222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4201 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2450  aminoglycoside phosphotransferase  91.25 
 
 
343 aa  645    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4201  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
343 aa  696    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3748  aminoglycoside phosphotransferase  89.05 
 
 
350 aa  616  1e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3736  aminoglycoside phosphotransferase  89.35 
 
 
350 aa  617  1e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3809  aminoglycoside phosphotransferase  89.35 
 
 
350 aa  617  1e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.274581 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0097  aminoglycoside phosphotransferase  72.78 
 
 
340 aa  523  1e-147  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.92974  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0861  aminoglycoside phosphotransferase  40.06 
 
 
354 aa  224  2e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.622757  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0618  putative phosphotransferase  40.38 
 
 
350 aa  222  6e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172758  normal  0.0703036 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2652  aminoglycoside phosphotransferase  42.81 
 
 
353 aa  212  7.999999999999999e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000355622  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1885  aminoglycoside phosphotransferase  35.54 
 
 
354 aa  211  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0370  aminoglycoside phosphotransferase  38.96 
 
 
345 aa  206  5e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.380981  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2519  aminoglycoside phosphotransferase  40.72 
 
 
349 aa  199  5e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177703  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6361  aminoglycoside phosphotransferase  40.38 
 
 
342 aa  192  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00784596  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4318  aminoglycoside phosphotransferase  39.24 
 
 
350 aa  188  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136216  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1559  aminoglycoside phosphotransferase  33.63 
 
 
344 aa  186  4e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1805  aminoglycoside phosphotransferase  38.89 
 
 
354 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.726443  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1852  aminoglycoside phosphotransferase  38.89 
 
 
354 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.906902  normal  0.283402 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1786  aminoglycoside phosphotransferase  38.89 
 
 
354 aa  182  6e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0286679  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2028  aminoglycoside phosphotransferase  37.7 
 
 
350 aa  182  7e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00704541  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7669  phosphotransferase family protein  37.46 
 
 
349 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0222  aminoglycoside phosphotransferase  34.31 
 
 
355 aa  172  6.999999999999999e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.193801  normal  0.0244768 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2903  aminoglycoside phosphotransferase  35.74 
 
 
353 aa  170  4e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  37.17 
 
 
339 aa  170  4e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2209  aminoglycoside phosphotransferase  33.77 
 
 
350 aa  170  4e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375246  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5980  aminoglycoside phosphotransferase  36.42 
 
 
353 aa  169  8e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1393  aminoglycoside phosphotransferase  30.95 
 
 
363 aa  167  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 
348 aa  167  2.9999999999999998e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  33.01 
 
 
348 aa  167  2.9999999999999998e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  36.6 
 
 
356 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  35.1 
 
 
315 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  35.54 
 
 
338 aa  163  4.0000000000000004e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  37.11 
 
 
344 aa  162  5.0000000000000005e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  33.56 
 
 
348 aa  160  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1459  aminoglycoside phosphotransferase  30.68 
 
 
354 aa  159  6e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.049097  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  36.39 
 
 
341 aa  159  8e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3559  aminoglycoside phosphotransferase  33.02 
 
 
355 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595969  normal  0.25426 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1108  aminoglycoside phosphotransferase  35.35 
 
 
362 aa  158  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3214  aminoglycoside phosphotransferase  31.55 
 
 
355 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.457678 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1035  aminoglycoside phosphotransferase  32.28 
 
 
353 aa  157  3e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0164  aminoglycoside phosphotransferase  31.95 
 
 
357 aa  157  4e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 
359 aa  156  4e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  34.69 
 
 
346 aa  156  6e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  35.74 
 
 
354 aa  155  7e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1186  aminoglycoside phosphotransferase  29.69 
 
 
429 aa  155  8e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.161649  normal  0.0723481 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3925  aminoglycoside phosphotransferase  32.18 
 
 
355 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138496  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  34.4 
 
 
346 aa  154  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  32.29 
 
 
344 aa  155  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  33.56 
 
 
358 aa  154  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  34.77 
 
 
338 aa  154  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4518  aminoglycoside phosphotransferase  33.76 
 
 
339 aa  151  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  33.86 
 
 
353 aa  150  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2075  aminoglycoside phosphotransferase  33.12 
 
 
355 aa  151  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0283964  normal  0.0813065 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  29.15 
 
 
344 aa  151  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2202  aminoglycoside phosphotransferase  29.51 
 
 
354 aa  151  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0249474  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4490  aminoglycoside phosphotransferase  32.88 
 
 
344 aa  150  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40880  hypothetical protein  32.17 
 
 
356 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1910  aminoglycoside phosphotransferase  31.23 
 
 
355 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107516  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2337  aminoglycoside phosphotransferase  31.56 
 
 
353 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3467  hypothetical protein  31.85 
 
 
356 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3418  aminoglycoside phosphotransferase  33.44 
 
 
355 aa  147  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.949755  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0471  aminoglycoside phosphotransferase  27.49 
 
 
403 aa  146  5e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2514  aminoglycoside phosphotransferase  32.1 
 
 
365 aa  145  9e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  27.87 
 
 
352 aa  145  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0182  aminoglycoside phosphotransferase  32.03 
 
 
339 aa  144  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0994  aminoglycoside phosphotransferase  30.29 
 
 
358 aa  144  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.739164  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2064  aminoglycoside phosphotransferase  31.25 
 
 
361 aa  144  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449993  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4576  aminoglycoside phosphotransferase  30.74 
 
 
357 aa  144  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  31.69 
 
 
344 aa  144  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1805  aminoglycoside phosphotransferase  29.15 
 
 
352 aa  142  7e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6405  aminoglycoside phosphotransferase  30.53 
 
 
343 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  30.48 
 
 
356 aa  141  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  29.62 
 
 
364 aa  141  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2397  aminoglycoside phosphotransferase  34.34 
 
 
362 aa  142  9.999999999999999e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2457  aminoglycoside phosphotransferase  29.65 
 
 
355 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00764802 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  30.79 
 
 
352 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5718  aminoglycoside phosphotransferase  31.13 
 
 
343 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2724  hypothetical protein  29.49 
 
 
355 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  29.07 
 
 
359 aa  140  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1007  aminoglycoside phosphotransferase  29.28 
 
 
358 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0927  aminoglycoside phosphotransferase  27.49 
 
 
351 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.993496  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0972  aminoglycoside phosphotransferase  30.03 
 
 
358 aa  138  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0454764 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2908  aminoglycoside phosphotransferase  31.75 
 
 
347 aa  137  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.1681 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2171  aminoglycoside phosphotransferase  29.19 
 
 
362 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0620475  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1847  aminoglycoside phosphotransferase  29.19 
 
 
362 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.00532112 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2476  aminoglycoside phosphotransferase  34.64 
 
 
338 aa  135  7.000000000000001e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000012289  decreased coverage  0.00166754 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4129  aminoglycoside phosphotransferase  31.31 
 
 
358 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.682336  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2016  hypothetical protein  30.25 
 
 
358 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120817  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3072  aminoglycoside phosphotransferase  29.84 
 
 
388 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267154  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0835  aminoglycoside phosphotransferase  33.55 
 
 
360 aa  134  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.407131  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5603  aminoglycoside phosphotransferase  33.87 
 
 
339 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.764833 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1018  aminoglycoside phosphotransferase  29.22 
 
 
358 aa  132  9e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3187  putative tyrosine protein kinase/aminoglycoside phosphotransferase  28.88 
 
 
368 aa  132  9e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5523  aminoglycoside phosphotransferase  29.07 
 
 
354 aa  132  9e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0116  aminoglycoside phosphotransferase  29.67 
 
 
379 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2216  aminoglycoside phosphotransferase  27.01 
 
 
355 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5078  aminoglycoside phosphotransferase  30.9 
 
 
357 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114652  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1944  aminoglycoside phosphotransferase  29.78 
 
 
361 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1885  aminoglycoside phosphotransferase  31.71 
 
 
347 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3038  aminoglycoside phosphotransferase  30.06 
 
 
343 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145633  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5046  aminoglycoside phosphotransferase  29.6 
 
 
342 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.895104 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>