 
344 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  33.86 
 
 
348 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2209  aminoglycoside phosphotransferase  35.84 
 
 
350 aa  162  6e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375246  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  34.13 
 
 
348 aa  162  6e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0994  aminoglycoside phosphotransferase  30.68 
 
 
358 aa  161  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.739164  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4576  aminoglycoside phosphotransferase  35.02 
 
 
357 aa  161  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3559  aminoglycoside phosphotransferase  30.93 
 
 
355 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595969  normal  0.25426 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3418  aminoglycoside phosphotransferase  33.56 
 
 
355 aa  159  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.949755  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3214  aminoglycoside phosphotransferase  32.48 
 
 
355 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.457678 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2075  aminoglycoside phosphotransferase  32.53 
 
 
355 aa  158  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0283964  normal  0.0813065 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2337  aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 
353 aa  157  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  34.42 
 
 
352 aa  157  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1559  aminoglycoside phosphotransferase  32.49 
 
 
344 aa  157  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  30 
 
 
344 aa  157  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  30.77 
 
 
364 aa  156  5.0000000000000005e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0164  aminoglycoside phosphotransferase  33.03 
 
 
357 aa  155  7e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2457  aminoglycoside phosphotransferase  31.45 
 
 
355 aa  155  8e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00764802 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  32.69 
 
 
352 aa  155  8e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3925  aminoglycoside phosphotransferase  32.15 
 
 
355 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138496  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3865  aminoglycoside phosphotransferase  34.59 
 
 
350 aa  154  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0767712  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1885  aminoglycoside phosphotransferase  35.69 
 
 
347 aa  154  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2397  aminoglycoside phosphotransferase  35.65 
 
 
362 aa  154  2.9999999999999998e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1831  aminoglycoside phosphotransferase  36.09 
 
 
451 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3467  hypothetical protein  32.76 
 
 
356 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  29.81 
 
 
352 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40880  hypothetical protein  32.54 
 
 
356 aa  153  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2724  hypothetical protein  32.88 
 
 
355 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3209  aminoglycoside phosphotransferase  29.39 
 
 
391 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79954  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3072  aminoglycoside phosphotransferase  29.12 
 
 
388 aa  152  8e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267154  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1459  aminoglycoside phosphotransferase  28.94 
 
 
354 aa  150  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.049097  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1910  aminoglycoside phosphotransferase  31.51 
 
 
355 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107516  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2514  aminoglycoside phosphotransferase  30.99 
 
 
365 aa  151  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5350  aminoglycoside phosphotransferase  34.97 
 
 
338 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4969  aminoglycoside phosphotransferase  34.97 
 
 
338 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0625  aminoglycoside phosphotransferase  30.35 
 
 
354 aa  151  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.149436 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5057  aminoglycoside phosphotransferase  34.97 
 
 
338 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560893  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  33.13 
 
 
346 aa  151  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6367  aminoglycoside phosphotransferase  32.18 
 
 
353 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5287  aminoglycoside phosphotransferase  32.18 
 
 
353 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599023  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5046  aminoglycoside phosphotransferase  31.53 
 
 
342 aa  150  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3709  aminoglycoside phosphotransferase  28.27 
 
 
352 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  32.69 
 
 
358 aa  149  7e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0011  aminoglycoside phosphotransferase  30.98 
 
 
337 aa  149  8e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477677  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  32.82 
 
 
346 aa  149  8e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2629  aminoglycoside phosphotransferase  33.23 
 
 
368 aa  148  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0566206  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2202  aminoglycoside phosphotransferase  29.55 
 
 
354 aa  148  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0249474  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0835  aminoglycoside phosphotransferase  36.31 
 
 
360 aa  149  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.407131  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  29.47 
 
 
359 aa  149  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13793  acyl-CoA dehydrogenase fadE36  33.43 
 
 
351 aa  147  3e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.384329 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4129  aminoglycoside phosphotransferase  33.1 
 
 
358 aa  146  6e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.682336  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  30.99 
 
 
353 aa  145  8.000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2908  aminoglycoside phosphotransferase  32.81 
 
 
347 aa  145  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.1681 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  29.45 
 
 
356 aa  145  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1007  aminoglycoside phosphotransferase  29.94 
 
 
358 aa  142  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0634  aminoglycoside phosphotransferase  28.17 
 
 
370 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3286  aminoglycoside phosphotransferase  31.31 
 
 
361 aa  141  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0972  aminoglycoside phosphotransferase  30.61 
 
 
358 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0454764 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1314  phosphotransferase enzyme family protein  31.86 
 
 
368 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  31.21 
 
 
352 aa  139  6e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  29.48 
 
 
344 aa  139  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>