227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3865 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3865  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 350 aa  699    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0767712  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  57.77 
 
 		 338 aa  364  1e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  58.53 
 
 		 339 aa  363  3e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  57.14 
 
 		 341 aa  362  4e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  54.55 
 
 		 338 aa  353  2e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2476  aminoglycoside phosphotransferase  58.31 
 
 		 338 aa  325  5e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000012289  decreased coverage  0.00166754 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1831  aminoglycoside phosphotransferase  53.49 
 
 		 451 aa  319  5e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  52.05 
 
 		 354 aa  306  4.0000000000000004e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  51.17 
 
 		 344 aa  295  8e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  50.44 
 
 		 356 aa  292  5e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  50.89 
 
 		 315 aa  291  1e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1885  aminoglycoside phosphotransferase  48.39 
 
 		 347 aa  271  1e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  47.86 
 
 		 359 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7669  phosphotransferase family protein  47.48 
 
 		 349 aa  248  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4969  aminoglycoside phosphotransferase  47.08 
 
 		 338 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5350  aminoglycoside phosphotransferase  47.08 
 
 		 338 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5057  aminoglycoside phosphotransferase  47.08 
 
 		 338 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5980  aminoglycoside phosphotransferase  45.62 
 
 		 353 aa  246  6e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1204  aminoglycoside phosphotransferase  46.26 
 
 		 340 aa  242  7e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5603  aminoglycoside phosphotransferase  46.13 
 
 		 339 aa  239  4e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764833 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4518  aminoglycoside phosphotransferase  44.58 
 
 		 339 aa  239  5e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13793  acyl-CoA dehydrogenase fadE36  43.06 
 
 		 351 aa  233  3e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.384329 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  47.24 
 
 		 344 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2337  aminoglycoside phosphotransferase  41.95 
 
 		 353 aa  194  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  35.05 
 
 		 344 aa  194  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18680  predicted aminoglycoside phosphotransferase  38.96 
 
 		 357 aa  194  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.571289 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0164  aminoglycoside phosphotransferase  39.12 
 
 		 357 aa  194  3e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  39.77 
 
 		 348 aa  191  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2075  aminoglycoside phosphotransferase  35.47 
 
 		 355 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0283964  normal  0.0813065 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1459  aminoglycoside phosphotransferase  36.16 
 
 		 354 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.049097  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1559  aminoglycoside phosphotransferase  35.42 
 
 		 344 aa  188  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0927  aminoglycoside phosphotransferase  36.48 
 
 		 351 aa  188  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.993496  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  36.59 
 
 		 348 aa  188  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  38.8 
 
 		 356 aa  187  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  39.14 
 
 		 344 aa  186  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4490  aminoglycoside phosphotransferase  39.45 
 
 		 344 aa  186  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1805  aminoglycoside phosphotransferase  35.74 
 
 		 352 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2209  aminoglycoside phosphotransferase  36.72 
 
 		 350 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375246  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  36.45 
 
 		 348 aa  182  7e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2519  aminoglycoside phosphotransferase  40.34 
 
 		 349 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  32.95 
 
 		 345 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3559  aminoglycoside phosphotransferase  36.06 
 
 		 355 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595969  normal  0.25426 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3418  aminoglycoside phosphotransferase  35.99 
 
 		 355 aa  177  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.949755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1018  aminoglycoside phosphotransferase  37.66 
 
 		 358 aa  177  3e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2908  aminoglycoside phosphotransferase  38.66 
 
 		 347 aa  176  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.1681 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1393  aminoglycoside phosphotransferase  34.48 
 
 		 363 aa  176  4e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  37.81 
 
 		 346 aa  176  4e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3925  aminoglycoside phosphotransferase  35.1 
 
 		 355 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138496  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3286  aminoglycoside phosphotransferase  35.22 
 
 		 361 aa  176  5e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  32.17 
 
 		 352 aa  175  9e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1035  aminoglycoside phosphotransferase  39.46 
 
 		 353 aa  175  9.999999999999999e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  36.79 
 
 		 346 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3214  aminoglycoside phosphotransferase  35.4 
 
 		 355 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.457678 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  31.69 
 
 		 344 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5046  aminoglycoside phosphotransferase  34.85 
 
 		 342 aa  173  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2903  aminoglycoside phosphotransferase  40.57 
 
 		 353 aa  172  5.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  36.06 
 
 		 343 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2457  aminoglycoside phosphotransferase  34.62 
 
 		 355 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00764802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0116  aminoglycoside phosphotransferase  36.01 
 
 		 379 aa  171  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  36.57 
 
 		 352 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  35.22 
 
 		 352 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3327  aminoglycoside phosphotransferase  34.03 
 
 		 361 aa  171  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4576  aminoglycoside phosphotransferase  37.7 
 
 		 357 aa  171  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1910  aminoglycoside phosphotransferase  34.81 
 
 		 355 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2658  aminoglycoside phosphotransferase  36.56 
 
 		 348 aa  171  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2171  aminoglycoside phosphotransferase  35.24 
 
 		 362 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0620475  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1847  aminoglycoside phosphotransferase  35.24 
 
 		 362 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.00532112 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2724  hypothetical protein  35.76 
 
 		 355 aa  170  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40880  hypothetical protein  36.62 
 
 		 356 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2064  aminoglycoside phosphotransferase  36.79 
 
 		 361 aa  170  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3467  hypothetical protein  36.62 
 
 		 356 aa  170  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1007  aminoglycoside phosphotransferase  35.96 
 
 		 358 aa  169  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3209  aminoglycoside phosphotransferase  34.23 
 
 		 391 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  33.54 
 
 		 364 aa  169  8e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2016  hypothetical protein  36.51 
 
 		 358 aa  168  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120817  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2397  aminoglycoside phosphotransferase  37.06 
 
 		 362 aa  168  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  37.7 
 
 		 352 aa  168  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0972  aminoglycoside phosphotransferase  34.6 
 
 		 358 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0454764 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2202  aminoglycoside phosphotransferase  34.34 
 
 		 354 aa  167  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0249474  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2514  aminoglycoside phosphotransferase  37.07 
 
 		 365 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0222  aminoglycoside phosphotransferase  39.8 
 
 		 355 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.193801  normal  0.0244768 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  37.16 
 
 		 359 aa  164  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1149  aminoglycoside phosphotransferase  38.16 
 
 		 337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  36.77 
 
 		 353 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3481  aminoglycoside phosphotransferase  36.08 
 
 		 353 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0724682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1003  aminoglycoside phosphotransferase  40.39 
 
 		 337 aa  164  3e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.083137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0182  aminoglycoside phosphotransferase  36.9 
 
 		 339 aa  164  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  37.58 
 
 		 358 aa  163  4.0000000000000004e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1944  aminoglycoside phosphotransferase  34.91 
 
 		 361 aa  162  6e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0994  aminoglycoside phosphotransferase  34.6 
 
 		 358 aa  162  7e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.739164  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3218  aminoglycoside phosphotransferase  34.86 
 
 		 343 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3076  aminoglycoside phosphotransferase  34.91 
 
 		 361 aa  162  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.986116  normal  0.214027 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1778  aminoglycoside phosphotransferase  34.91 
 
 		 361 aa  161  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.221845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4338  aminoglycoside phosphotransferase  33.94 
 
 		 343 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2960  aminoglycoside phosphotransferase  35.39 
 
 		 363 aa  161  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5019  aminoglycoside phosphotransferase  33.94 
 
 		 343 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5841  aminoglycoside phosphotransferase  33.94 
 
 		 343 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1368  aminoglycoside phosphotransferase  34.6 
 
 		 368 aa  160  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544786  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1912  aminoglycoside phosphotransferase  33.65 
 
 		 363 aa  159  6e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.143156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6405  aminoglycoside phosphotransferase  32.74 
 
 		 343 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>