240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1097 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
348 aa  709    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  77.87 
 
 
348 aa  560  1e-158  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2064  aminoglycoside phosphotransferase  55.74 
 
 
361 aa  412  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449993  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1393  aminoglycoside phosphotransferase  51.73 
 
 
363 aa  375  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3418  aminoglycoside phosphotransferase  48.44 
 
 
355 aa  358  9e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.949755  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2457  aminoglycoside phosphotransferase  48.28 
 
 
355 aa  353  2e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00764802 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2075  aminoglycoside phosphotransferase  49.12 
 
 
355 aa  352  8e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0283964  normal  0.0813065 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2724  hypothetical protein  47.03 
 
 
355 aa  351  1e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40880  hypothetical protein  49.86 
 
 
356 aa  348  8e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3467  hypothetical protein  49.58 
 
 
356 aa  345  5e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3559  aminoglycoside phosphotransferase  46.46 
 
 
355 aa  341  1e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595969  normal  0.25426 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2337  aminoglycoside phosphotransferase  49.72 
 
 
353 aa  341  1e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2202  aminoglycoside phosphotransferase  47.4 
 
 
354 aa  341  1e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0249474  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3214  aminoglycoside phosphotransferase  46.7 
 
 
355 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.457678 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1459  aminoglycoside phosphotransferase  46.89 
 
 
354 aa  332  7.000000000000001e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.049097  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3925  aminoglycoside phosphotransferase  45.61 
 
 
355 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138496  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1910  aminoglycoside phosphotransferase  45.33 
 
 
355 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107516  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0927  aminoglycoside phosphotransferase  45.38 
 
 
351 aa  325  1e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.993496  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1559  aminoglycoside phosphotransferase  46.99 
 
 
344 aa  321  9.999999999999999e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2397  aminoglycoside phosphotransferase  48.6 
 
 
362 aa  319  3.9999999999999996e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1805  aminoglycoside phosphotransferase  45.09 
 
 
352 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2209  aminoglycoside phosphotransferase  48.18 
 
 
350 aa  312  4.999999999999999e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375246  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2216  aminoglycoside phosphotransferase  43.06 
 
 
355 aa  312  4.999999999999999e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0634  aminoglycoside phosphotransferase  43.02 
 
 
370 aa  305  6e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1186  aminoglycoside phosphotransferase  45.82 
 
 
429 aa  304  1.0000000000000001e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.161649  normal  0.0723481 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01993  predicted aminoglycoside phosphotransferase  41.55 
 
 
380 aa  301  8.000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000191703  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0164  aminoglycoside phosphotransferase  45.66 
 
 
357 aa  298  8e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0471  aminoglycoside phosphotransferase  44 
 
 
403 aa  296  4e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0243  phosphotransferase enzyme family protein  45.95 
 
 
358 aa  295  7e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0279  phosphotransferase enzyme family protein  45.95 
 
 
358 aa  295  7e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.438432  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1426  phosphotransferase enzyme family protein  45.95 
 
 
358 aa  295  7e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1623  phosphotransferase enzyme family protein  45.95 
 
 
358 aa  295  7e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4576  aminoglycoside phosphotransferase  45.38 
 
 
357 aa  293  4e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2515  phosphotransferase enzyme family protein  45.66 
 
 
358 aa  292  5e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.538126  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2653  phosphotransferase enzyme family protein  45.66 
 
 
358 aa  291  9e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95808  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0521  phosphotransferase enzyme family protein  45.11 
 
 
358 aa  291  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.828343  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0946  phosphotransferase enzyme family protein  45.66 
 
 
876 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4129  aminoglycoside phosphotransferase  46.04 
 
 
358 aa  289  5.0000000000000004e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.682336  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0116  aminoglycoside phosphotransferase  45.69 
 
 
379 aa  286  4e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1248  aminoglycoside phosphotransferase  42.49 
 
 
354 aa  272  5.000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.437649  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  41.64 
 
 
354 aa  245  8e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  42.99 
 
 
341 aa  240  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  42.17 
 
 
356 aa  240  2e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4497  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.01 
 
 
815 aa  239  4e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  40.29 
 
 
359 aa  232  7.000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  42.09 
 
 
344 aa  227  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7669  phosphotransferase family protein  39.12 
 
 
349 aa  225  8e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  41.51 
 
 
339 aa  223  3e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  41.9 
 
 
344 aa  223  4e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1885  aminoglycoside phosphotransferase  39.68 
 
 
347 aa  221  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  38.99 
 
 
338 aa  220  3e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1108  aminoglycoside phosphotransferase  39.31 
 
 
362 aa  218  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5980  aminoglycoside phosphotransferase  40.33 
 
 
353 aa  215  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  39.34 
 
 
315 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  37.54 
 
 
338 aa  211  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2658  aminoglycoside phosphotransferase  37.69 
 
 
348 aa  210  3e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  34.96 
 
 
356 aa  209  5e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1035  aminoglycoside phosphotransferase  35.1 
 
 
353 aa  207  1e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2903  aminoglycoside phosphotransferase  38.29 
 
 
353 aa  207  2e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  34.62 
 
 
364 aa  206  4e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  36.76 
 
 
352 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  35.69 
 
 
353 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  35.85 
 
 
359 aa  201  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  38.19 
 
 
348 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3209  aminoglycoside phosphotransferase  36.62 
 
 
391 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79954  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2476  aminoglycoside phosphotransferase  37.13 
 
 
338 aa  200  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000012289  decreased coverage  0.00166754 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1478  aminoglycoside phosphotransferase  38.29 
 
 
353 aa  199  6e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  34.59 
 
 
352 aa  199  9e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3481  aminoglycoside phosphotransferase  36.83 
 
 
353 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0724682  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0222  aminoglycoside phosphotransferase  37.42 
 
 
355 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.193801  normal  0.0244768 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  38.83 
 
 
352 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  39.31 
 
 
343 aa  196  6e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  34.43 
 
 
358 aa  194  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1007  aminoglycoside phosphotransferase  35.83 
 
 
358 aa  193  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3709  aminoglycoside phosphotransferase  35.99 
 
 
352 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6405  aminoglycoside phosphotransferase  38.78 
 
 
343 aa  193  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2908  aminoglycoside phosphotransferase  36.86 
 
 
347 aa  192  5e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.1681 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2519  aminoglycoside phosphotransferase  34.83 
 
 
349 aa  192  8e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177703  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0994  aminoglycoside phosphotransferase  34.39 
 
 
358 aa  192  9e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.739164  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0972  aminoglycoside phosphotransferase  35.11 
 
 
358 aa  192  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0454764 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0835  aminoglycoside phosphotransferase  40 
 
 
360 aa  191  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.407131  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  34.71 
 
 
345 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  32.94 
 
 
344 aa  189  5e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6367  aminoglycoside phosphotransferase  34.78 
 
 
353 aa  189  8e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5287  aminoglycoside phosphotransferase  35.07 
 
 
353 aa  189  8e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599023  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1847  aminoglycoside phosphotransferase  33.86 
 
 
362 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.00532112 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5046  aminoglycoside phosphotransferase  38.22 
 
 
342 aa  188  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2171  aminoglycoside phosphotransferase  33.86 
 
 
362 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0620475  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0625  aminoglycoside phosphotransferase  34.26 
 
 
354 aa  187  3e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.149436 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4490  aminoglycoside phosphotransferase  35.99 
 
 
344 aa  187  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1653  aminoglycoside phosphotransferase  37.69 
 
 
377 aa  187  3e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.793508  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1706  aminoglycoside phosphotransferase  36.23 
 
 
355 aa  186  6e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.9599  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2810  aminoglycoside phosphotransferase  34.81 
 
 
336 aa  184  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541387  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  36.02 
 
 
344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1368  aminoglycoside phosphotransferase  34.28 
 
 
368 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544786  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2016  hypothetical protein  34.27 
 
 
358 aa  183  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120817  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0182  aminoglycoside phosphotransferase  34.11 
 
 
339 aa  182  6e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3038  aminoglycoside phosphotransferase  37.27 
 
 
343 aa  182  7e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145633  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3865  aminoglycoside phosphotransferase  36.45 
 
 
350 aa  182  7e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0767712  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3218  aminoglycoside phosphotransferase  37.89 
 
 
343 aa  182  7e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>