246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4584 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4584  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 475 aa  936    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2483  aminoglycoside phosphotransferase  49.68 
 
 		 323 aa  249  8e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0370489  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3968  aminoglycoside phosphotransferase  45 
 
 		 332 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.574254  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1585  aminoglycoside phosphotransferase  43.51 
 
 		 319 aa  204  4e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1609  aminoglycoside phosphotransferase  43.51 
 
 		 319 aa  204  4e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3076  aminoglycoside phosphotransferase  37.73 
 
 		 337 aa  203  6e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.422792  normal  0.609725 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4469  aminoglycoside phosphotransferase  42.58 
 
 		 323 aa  202  8e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00940393 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1891  aminoglycoside phosphotransferase  42.76 
 
 		 350 aa  201  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1555  aminoglycoside phosphotransferase  43.18 
 
 		 319 aa  199  9e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200581  normal  0.346641 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1863  aminoglycoside phosphotransferase  41.43 
 
 		 329 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0353182  normal  0.189268 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2919  hypothetical protein  44.52 
 
 		 316 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.695501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3604  aminoglycoside phosphotransferase  41.39 
 
 		 331 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1959  aminoglycoside phosphotransferase  42.19 
 
 		 331 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3517  aminoglycoside phosphotransferase  41.95 
 
 		 334 aa  173  5.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4452  aminoglycoside phosphotransferase  35.31 
 
 		 346 aa  158  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.744873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2913  aminoglycoside phosphotransferase  38.8 
 
 		 325 aa  158  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.605881  normal  0.0304684 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1860  aminoglycoside phosphotransferase  33.08 
 
 		 447 aa  149  8e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.257775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5527  putative aminoglycoside phosphotransferase  33.96 
 
 		 311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35990  FadE36, aminoglycoside phosphotransferase  35.25 
 
 		 398 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.139022  hitchhiker  0.0000000000000200155 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2791  aminoglycoside phosphotransferase  33.82 
 
 		 376 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0281  aminoglycoside phosphotransferase  33.41 
 
 		 443 aa  125  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2501  aminoglycoside phosphotransferase  31.87 
 
 		 346 aa  110  6e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113216 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4407  aminoglycoside phosphotransferase  29.36 
 
 		 340 aa  103  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.219591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  31.61 
 
 		 356 aa  91.7  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1505  aminoglycoside phosphotransferase  28.75 
 
 		 358 aa  90.5  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.290971  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1528  aminoglycoside phosphotransferase  28.75 
 
 		 358 aa  90.5  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1505  aminoglycoside phosphotransferase  29.54 
 
 		 357 aa  90.1  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  31.73 
 
 		 344 aa  89  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2027  aminoglycoside phosphotransferase  30.09 
 
 		 366 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2073  aminoglycoside phosphotransferase  30.09 
 
 		 366 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2010  aminoglycoside phosphotransferase  30.09 
 
 		 367 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0773583  normal  0.266634 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  31.91 
 
 		 338 aa  87.8  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0835  aminoglycoside phosphotransferase  34.52 
 
 		 360 aa  87.8  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.407131  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1003  aminoglycoside phosphotransferase  34.06 
 
 		 337 aa  85.1  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.083137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  29.58 
 
 		 354 aa  85.5  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0618  putative phosphotransferase  31.2 
 
 		 350 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172758  normal  0.0703036 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0222  aminoglycoside phosphotransferase  32.58 
 
 		 355 aa  85.1  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.193801  normal  0.0244768 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0011  aminoglycoside phosphotransferase  27.38 
 
 		 337 aa  84  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477677  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1323  phosphotransferase enzyme family protein  33.7 
 
 		 368 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0714  phosphotransferase enzyme family protein  33.7 
 
 		 368 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.701125  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1805  phosphotransferase enzyme family protein  33.7 
 
 		 368 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113334  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1460  phosphotransferase family protein  33.7 
 
 		 368 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2903  aminoglycoside phosphotransferase  29.28 
 
 		 353 aa  83.6  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0437  phosphotransferase enzyme family protein  33.7 
 
 		 368 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1154  phosphotransferase enzyme family protein  33.7 
 
 		 368 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.119269  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  26.25 
 
 		 352 aa  82.8  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1314  phosphotransferase enzyme family protein  33.33 
 
 		 368 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3214  aminoglycoside phosphotransferase  27.53 
 
 		 355 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.457678 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  33.11 
 
 		 348 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2519  aminoglycoside phosphotransferase  33.95 
 
 		 349 aa  80.9  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  30.42 
 
 		 358 aa  81.3  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1084  phosphotransferase enzyme family protein  30.8 
 
 		 368 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1007  aminoglycoside phosphotransferase  27.3 
 
 		 358 aa  80.1  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  27.04 
 
 		 345 aa  79.7  0.00000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  33.62 
 
 		 344 aa  79.7  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3925  aminoglycoside phosphotransferase  26.05 
 
 		 355 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138496  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1108  aminoglycoside phosphotransferase  28.21 
 
 		 362 aa  78.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  31.45 
 
 		 353 aa  79  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3187  putative tyrosine protein kinase/aminoglycoside phosphotransferase  30 
 
 		 368 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0972  aminoglycoside phosphotransferase  26.97 
 
 		 358 aa  77.8  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0454764 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1910  aminoglycoside phosphotransferase  26.05 
 
 		 355 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3559  aminoglycoside phosphotransferase  26.05 
 
 		 355 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595969  normal  0.25426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6361  aminoglycoside phosphotransferase  31.54 
 
 		 342 aa  77.4  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00784596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5523  aminoglycoside phosphotransferase  27.25 
 
 		 354 aa  76.6  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2683  aminoglycoside phosphotransferase-like protein  26.2 
 
 		 372 aa  77  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.124499  normal  0.283498 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4570  aminoglycoside phosphotransferase  32.79 
 
 		 362 aa  76.6  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.303984  normal  0.410057 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6367  aminoglycoside phosphotransferase  29.17 
 
 		 353 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5287  aminoglycoside phosphotransferase  29.71 
 
 		 353 aa  75.9  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599023  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1035  aminoglycoside phosphotransferase  28.95 
 
 		 353 aa  75.5  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3590  aminoglycoside phosphotransferase  28.27 
 
 		 370 aa  74.7  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  27.38 
 
 		 348 aa  74.7  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17900  predicted aminoglycoside phosphotransferase  28.29 
 
 		 323 aa  74.3  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.215694  normal  0.505418 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  31.75 
 
 		 339 aa  73.6  0.000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4318  aminoglycoside phosphotransferase  37.41 
 
 		 350 aa  73.6  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5603  aminoglycoside phosphotransferase  29.43 
 
 		 339 aa  73.2  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764833 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00272  Phosphotransferase enzyme family domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G02880)  24.16 
 
 		 364 aa  72.8  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0403488 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2457  aminoglycoside phosphotransferase  25.65 
 
 		 355 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00764802 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1368  aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 		 368 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544786  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0284  putative aminoglycoside phosphotransferase  31.47 
 
 		 351 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.846831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0634  aminoglycoside phosphotransferase  26.4 
 
 		 370 aa  72.8  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  24.1 
 
 		 344 aa  72.8  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0521  phosphotransferase enzyme family protein  27.71 
 
 		 358 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.828343  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1901  aminoglycoside phosphotransferase  32.64 
 
 		 327 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.05669  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1478  aminoglycoside phosphotransferase  32.43 
 
 		 353 aa  72  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1881  aminoglycoside phosphotransferase  32.35 
 
 		 327 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.465558  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1947  aminoglycoside phosphotransferase  32.64 
 
 		 327 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13793  acyl-CoA dehydrogenase fadE36  30.45 
 
 		 351 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.384329 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  28.21 
 
 		 346 aa  72  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2652  aminoglycoside phosphotransferase  30.25 
 
 		 353 aa  72  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000355622  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1706  aminoglycoside phosphotransferase  29.55 
 
 		 355 aa  71.6  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.9599  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  32.57 
 
 		 315 aa  71.6  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01993  predicted aminoglycoside phosphotransferase  28.69 
 
 		 380 aa  71.2  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000191703  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2724  hypothetical protein  25.71 
 
 		 355 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  27.86 
 
 		 346 aa  70.9  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  31.52 
 
 		 359 aa  71.2  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2016  hypothetical protein  26.18 
 
 		 358 aa  70.9  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120817  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  27.8 
 
 		 352 aa  70.9  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  27.76 
 
 		 344 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2202  aminoglycoside phosphotransferase  25 
 
 		 354 aa  70.9  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0249474  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3418  aminoglycoside phosphotransferase  24.52 
 
 		 355 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.949755  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>