232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0222 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0222  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
355 aa  708    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.193801  normal  0.0244768 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1035  aminoglycoside phosphotransferase  68.59 
 
 
353 aa  490  1e-137  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2903  aminoglycoside phosphotransferase  67.24 
 
 
353 aa  486  1e-136  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  48.12 
 
 
344 aa  238  1e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2209  aminoglycoside phosphotransferase  40.5 
 
 
350 aa  228  1e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375246  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2064  aminoglycoside phosphotransferase  38.12 
 
 
361 aa  221  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449993  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1559  aminoglycoside phosphotransferase  35.82 
 
 
344 aa  221  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  41.89 
 
 
359 aa  219  6e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1108  aminoglycoside phosphotransferase  39.42 
 
 
362 aa  219  7.999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2519  aminoglycoside phosphotransferase  40.06 
 
 
349 aa  218  1e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177703  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7669  phosphotransferase family protein  41.25 
 
 
349 aa  216  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  39.81 
 
 
348 aa  215  8e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  40.88 
 
 
339 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  39.71 
 
 
354 aa  213  5.999999999999999e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2514  aminoglycoside phosphotransferase  38.84 
 
 
365 aa  212  5.999999999999999e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5980  aminoglycoside phosphotransferase  43.05 
 
 
353 aa  206  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  42.21 
 
 
356 aa  206  6e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0835  aminoglycoside phosphotransferase  39.94 
 
 
360 aa  205  9e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.407131  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3418  aminoglycoside phosphotransferase  33.63 
 
 
355 aa  202  8e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.949755  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2476  aminoglycoside phosphotransferase  40.29 
 
 
338 aa  200  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000012289  decreased coverage  0.00166754 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4576  aminoglycoside phosphotransferase  37.27 
 
 
357 aa  199  6e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1885  aminoglycoside phosphotransferase  37.07 
 
 
354 aa  199  6e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0182  aminoglycoside phosphotransferase  38.12 
 
 
339 aa  199  9e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  37.42 
 
 
348 aa  198  1.0000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2075  aminoglycoside phosphotransferase  32.66 
 
 
355 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0283964  normal  0.0813065 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2457  aminoglycoside phosphotransferase  33.24 
 
 
355 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00764802 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  39.03 
 
 
344 aa  197  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  37.17 
 
 
353 aa  197  3e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  42.46 
 
 
341 aa  197  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2724  hypothetical protein  34.13 
 
 
355 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  38.89 
 
 
338 aa  196  5.000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  40.73 
 
 
346 aa  195  9e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3925  aminoglycoside phosphotransferase  32.62 
 
 
355 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138496  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0471  aminoglycoside phosphotransferase  32.92 
 
 
403 aa  194  1e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  36.28 
 
 
338 aa  194  1e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4129  aminoglycoside phosphotransferase  37.76 
 
 
358 aa  194  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.682336  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  35.86 
 
 
364 aa  194  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  40.39 
 
 
348 aa  194  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  35.93 
 
 
359 aa  193  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2908  aminoglycoside phosphotransferase  39.55 
 
 
347 aa  193  4e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.1681 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1910  aminoglycoside phosphotransferase  32.31 
 
 
355 aa  193  4e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107516  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  40.4 
 
 
346 aa  192  5e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2397  aminoglycoside phosphotransferase  37.5 
 
 
362 aa  192  6e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2202  aminoglycoside phosphotransferase  35.55 
 
 
354 aa  192  8e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0249474  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1885  aminoglycoside phosphotransferase  39.14 
 
 
347 aa  191  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  37.34 
 
 
356 aa  191  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3467  hypothetical protein  33.33 
 
 
356 aa  190  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1847  aminoglycoside phosphotransferase  38.22 
 
 
362 aa  190  4e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.00532112 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3559  aminoglycoside phosphotransferase  32.71 
 
 
355 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595969  normal  0.25426 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2171  aminoglycoside phosphotransferase  38.22 
 
 
362 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0620475  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3209  aminoglycoside phosphotransferase  35.38 
 
 
391 aa  189  8e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79954  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  39.43 
 
 
358 aa  189  9e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  35.38 
 
 
352 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40880  hypothetical protein  33.33 
 
 
356 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1003  aminoglycoside phosphotransferase  45.97 
 
 
337 aa  187  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.083137  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3214  aminoglycoside phosphotransferase  31.5 
 
 
355 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.457678 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5523  aminoglycoside phosphotransferase  34.53 
 
 
354 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1007  aminoglycoside phosphotransferase  36.62 
 
 
358 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0370  aminoglycoside phosphotransferase  35.67 
 
 
345 aa  184  3e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.380981  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1186  aminoglycoside phosphotransferase  32.62 
 
 
429 aa  184  3e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.161649  normal  0.0723481 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  36.45 
 
 
352 aa  183  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  36.23 
 
 
345 aa  184  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1248  aminoglycoside phosphotransferase  33.23 
 
 
354 aa  183  4.0000000000000006e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.437649  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  33.9 
 
 
344 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2016  hypothetical protein  37.5 
 
 
358 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120817  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  31.2 
 
 
344 aa  182  7e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1393  aminoglycoside phosphotransferase  32.95 
 
 
363 aa  182  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  36.69 
 
 
315 aa  181  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0116  aminoglycoside phosphotransferase  35 
 
 
379 aa  181  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  37.7 
 
 
344 aa  181  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5046  aminoglycoside phosphotransferase  36.39 
 
 
342 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1018  aminoglycoside phosphotransferase  37.54 
 
 
358 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1368  aminoglycoside phosphotransferase  37.46 
 
 
368 aa  180  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544786  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2337  aminoglycoside phosphotransferase  33.75 
 
 
353 aa  178  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1459  aminoglycoside phosphotransferase  31.2 
 
 
354 aa  177  3e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.049097  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4490  aminoglycoside phosphotransferase  35.76 
 
 
344 aa  177  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0625  aminoglycoside phosphotransferase  35.24 
 
 
354 aa  176  7e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.149436 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3748  aminoglycoside phosphotransferase  36.64 
 
 
350 aa  175  9e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3736  aminoglycoside phosphotransferase  36.64 
 
 
350 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2216  aminoglycoside phosphotransferase  32.01 
 
 
355 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3809  aminoglycoside phosphotransferase  36.64 
 
 
350 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.274581 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3187  putative tyrosine protein kinase/aminoglycoside phosphotransferase  36.72 
 
 
368 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0972  aminoglycoside phosphotransferase  36.48 
 
 
358 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0454764 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4497  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.09 
 
 
815 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  33.63 
 
 
352 aa  173  3.9999999999999995e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  35.67 
 
 
343 aa  173  5e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0011  aminoglycoside phosphotransferase  34.59 
 
 
337 aa  172  5e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477677  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2450  aminoglycoside phosphotransferase  34.1 
 
 
343 aa  173  5e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0927  aminoglycoside phosphotransferase  33.11 
 
 
351 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.993496  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4201  aminoglycoside phosphotransferase  34.31 
 
 
343 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5350  aminoglycoside phosphotransferase  38.89 
 
 
338 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4969  aminoglycoside phosphotransferase  38.89 
 
 
338 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5057  aminoglycoside phosphotransferase  38.89 
 
 
338 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560893  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13793  acyl-CoA dehydrogenase fadE36  37.58 
 
 
351 aa  171  1e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.384329 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1706  aminoglycoside phosphotransferase  35.52 
 
 
355 aa  171  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.9599  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0618  putative phosphotransferase  35.28 
 
 
350 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172758  normal  0.0703036 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0861  aminoglycoside phosphotransferase  36.02 
 
 
354 aa  170  3e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.622757  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1831  aminoglycoside phosphotransferase  40.35 
 
 
451 aa  169  5e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0164  aminoglycoside phosphotransferase  34.02 
 
 
357 aa  169  6e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6405  aminoglycoside phosphotransferase  36.16 
 
 
343 aa  169  8e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>