208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1860 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1860  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 447 aa  884    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.257775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0281  aminoglycoside phosphotransferase  52.82 
 
 		 443 aa  375  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1863  aminoglycoside phosphotransferase  44.37 
 
 		 329 aa  236  8e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0353182  normal  0.189268 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3076  aminoglycoside phosphotransferase  40.8 
 
 		 337 aa  231  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.422792  normal  0.609725 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2919  hypothetical protein  43.87 
 
 		 316 aa  223  6e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.695501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2913  aminoglycoside phosphotransferase  43.47 
 
 		 325 aa  221  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.605881  normal  0.0304684 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1959  aminoglycoside phosphotransferase  43.13 
 
 		 331 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3604  aminoglycoside phosphotransferase  41.1 
 
 		 331 aa  219  7e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3517  aminoglycoside phosphotransferase  44.84 
 
 		 334 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2483  aminoglycoside phosphotransferase  41.27 
 
 		 323 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0370489  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4469  aminoglycoside phosphotransferase  35.76 
 
 		 323 aa  169  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00940393 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1585  aminoglycoside phosphotransferase  35.91 
 
 		 319 aa  160  5e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1609  aminoglycoside phosphotransferase  35.91 
 
 		 319 aa  160  5e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4452  aminoglycoside phosphotransferase  35.51 
 
 		 346 aa  160  6e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.744873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4584  aminoglycoside phosphotransferase  33.08 
 
 		 475 aa  157  5.0000000000000005e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1555  aminoglycoside phosphotransferase  35.6 
 
 		 319 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200581  normal  0.346641 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5527  putative aminoglycoside phosphotransferase  33.23 
 
 		 311 aa  152  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1891  aminoglycoside phosphotransferase  33.62 
 
 		 350 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3968  aminoglycoside phosphotransferase  38.99 
 
 		 332 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.574254  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35990  FadE36, aminoglycoside phosphotransferase  33.02 
 
 		 398 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.139022  hitchhiker  0.0000000000000200155 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2791  aminoglycoside phosphotransferase  33.04 
 
 		 376 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2501  aminoglycoside phosphotransferase  29.69 
 
 		 346 aa  94  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113216 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0894  aminoglycoside phosphotransferase  38.41 
 
 		 459 aa  84  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.184458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4407  aminoglycoside phosphotransferase  30.04 
 
 		 340 aa  82  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.219591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0011  aminoglycoside phosphotransferase  26.67 
 
 		 337 aa  80.9  0.00000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477677  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  26.01 
 
 		 344 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  29.12 
 
 		 346 aa  75.5  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  29.12 
 
 		 346 aa  75.5  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1505  aminoglycoside phosphotransferase  29.11 
 
 		 358 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.290971  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1528  aminoglycoside phosphotransferase  29.11 
 
 		 358 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1505  aminoglycoside phosphotransferase  28.91 
 
 		 357 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  25.42 
 
 		 352 aa  68.9  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0284  putative aminoglycoside phosphotransferase  28.97 
 
 		 351 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.846831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2920  hypothetical protein  38.05 
 
 		 128 aa  67.8  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5523  aminoglycoside phosphotransferase  25.32 
 
 		 354 aa  67  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4490  aminoglycoside phosphotransferase  27.55 
 
 		 344 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  28.2 
 
 		 344 aa  64.3  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3076  aminoglycoside phosphotransferase  26.88 
 
 		 361 aa  63.9  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.986116  normal  0.214027 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2016  hypothetical protein  31.43 
 
 		 358 aa  63.5  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120817  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2050  aminoglycoside phosphotransferase  26.95 
 
 		 450 aa  63.5  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.299693  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  26.1 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  27.13 
 
 		 344 aa  61.2  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1952  hypothetical protein  35.97 
 
 		 363 aa  61.2  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.126845 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  30 
 
 		 348 aa  61.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4604  aminoglycoside phosphotransferase  30.92 
 
 		 381 aa  60.5  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.882822  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  24.03 
 
 		 356 aa  60.1  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0994  aminoglycoside phosphotransferase  27.59 
 
 		 358 aa  60.1  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.739164  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2171  aminoglycoside phosphotransferase  29.14 
 
 		 362 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0620475  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3187  putative tyrosine protein kinase/aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 		 368 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1847  aminoglycoside phosphotransferase  29.14 
 
 		 362 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.00532112 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6367  aminoglycoside phosphotransferase  27.94 
 
 		 353 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1035  aminoglycoside phosphotransferase  29.07 
 
 		 353 aa  59.3  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  25.94 
 
 		 364 aa  58.5  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1007  aminoglycoside phosphotransferase  30.86 
 
 		 358 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2683  aminoglycoside phosphotransferase-like protein  31.09 
 
 		 372 aa  58.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.124499  normal  0.283498 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3603  hypothetical protein  32.74 
 
 		 135 aa  57.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.481966  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0972  aminoglycoside phosphotransferase  24.12 
 
 		 358 aa  57.8  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0454764 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3075  hypothetical protein  31.25 
 
 		 127 aa  57.8  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.168163  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5287  aminoglycoside phosphotransferase  26.96 
 
 		 353 aa  57.4  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599023  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1960  hypothetical protein  35.4 
 
 		 126 aa  57  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1323  phosphotransferase enzyme family protein  29.6 
 
 		 368 aa  57  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0182  aminoglycoside phosphotransferase  41.94 
 
 		 339 aa  57  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1864  hypothetical protein  35.09 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0703562  normal  0.174095 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2629  aminoglycoside phosphotransferase  37.89 
 
 		 368 aa  56.6  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0566206  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1108  aminoglycoside phosphotransferase  29.89 
 
 		 362 aa  56.6  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1805  phosphotransferase enzyme family protein  29.6 
 
 		 368 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113334  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5718  aminoglycoside phosphotransferase  42.48 
 
 		 343 aa  56.6  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1460  phosphotransferase family protein  29.6 
 
 		 368 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0835  aminoglycoside phosphotransferase  30.77 
 
 		 360 aa  56.6  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.407131  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1154  phosphotransferase enzyme family protein  29.6 
 
 		 368 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.119269  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0714  phosphotransferase enzyme family protein  29.6 
 
 		 368 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.701125  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0437  phosphotransferase enzyme family protein  29.6 
 
 		 368 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  47.95 
 
 		 338 aa  56.2  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1084  phosphotransferase enzyme family protein  27.15 
 
 		 368 aa  56.2  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4497  aminoglycoside phosphotransferase  30.92 
 
 		 382 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.609901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  30 
 
 		 352 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1003  aminoglycoside phosphotransferase  29.75 
 
 		 337 aa  55.8  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.083137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4307  aminoglycoside phosphotransferase  25.63 
 
 		 362 aa  55.8  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0855792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1314  phosphotransferase enzyme family protein  29.28 
 
 		 368 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2810  aminoglycoside phosphotransferase  44.21 
 
 		 336 aa  54.7  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3590  aminoglycoside phosphotransferase  35.05 
 
 		 370 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13189  hypothetical protein  26.91 
 
 		 378 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.23318 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3636  aminoglycoside phosphotransferase  26.07 
 
 		 375 aa  54.7  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  24.57 
 
 		 353 aa  54.7  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1368  aminoglycoside phosphotransferase  33.91 
 
 		 368 aa  54.7  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544786  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0097  aminoglycoside phosphotransferase  28.98 
 
 		 340 aa  54.3  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.92974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4576  aminoglycoside phosphotransferase  28.25 
 
 		 357 aa  54.3  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18680  predicted aminoglycoside phosphotransferase  32.37 
 
 		 357 aa  54.3  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.571289 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1459  aminoglycoside phosphotransferase  28.22 
 
 		 354 aa  53.9  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.049097  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1186  aminoglycoside phosphotransferase  22.77 
 
 		 429 aa  54.3  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.161649  normal  0.0723481 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0370  aminoglycoside phosphotransferase  38.04 
 
 		 345 aa  53.9  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.380981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1869  aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 		 378 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0573919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1986  aminoglycoside phosphotransferase  27.14 
 
 		 368 aa  53.9  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  37.61 
 
 		 341 aa  53.9  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3970  hypothetical protein  39.25 
 
 		 116 aa  53.5  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.497278  normal  0.256817 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1018  aminoglycoside phosphotransferase  34.65 
 
 		 358 aa  53.5  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  32.12 
 
 		 358 aa  53.5  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1944  aminoglycoside phosphotransferase  35.54 
 
 		 361 aa  53.1  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4570  aminoglycoside phosphotransferase  25.46 
 
 		 362 aa  53.1  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.303984  normal  0.410057 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1778  aminoglycoside phosphotransferase  35.54 
 
 		 361 aa  53.1  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.221845  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>