238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1778 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_3286  aminoglycoside phosphotransferase  83.66 
 
 
361 aa  644    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1944  aminoglycoside phosphotransferase  98.89 
 
 
361 aa  744    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1778  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
361 aa  750    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.221845  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3076  aminoglycoside phosphotransferase  78.06 
 
 
361 aa  604  9.999999999999999e-173  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.986116  normal  0.214027 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4307  aminoglycoside phosphotransferase  80.78 
 
 
362 aa  602  1.0000000000000001e-171  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0855792  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3327  aminoglycoside phosphotransferase  75.62 
 
 
361 aa  586  1e-166  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2629  aminoglycoside phosphotransferase  76.16 
 
 
368 aa  587  1e-166  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0566206  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1912  aminoglycoside phosphotransferase  74.79 
 
 
363 aa  573  1.0000000000000001e-162  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.143156  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2960  aminoglycoside phosphotransferase  75.07 
 
 
363 aa  565  1e-160  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3187  putative tyrosine protein kinase/aminoglycoside phosphotransferase  74.02 
 
 
368 aa  550  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1847  aminoglycoside phosphotransferase  72.14 
 
 
362 aa  545  1e-154  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.00532112 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2171  aminoglycoside phosphotransferase  71.94 
 
 
362 aa  543  1e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0620475  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1368  aminoglycoside phosphotransferase  72.63 
 
 
368 aa  543  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544786  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2016  hypothetical protein  71.31 
 
 
358 aa  528  1e-149  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120817  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1007  aminoglycoside phosphotransferase  70.83 
 
 
358 aa  529  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0972  aminoglycoside phosphotransferase  70.56 
 
 
358 aa  526  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0454764 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1952  hypothetical protein  70.51 
 
 
363 aa  522  1e-147  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.126845 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1986  aminoglycoside phosphotransferase  70.47 
 
 
368 aa  518  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1084  phosphotransferase enzyme family protein  69.17 
 
 
368 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1805  phosphotransferase enzyme family protein  69.53 
 
 
368 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113334  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1460  phosphotransferase family protein  69.53 
 
 
368 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0437  phosphotransferase enzyme family protein  69.53 
 
 
368 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1314  phosphotransferase enzyme family protein  69.53 
 
 
368 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1323  phosphotransferase enzyme family protein  69.25 
 
 
368 aa  502  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0714  phosphotransferase enzyme family protein  69.53 
 
 
368 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.701125  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1154  phosphotransferase enzyme family protein  69.53 
 
 
368 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.119269  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0625  aminoglycoside phosphotransferase  54.9 
 
 
354 aa  413  1e-114  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.149436 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  55.43 
 
 
364 aa  412  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  58.7 
 
 
346 aa  393  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  58.11 
 
 
346 aa  390  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  53.5 
 
 
352 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  54.34 
 
 
352 aa  386  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3709  aminoglycoside phosphotransferase  53.76 
 
 
352 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3209  aminoglycoside phosphotransferase  53.22 
 
 
391 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79954  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  54.8 
 
 
359 aa  382  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  53.71 
 
 
345 aa  377  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6367  aminoglycoside phosphotransferase  52.35 
 
 
353 aa  372  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5287  aminoglycoside phosphotransferase  52.35 
 
 
353 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599023  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0994  aminoglycoside phosphotransferase  52.96 
 
 
358 aa  370  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.739164  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1706  aminoglycoside phosphotransferase  55.49 
 
 
355 aa  369  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.9599  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3481  aminoglycoside phosphotransferase  51.82 
 
 
353 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0724682  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5523  aminoglycoside phosphotransferase  55.97 
 
 
354 aa  365  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1478  aminoglycoside phosphotransferase  53.58 
 
 
353 aa  364  1e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0011  aminoglycoside phosphotransferase  53.09 
 
 
337 aa  360  2e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477677  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  50.29 
 
 
352 aa  359  3e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  51.03 
 
 
344 aa  359  5e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3072  aminoglycoside phosphotransferase  50.84 
 
 
388 aa  355  5.999999999999999e-97  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267154  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  50.6 
 
 
344 aa  352  5e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4490  aminoglycoside phosphotransferase  50.86 
 
 
344 aa  348  1e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  48.86 
 
 
344 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  48.31 
 
 
356 aa  336  2.9999999999999997e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2658  aminoglycoside phosphotransferase  50.29 
 
 
348 aa  331  1e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  50.14 
 
 
352 aa  330  3e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5019  aminoglycoside phosphotransferase  51.04 
 
 
343 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5841  aminoglycoside phosphotransferase  51.04 
 
 
343 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4338  aminoglycoside phosphotransferase  51.04 
 
 
343 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5078  aminoglycoside phosphotransferase  50.45 
 
 
357 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114652  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3218  aminoglycoside phosphotransferase  49.85 
 
 
343 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  47.55 
 
 
353 aa  325  8.000000000000001e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3038  aminoglycoside phosphotransferase  49.85 
 
 
343 aa  323  2e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145633  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5046  aminoglycoside phosphotransferase  48.99 
 
 
342 aa  322  4e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  49.85 
 
 
343 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6405  aminoglycoside phosphotransferase  47.81 
 
 
343 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0182  aminoglycoside phosphotransferase  50.32 
 
 
339 aa  305  5.0000000000000004e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1018  aminoglycoside phosphotransferase  46.45 
 
 
358 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5718  aminoglycoside phosphotransferase  46.38 
 
 
343 aa  300  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2810  aminoglycoside phosphotransferase  47.45 
 
 
336 aa  286  2.9999999999999996e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541387  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  44.97 
 
 
358 aa  286  4e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44815  predicted protein  41.8 
 
 
401 aa  244  9.999999999999999e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1003  aminoglycoside phosphotransferase  47.74 
 
 
337 aa  240  2e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.083137  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03575  conserved hypothetical protein  38.63 
 
 
382 aa  231  1e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000000000417881  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00272  Phosphotransferase enzyme family domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G02880)  36.83 
 
 
364 aa  231  2e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0403488 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  37.83 
 
 
338 aa  207  2e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7669  phosphotransferase family protein  36.25 
 
 
349 aa  206  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  40.64 
 
 
339 aa  205  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40103  predicted protein  43.82 
 
 
264 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5980  aminoglycoside phosphotransferase  41.12 
 
 
353 aa  199  9e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  37.98 
 
 
338 aa  193  4e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  37.93 
 
 
344 aa  193  4e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33361  protein serine/threonine kinase activity  32.73 
 
 
408 aa  187  2e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.814262 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  35.58 
 
 
359 aa  186  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3418  aminoglycoside phosphotransferase  34.38 
 
 
355 aa  182  7e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.949755  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  38.23 
 
 
356 aa  181  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1831  aminoglycoside phosphotransferase  34.77 
 
 
451 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4576  aminoglycoside phosphotransferase  36.18 
 
 
357 aa  179  9e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  37.91 
 
 
344 aa  177  3e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2457  aminoglycoside phosphotransferase  33.52 
 
 
355 aa  176  7e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00764802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  37 
 
 
348 aa  175  9e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  36.96 
 
 
354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13793  acyl-CoA dehydrogenase fadE36  35.59 
 
 
351 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.384329 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40880  hypothetical protein  32.39 
 
 
356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2075  aminoglycoside phosphotransferase  34.46 
 
 
355 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0283964  normal  0.0813065 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 
348 aa  173  5e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2216  aminoglycoside phosphotransferase  33.14 
 
 
355 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3559  aminoglycoside phosphotransferase  32.6 
 
 
355 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595969  normal  0.25426 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3925  aminoglycoside phosphotransferase  32.78 
 
 
355 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138496  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1885  aminoglycoside phosphotransferase  34.32 
 
 
347 aa  170  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1910  aminoglycoside phosphotransferase  32.78 
 
 
355 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107516  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  35.06 
 
 
341 aa  170  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3467  hypothetical protein  31.04 
 
 
356 aa  169  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>