210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0861 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0861  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
354 aa  717    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.622757  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0370  aminoglycoside phosphotransferase  41.57 
 
 
345 aa  229  7e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.380981  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3748  aminoglycoside phosphotransferase  41.96 
 
 
350 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2450  aminoglycoside phosphotransferase  41.01 
 
 
343 aa  226  4e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3736  aminoglycoside phosphotransferase  42.27 
 
 
350 aa  225  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3809  aminoglycoside phosphotransferase  42.27 
 
 
350 aa  225  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.274581 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4201  aminoglycoside phosphotransferase  40.06 
 
 
343 aa  224  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0618  putative phosphotransferase  40.71 
 
 
350 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172758  normal  0.0703036 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0097  aminoglycoside phosphotransferase  37.39 
 
 
340 aa  219  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.92974  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1885  aminoglycoside phosphotransferase  40.06 
 
 
354 aa  212  7e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2652  aminoglycoside phosphotransferase  40.57 
 
 
353 aa  208  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000355622  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2519  aminoglycoside phosphotransferase  39.77 
 
 
349 aa  193  3e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177703  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6361  aminoglycoside phosphotransferase  37.36 
 
 
342 aa  190  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00784596  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  39.87 
 
 
338 aa  181  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  38.24 
 
 
339 aa  180  4e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  37.06 
 
 
344 aa  179  5.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  39.74 
 
 
354 aa  178  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  36.07 
 
 
315 aa  173  5e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2903  aminoglycoside phosphotransferase  35.71 
 
 
353 aa  172  6.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  36.98 
 
 
338 aa  171  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0222  aminoglycoside phosphotransferase  36.02 
 
 
355 aa  170  3e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.193801  normal  0.0244768 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  36.06 
 
 
341 aa  170  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  38.54 
 
 
356 aa  167  4e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1805  aminoglycoside phosphotransferase  34.65 
 
 
354 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.726443  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1852  aminoglycoside phosphotransferase  34.65 
 
 
354 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.906902  normal  0.283402 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1786  aminoglycoside phosphotransferase  34.03 
 
 
354 aa  165  9e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0286679  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  33.43 
 
 
359 aa  163  5.0000000000000005e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  33.64 
 
 
348 aa  161  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7669  phosphotransferase family protein  35.56 
 
 
349 aa  159  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6405  aminoglycoside phosphotransferase  35.16 
 
 
343 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  32.18 
 
 
348 aa  158  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1035  aminoglycoside phosphotransferase  32.74 
 
 
353 aa  157  4e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  32.58 
 
 
344 aa  157  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  34.62 
 
 
359 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4318  aminoglycoside phosphotransferase  34.98 
 
 
350 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136216  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  36.16 
 
 
344 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2209  aminoglycoside phosphotransferase  33.03 
 
 
350 aa  156  6e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375246  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3218  aminoglycoside phosphotransferase  36.75 
 
 
343 aa  156  6e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2658  aminoglycoside phosphotransferase  36.81 
 
 
348 aa  155  7e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5019  aminoglycoside phosphotransferase  36.36 
 
 
343 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5078  aminoglycoside phosphotransferase  36.45 
 
 
357 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114652  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5841  aminoglycoside phosphotransferase  36.36 
 
 
343 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  35.57 
 
 
343 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1478  aminoglycoside phosphotransferase  35.02 
 
 
353 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2476  aminoglycoside phosphotransferase  39.29 
 
 
338 aa  153  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000012289  decreased coverage  0.00166754 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2075  aminoglycoside phosphotransferase  31.53 
 
 
355 aa  153  5e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0283964  normal  0.0813065 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4338  aminoglycoside phosphotransferase  36.36 
 
 
343 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1393  aminoglycoside phosphotransferase  30.35 
 
 
363 aa  152  8.999999999999999e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  35.04 
 
 
358 aa  151  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3038  aminoglycoside phosphotransferase  35.54 
 
 
343 aa  151  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145633  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0994  aminoglycoside phosphotransferase  32.14 
 
 
358 aa  150  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.739164  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2028  aminoglycoside phosphotransferase  34.2 
 
 
350 aa  151  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00704541  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4518  aminoglycoside phosphotransferase  35.35 
 
 
339 aa  151  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5980  aminoglycoside phosphotransferase  37 
 
 
353 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  36.84 
 
 
352 aa  150  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  36.25 
 
 
344 aa  150  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1314  phosphotransferase enzyme family protein  36.2 
 
 
368 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  36.03 
 
 
348 aa  150  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1323  phosphotransferase enzyme family protein  36.2 
 
 
368 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4490  aminoglycoside phosphotransferase  34.89 
 
 
344 aa  150  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1805  phosphotransferase enzyme family protein  36.2 
 
 
368 aa  150  4e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113334  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1460  phosphotransferase family protein  36.2 
 
 
368 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0437  phosphotransferase enzyme family protein  36.2 
 
 
368 aa  150  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1154  phosphotransferase enzyme family protein  36.2 
 
 
368 aa  150  4e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.119269  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0714  phosphotransferase enzyme family protein  36.2 
 
 
368 aa  150  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.701125  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  33.53 
 
 
345 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1007  aminoglycoside phosphotransferase  32.84 
 
 
358 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2064  aminoglycoside phosphotransferase  32.69 
 
 
361 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449993  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  35.12 
 
 
353 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1831  aminoglycoside phosphotransferase  37.58 
 
 
451 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  34.67 
 
 
352 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  33.43 
 
 
344 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0625  aminoglycoside phosphotransferase  33.54 
 
 
354 aa  146  4.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.149436 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1108  aminoglycoside phosphotransferase  35.76 
 
 
362 aa  147  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3559  aminoglycoside phosphotransferase  31.31 
 
 
355 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595969  normal  0.25426 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1559  aminoglycoside phosphotransferase  32.11 
 
 
344 aa  145  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5046  aminoglycoside phosphotransferase  34.83 
 
 
342 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3925  aminoglycoside phosphotransferase  31.21 
 
 
355 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138496  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1706  aminoglycoside phosphotransferase  32.08 
 
 
355 aa  144  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.9599  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3072  aminoglycoside phosphotransferase  32.4 
 
 
388 aa  144  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267154  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  34.77 
 
 
352 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3209  aminoglycoside phosphotransferase  33.12 
 
 
391 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79954  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  30.82 
 
 
364 aa  144  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 
356 aa  144  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2016  hypothetical protein  33.43 
 
 
358 aa  143  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120817  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5718  aminoglycoside phosphotransferase  35 
 
 
343 aa  143  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  32.35 
 
 
352 aa  142  8e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5287  aminoglycoside phosphotransferase  31.87 
 
 
353 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599023  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0972  aminoglycoside phosphotransferase  32.65 
 
 
358 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0454764 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1847  aminoglycoside phosphotransferase  32.74 
 
 
362 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.00532112 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1910  aminoglycoside phosphotransferase  30.6 
 
 
355 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107516  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2171  aminoglycoside phosphotransferase  32.74 
 
 
362 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0620475  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1018  aminoglycoside phosphotransferase  34.42 
 
 
358 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3187  putative tyrosine protein kinase/aminoglycoside phosphotransferase  33.7 
 
 
368 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2337  aminoglycoside phosphotransferase  32.55 
 
 
353 aa  140  4.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3214  aminoglycoside phosphotransferase  30.03 
 
 
355 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.457678 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3865  aminoglycoside phosphotransferase  33.43 
 
 
350 aa  139  7e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0767712  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1084  phosphotransferase enzyme family protein  33.92 
 
 
368 aa  138  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2514  aminoglycoside phosphotransferase  31.27 
 
 
365 aa  138  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6367  aminoglycoside phosphotransferase  32.21 
 
 
353 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>