241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1149 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1149  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
337 aa  669    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2908  aminoglycoside phosphotransferase  58.64 
 
 
347 aa  363  2e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.1681 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1885  aminoglycoside phosphotransferase  42.22 
 
 
347 aa  220  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  43.69 
 
 
348 aa  219  6e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  39.42 
 
 
341 aa  211  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  42.01 
 
 
339 aa  210  3e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  44.01 
 
 
344 aa  207  3e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  37.01 
 
 
338 aa  195  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  36.79 
 
 
356 aa  194  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  36.47 
 
 
315 aa  191  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  37.89 
 
 
344 aa  189  8e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4518  aminoglycoside phosphotransferase  38.13 
 
 
339 aa  188  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7669  phosphotransferase family protein  36.13 
 
 
349 aa  188  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5980  aminoglycoside phosphotransferase  40.4 
 
 
353 aa  187  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  37.46 
 
 
359 aa  177  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  35.83 
 
 
354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  35.37 
 
 
348 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  36.62 
 
 
356 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  35.92 
 
 
348 aa  173  3.9999999999999995e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3072  aminoglycoside phosphotransferase  33.64 
 
 
388 aa  172  5.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267154  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2519  aminoglycoside phosphotransferase  38.11 
 
 
349 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177703  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0625  aminoglycoside phosphotransferase  34.18 
 
 
354 aa  171  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.149436 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2476  aminoglycoside phosphotransferase  35.29 
 
 
338 aa  171  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000012289  decreased coverage  0.00166754 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  36.71 
 
 
346 aa  171  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  36.71 
 
 
346 aa  171  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1108  aminoglycoside phosphotransferase  39.24 
 
 
362 aa  170  4e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  35.53 
 
 
344 aa  169  4e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1559  aminoglycoside phosphotransferase  34.8 
 
 
344 aa  169  6e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  33.12 
 
 
338 aa  169  8e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4490  aminoglycoside phosphotransferase  37.72 
 
 
344 aa  168  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0994  aminoglycoside phosphotransferase  34.22 
 
 
358 aa  168  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.739164  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5523  aminoglycoside phosphotransferase  34.93 
 
 
354 aa  168  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  38.46 
 
 
352 aa  168  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  38.83 
 
 
358 aa  168  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2209  aminoglycoside phosphotransferase  36.97 
 
 
350 aa  166  5e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375246  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0222  aminoglycoside phosphotransferase  37.46 
 
 
355 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.193801  normal  0.0244768 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  37.14 
 
 
344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3865  aminoglycoside phosphotransferase  38.16 
 
 
350 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0767712  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3481  aminoglycoside phosphotransferase  34.33 
 
 
353 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0724682  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13793  acyl-CoA dehydrogenase fadE36  34.52 
 
 
351 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.384329 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5350  aminoglycoside phosphotransferase  35.97 
 
 
338 aa  162  7e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4969  aminoglycoside phosphotransferase  35.97 
 
 
338 aa  162  7e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5057  aminoglycoside phosphotransferase  35.97 
 
 
338 aa  162  7e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560893  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  33.44 
 
 
352 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  34.01 
 
 
344 aa  161  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  32.72 
 
 
345 aa  162  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5603  aminoglycoside phosphotransferase  35.53 
 
 
339 aa  161  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.764833 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  33.11 
 
 
359 aa  161  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18680  predicted aminoglycoside phosphotransferase  37.46 
 
 
357 aa  160  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.571289 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0182  aminoglycoside phosphotransferase  38.65 
 
 
339 aa  160  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0927  aminoglycoside phosphotransferase  33.11 
 
 
351 aa  160  4e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.993496  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0164  aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 
357 aa  159  5e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2658  aminoglycoside phosphotransferase  35.1 
 
 
348 aa  159  9e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  32.78 
 
 
352 aa  158  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  36.11 
 
 
352 aa  158  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1018  aminoglycoside phosphotransferase  35.13 
 
 
358 aa  158  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1393  aminoglycoside phosphotransferase  32.48 
 
 
363 aa  158  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1459  aminoglycoside phosphotransferase  32.46 
 
 
354 aa  158  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.049097  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2064  aminoglycoside phosphotransferase  34.58 
 
 
361 aa  158  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449993  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2171  aminoglycoside phosphotransferase  32.8 
 
 
362 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0620475  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0972  aminoglycoside phosphotransferase  33.54 
 
 
358 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0454764 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1847  aminoglycoside phosphotransferase  32.8 
 
 
362 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.00532112 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1778  aminoglycoside phosphotransferase  34.07 
 
 
361 aa  157  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.221845  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3209  aminoglycoside phosphotransferase  32.34 
 
 
391 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79954  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  33.56 
 
 
364 aa  156  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1944  aminoglycoside phosphotransferase  33.76 
 
 
361 aa  154  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2514  aminoglycoside phosphotransferase  37.93 
 
 
365 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2202  aminoglycoside phosphotransferase  32.89 
 
 
354 aa  154  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0249474  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1204  aminoglycoside phosphotransferase  36.55 
 
 
340 aa  152  8e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2397  aminoglycoside phosphotransferase  34.95 
 
 
362 aa  152  8.999999999999999e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1007  aminoglycoside phosphotransferase  33.02 
 
 
358 aa  151  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1478  aminoglycoside phosphotransferase  33.89 
 
 
353 aa  151  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3187  putative tyrosine protein kinase/aminoglycoside phosphotransferase  33.65 
 
 
368 aa  151  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1986  aminoglycoside phosphotransferase  34.08 
 
 
368 aa  152  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3709  aminoglycoside phosphotransferase  32.78 
 
 
352 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0011  aminoglycoside phosphotransferase  31.85 
 
 
337 aa  150  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477677  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1368  aminoglycoside phosphotransferase  33.01 
 
 
368 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544786  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3418  aminoglycoside phosphotransferase  33.8 
 
 
355 aa  150  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.949755  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5287  aminoglycoside phosphotransferase  35.53 
 
 
353 aa  149  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599023  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2337  aminoglycoside phosphotransferase  32.71 
 
 
353 aa  149  6e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2016  hypothetical protein  33.44 
 
 
358 aa  149  7e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120817  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3286  aminoglycoside phosphotransferase  31.63 
 
 
361 aa  149  8e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3327  aminoglycoside phosphotransferase  32.8 
 
 
361 aa  149  8e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6367  aminoglycoside phosphotransferase  35.22 
 
 
353 aa  149  9e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1706  aminoglycoside phosphotransferase  35.29 
 
 
355 aa  149  9e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.9599  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2810  aminoglycoside phosphotransferase  33.44 
 
 
336 aa  148  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541387  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  32.9 
 
 
353 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0471  aminoglycoside phosphotransferase  30.95 
 
 
403 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1831  aminoglycoside phosphotransferase  34.2 
 
 
451 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1910  aminoglycoside phosphotransferase  33.45 
 
 
355 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107516  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4307  aminoglycoside phosphotransferase  32.18 
 
 
362 aa  146  4.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0855792  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1805  aminoglycoside phosphotransferase  30.36 
 
 
352 aa  146  6e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2960  aminoglycoside phosphotransferase  34 
 
 
363 aa  145  9e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4129  aminoglycoside phosphotransferase  33.44 
 
 
358 aa  145  9e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.682336  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3925  aminoglycoside phosphotransferase  33.45 
 
 
355 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138496  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3559  aminoglycoside phosphotransferase  33.11 
 
 
355 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595969  normal  0.25426 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2075  aminoglycoside phosphotransferase  32.04 
 
 
355 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0283964  normal  0.0813065 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1912  aminoglycoside phosphotransferase  31.85 
 
 
363 aa  144  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.143156  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1003  aminoglycoside phosphotransferase  36.9 
 
 
337 aa  143  5e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.083137  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0370  aminoglycoside phosphotransferase  33.45 
 
 
345 aa  142  6e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.380981  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>