212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4570 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4570  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 362 aa  707    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.303984  normal  0.410057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1901  aminoglycoside phosphotransferase  40.68 
 
 		 327 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.05669  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1947  aminoglycoside phosphotransferase  40.68 
 
 		 327 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1881  aminoglycoside phosphotransferase  40.88 
 
 		 327 aa  199  7e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.465558  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17900  predicted aminoglycoside phosphotransferase  34.44 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.215694  normal  0.505418 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3590  aminoglycoside phosphotransferase  37.38 
 
 		 370 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5980  aminoglycoside phosphotransferase  33.64 
 
 		 353 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  33.63 
 
 		 339 aa  104  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  34.87 
 
 		 348 aa  103  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  30.03 
 
 		 344 aa  99  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5350  aminoglycoside phosphotransferase  32.08 
 
 		 338 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4969  aminoglycoside phosphotransferase  32.08 
 
 		 338 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5057  aminoglycoside phosphotransferase  32.08 
 
 		 338 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1204  aminoglycoside phosphotransferase  32.7 
 
 		 340 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13793  acyl-CoA dehydrogenase fadE36  32.7 
 
 		 351 aa  92.8  8e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.384329 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0994  aminoglycoside phosphotransferase  29 
 
 		 358 aa  92.8  9e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.739164  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2810  aminoglycoside phosphotransferase  30.54 
 
 		 336 aa  92.4  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5603  aminoglycoside phosphotransferase  32.38 
 
 		 339 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764833 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  28.62 
 
 		 352 aa  90.1  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  29.72 
 
 		 344 aa  89.7  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6367  aminoglycoside phosphotransferase  32.17 
 
 		 353 aa  88.6  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  30.8 
 
 		 315 aa  88.2  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  33.75 
 
 		 354 aa  88.2  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  34.42 
 
 		 356 aa  87  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  31.63 
 
 		 341 aa  86.7  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5287  aminoglycoside phosphotransferase  31.85 
 
 		 353 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599023  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3209  aminoglycoside phosphotransferase  29.02 
 
 		 391 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  30.28 
 
 		 338 aa  85.9  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  28.71 
 
 		 356 aa  85.9  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2209  aminoglycoside phosphotransferase  31.66 
 
 		 350 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375246  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4129  aminoglycoside phosphotransferase  29.28 
 
 		 358 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.682336  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  29.9 
 
 		 352 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0116  aminoglycoside phosphotransferase  26.14 
 
 		 379 aa  83.6  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7669  phosphotransferase family protein  29.94 
 
 		 349 aa  83.2  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18680  predicted aminoglycoside phosphotransferase  30.15 
 
 		 357 aa  83.2  0.000000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.571289 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4518  aminoglycoside phosphotransferase  30.67 
 
 		 339 aa  82.8  0.000000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  29.49 
 
 		 352 aa  82  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6405  aminoglycoside phosphotransferase  29.1 
 
 		 343 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  32.11 
 
 		 359 aa  82.8  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3748  aminoglycoside phosphotransferase  28.35 
 
 		 350 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1108  aminoglycoside phosphotransferase  29.59 
 
 		 362 aa  81.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2514  aminoglycoside phosphotransferase  29.91 
 
 		 365 aa  81.3  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1885  aminoglycoside phosphotransferase  30.56 
 
 		 347 aa  80.1  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4584  aminoglycoside phosphotransferase  30.56 
 
 		 475 aa  79.3  0.00000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3736  aminoglycoside phosphotransferase  28.39 
 
 		 350 aa  79.3  0.00000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3809  aminoglycoside phosphotransferase  28.39 
 
 		 350 aa  79.3  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.274581 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1559  aminoglycoside phosphotransferase  26.82 
 
 		 344 aa  79  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2450  aminoglycoside phosphotransferase  27.85 
 
 		 343 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2658  aminoglycoside phosphotransferase  28.62 
 
 		 348 aa  78.6  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4201  aminoglycoside phosphotransferase  28.53 
 
 		 343 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2010  aminoglycoside phosphotransferase  30.36 
 
 		 367 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0773583  normal  0.266634 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4338  aminoglycoside phosphotransferase  28.24 
 
 		 343 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0618  putative phosphotransferase  28.85 
 
 		 350 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172758  normal  0.0703036 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  28.67 
 
 		 359 aa  77.4  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5019  aminoglycoside phosphotransferase  28.82 
 
 		 343 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2027  aminoglycoside phosphotransferase  30.36 
 
 		 366 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2476  aminoglycoside phosphotransferase  31.4 
 
 		 338 aa  77.4  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000012289  decreased coverage  0.00166754 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5841  aminoglycoside phosphotransferase  28.82 
 
 		 343 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2073  aminoglycoside phosphotransferase  30.36 
 
 		 366 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5718  aminoglycoside phosphotransferase  29.39 
 
 		 343 aa  77  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0222  aminoglycoside phosphotransferase  30 
 
 		 355 aa  77  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.193801  normal  0.0244768 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4576  aminoglycoside phosphotransferase  28 
 
 		 357 aa  76.3  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5078  aminoglycoside phosphotransferase  28.53 
 
 		 357 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0182  aminoglycoside phosphotransferase  31.25 
 
 		 339 aa  76.3  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  29.18 
 
 		 338 aa  75.9  0.0000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  26.13 
 
 		 348 aa  75.9  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2075  aminoglycoside phosphotransferase  25.43 
 
 		 355 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0283964  normal  0.0813065 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1459  aminoglycoside phosphotransferase  24.71 
 
 		 354 aa  75.5  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.049097  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1314  phosphotransferase enzyme family protein  30.75 
 
 		 368 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1323  phosphotransferase enzyme family protein  30.75 
 
 		 368 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2724  hypothetical protein  25.76 
 
 		 355 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1805  phosphotransferase enzyme family protein  30.75 
 
 		 368 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113334  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1460  phosphotransferase family protein  30.75 
 
 		 368 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0437  phosphotransferase enzyme family protein  30.75 
 
 		 368 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2903  aminoglycoside phosphotransferase  25.69 
 
 		 353 aa  75.1  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1154  phosphotransferase enzyme family protein  30.75 
 
 		 368 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.119269  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0714  phosphotransferase enzyme family protein  30.75 
 
 		 368 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.701125  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1910  aminoglycoside phosphotransferase  25.52 
 
 		 355 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  26.71 
 
 		 353 aa  74.3  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3218  aminoglycoside phosphotransferase  28.53 
 
 		 343 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1831  aminoglycoside phosphotransferase  34.17 
 
 		 451 aa  73.9  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3865  aminoglycoside phosphotransferase  28.74 
 
 		 350 aa  73.9  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0767712  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  30.99 
 
 		 358 aa  73.6  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3038  aminoglycoside phosphotransferase  28.45 
 
 		 343 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3072  aminoglycoside phosphotransferase  29.79 
 
 		 388 aa  73.6  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267154  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3925  aminoglycoside phosphotransferase  24.78 
 
 		 355 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138496  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4469  aminoglycoside phosphotransferase  29.09 
 
 		 323 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00940393 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  28.14 
 
 		 352 aa  73.2  0.000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4000  aminoglycoside phosphotransferase  30.68 
 
 		 347 aa  73.6  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6361  aminoglycoside phosphotransferase  29.58 
 
 		 342 aa  73.2  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00784596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2652  aminoglycoside phosphotransferase  29.14 
 
 		 353 aa  73.2  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000355622  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3418  aminoglycoside phosphotransferase  25.15 
 
 		 355 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.949755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5046  aminoglycoside phosphotransferase  27.25 
 
 		 342 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2337  aminoglycoside phosphotransferase  27.27 
 
 		 353 aa  72  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3559  aminoglycoside phosphotransferase  25.41 
 
 		 355 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595969  normal  0.25426 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2202  aminoglycoside phosphotransferase  26.6 
 
 		 354 aa  72.8  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0249474  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3709  aminoglycoside phosphotransferase  26.87 
 
 		 352 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1248  aminoglycoside phosphotransferase  26.8 
 
 		 354 aa  71.6  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.437649  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4497  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  28 
 
 		 815 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3214  aminoglycoside phosphotransferase  24.78 
 
 		 355 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.457678 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>