242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2920 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
341 aa  674    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  61.86 
 
 
338 aa  416  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  63.69 
 
 
339 aa  404  1.0000000000000001e-112  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  62.61 
 
 
315 aa  380  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3865  aminoglycoside phosphotransferase  57.14 
 
 
350 aa  362  4e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0767712  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  60.06 
 
 
344 aa  362  6e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  58.73 
 
 
356 aa  354  1e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  57.7 
 
 
354 aa  347  1e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2476  aminoglycoside phosphotransferase  57.31 
 
 
338 aa  347  2e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000012289  decreased coverage  0.00166754 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  50.59 
 
 
338 aa  326  3e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1831  aminoglycoside phosphotransferase  53.5 
 
 
451 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5980  aminoglycoside phosphotransferase  51.88 
 
 
353 aa  303  4.0000000000000003e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  49.3 
 
 
359 aa  299  5e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1885  aminoglycoside phosphotransferase  49.09 
 
 
347 aa  291  1e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5603  aminoglycoside phosphotransferase  47.73 
 
 
339 aa  276  3e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.764833 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7669  phosphotransferase family protein  47.08 
 
 
349 aa  273  4.0000000000000004e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  49.84 
 
 
344 aa  271  1e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13793  acyl-CoA dehydrogenase fadE36  47.06 
 
 
351 aa  266  5.999999999999999e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.384329 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5350  aminoglycoside phosphotransferase  46.28 
 
 
338 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4969  aminoglycoside phosphotransferase  46.28 
 
 
338 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5057  aminoglycoside phosphotransferase  46.28 
 
 
338 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560893  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1204  aminoglycoside phosphotransferase  45.92 
 
 
340 aa  256  6e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4518  aminoglycoside phosphotransferase  44.27 
 
 
339 aa  249  5e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  42.99 
 
 
348 aa  240  2e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2337  aminoglycoside phosphotransferase  41.76 
 
 
353 aa  239  5.999999999999999e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  41.9 
 
 
348 aa  238  1e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2908  aminoglycoside phosphotransferase  44.27 
 
 
347 aa  237  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.1681 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1559  aminoglycoside phosphotransferase  40.12 
 
 
344 aa  236  5.0000000000000005e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18680  predicted aminoglycoside phosphotransferase  41.51 
 
 
357 aa  229  5e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.571289 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2064  aminoglycoside phosphotransferase  39.65 
 
 
361 aa  227  3e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449993  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  39.41 
 
 
356 aa  224  2e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2209  aminoglycoside phosphotransferase  39.69 
 
 
350 aa  220  3e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375246  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1393  aminoglycoside phosphotransferase  37.61 
 
 
363 aa  219  6e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2903  aminoglycoside phosphotransferase  40.4 
 
 
353 aa  218  1e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3209  aminoglycoside phosphotransferase  40.87 
 
 
391 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79954  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  40.94 
 
 
352 aa  215  7e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2658  aminoglycoside phosphotransferase  40.42 
 
 
348 aa  215  8e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2397  aminoglycoside phosphotransferase  42.61 
 
 
362 aa  214  9.999999999999999e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0164  aminoglycoside phosphotransferase  39.47 
 
 
357 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  35 
 
 
344 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0927  aminoglycoside phosphotransferase  34.43 
 
 
351 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.993496  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3072  aminoglycoside phosphotransferase  40.12 
 
 
388 aa  211  1e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267154  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  41.33 
 
 
352 aa  211  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1149  aminoglycoside phosphotransferase  39.42 
 
 
337 aa  211  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2075  aminoglycoside phosphotransferase  38.56 
 
 
355 aa  211  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0283964  normal  0.0813065 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  37.09 
 
 
345 aa  210  3e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  42.01 
 
 
348 aa  210  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3709  aminoglycoside phosphotransferase  40.18 
 
 
352 aa  210  4e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0994  aminoglycoside phosphotransferase  39.64 
 
 
358 aa  209  4e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.739164  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  40.74 
 
 
352 aa  209  6e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  39.27 
 
 
359 aa  208  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2519  aminoglycoside phosphotransferase  43.31 
 
 
349 aa  208  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177703  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3481  aminoglycoside phosphotransferase  38.34 
 
 
353 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0724682  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4129  aminoglycoside phosphotransferase  39.88 
 
 
358 aa  205  7e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.682336  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  37.39 
 
 
343 aa  205  9e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3418  aminoglycoside phosphotransferase  36.88 
 
 
355 aa  205  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.949755  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  37.69 
 
 
364 aa  204  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1805  aminoglycoside phosphotransferase  34.45 
 
 
352 aa  204  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5046  aminoglycoside phosphotransferase  37.91 
 
 
342 aa  203  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2202  aminoglycoside phosphotransferase  35.01 
 
 
354 aa  203  3e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0249474  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  34.86 
 
 
344 aa  203  4e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3559  aminoglycoside phosphotransferase  36.75 
 
 
355 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595969  normal  0.25426 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4576  aminoglycoside phosphotransferase  37.54 
 
 
357 aa  201  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  37.08 
 
 
358 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3925  aminoglycoside phosphotransferase  37.01 
 
 
355 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138496  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2724  hypothetical protein  35.42 
 
 
355 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0116  aminoglycoside phosphotransferase  38.14 
 
 
379 aa  199  6e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3038  aminoglycoside phosphotransferase  36.98 
 
 
343 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145633  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2457  aminoglycoside phosphotransferase  35.94 
 
 
355 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00764802 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  34.56 
 
 
352 aa  198  1.0000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1910  aminoglycoside phosphotransferase  36.42 
 
 
355 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107516  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5019  aminoglycoside phosphotransferase  36.98 
 
 
343 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5841  aminoglycoside phosphotransferase  36.98 
 
 
343 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0222  aminoglycoside phosphotransferase  42.46 
 
 
355 aa  197  3e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.193801  normal  0.0244768 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4338  aminoglycoside phosphotransferase  36.98 
 
 
343 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  40.35 
 
 
346 aa  196  6e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5523  aminoglycoside phosphotransferase  38.12 
 
 
354 aa  196  6e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0370  aminoglycoside phosphotransferase  37.86 
 
 
345 aa  195  8.000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.380981  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3214  aminoglycoside phosphotransferase  35.54 
 
 
355 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.457678 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0625  aminoglycoside phosphotransferase  38.02 
 
 
354 aa  195  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.149436 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5078  aminoglycoside phosphotransferase  37.35 
 
 
357 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114652  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3218  aminoglycoside phosphotransferase  37.35 
 
 
343 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4490  aminoglycoside phosphotransferase  37 
 
 
344 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40880  hypothetical protein  36.76 
 
 
356 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3467  hypothetical protein  36.76 
 
 
356 aa  193  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5718  aminoglycoside phosphotransferase  35.71 
 
 
343 aa  194  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  39.71 
 
 
346 aa  193  4e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1459  aminoglycoside phosphotransferase  36.7 
 
 
354 aa  192  5e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.049097  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1108  aminoglycoside phosphotransferase  39.1 
 
 
362 aa  192  8e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1035  aminoglycoside phosphotransferase  38.14 
 
 
353 aa  191  2e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0618  putative phosphotransferase  37.13 
 
 
350 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172758  normal  0.0703036 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4497  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.92 
 
 
815 aa  191  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6367  aminoglycoside phosphotransferase  37.5 
 
 
353 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0182  aminoglycoside phosphotransferase  38.59 
 
 
339 aa  190  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3327  aminoglycoside phosphotransferase  36.6 
 
 
361 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2514  aminoglycoside phosphotransferase  37.5 
 
 
365 aa  186  7e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  38.28 
 
 
344 aa  185  8e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6405  aminoglycoside phosphotransferase  35.45 
 
 
343 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5287  aminoglycoside phosphotransferase  36.61 
 
 
353 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599023  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1018  aminoglycoside phosphotransferase  37.54 
 
 
358 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>