223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4318 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4318  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
350 aa  707    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136216  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2028  aminoglycoside phosphotransferase  83.67 
 
 
350 aa  592  1e-168  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00704541  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1805  aminoglycoside phosphotransferase  75.65 
 
 
354 aa  537  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.726443  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1852  aminoglycoside phosphotransferase  75.65 
 
 
354 aa  537  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.906902  normal  0.283402 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1786  aminoglycoside phosphotransferase  75.65 
 
 
354 aa  536  1e-151  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0286679  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1885  aminoglycoside phosphotransferase  42.3 
 
 
354 aa  269  4e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0370  aminoglycoside phosphotransferase  43.06 
 
 
345 aa  268  7e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.380981  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2652  aminoglycoside phosphotransferase  47.2 
 
 
353 aa  267  2e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000355622  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6361  aminoglycoside phosphotransferase  45.86 
 
 
342 aa  266  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00784596  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0618  putative phosphotransferase  43.47 
 
 
350 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172758  normal  0.0703036 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3748  aminoglycoside phosphotransferase  40.21 
 
 
350 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2519  aminoglycoside phosphotransferase  37.99 
 
 
349 aa  188  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177703  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4201  aminoglycoside phosphotransferase  39.24 
 
 
343 aa  188  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3736  aminoglycoside phosphotransferase  39.86 
 
 
350 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3809  aminoglycoside phosphotransferase  39.86 
 
 
350 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.274581 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2450  aminoglycoside phosphotransferase  36.86 
 
 
343 aa  185  9e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0097  aminoglycoside phosphotransferase  34.19 
 
 
340 aa  181  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.92974  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  35.67 
 
 
338 aa  162  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  36.59 
 
 
359 aa  159  9e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0861  aminoglycoside phosphotransferase  34.98 
 
 
354 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.622757  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  36.73 
 
 
339 aa  152  7e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  35.22 
 
 
354 aa  149  7e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2337  aminoglycoside phosphotransferase  33.44 
 
 
353 aa  149  8e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2514  aminoglycoside phosphotransferase  32.45 
 
 
365 aa  149  9e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7669  phosphotransferase family protein  34.64 
 
 
349 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  38 
 
 
341 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1108  aminoglycoside phosphotransferase  34.73 
 
 
362 aa  146  6e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2209  aminoglycoside phosphotransferase  32.29 
 
 
350 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375246  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5980  aminoglycoside phosphotransferase  36.02 
 
 
353 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1805  aminoglycoside phosphotransferase  26.71 
 
 
352 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2903  aminoglycoside phosphotransferase  30.26 
 
 
353 aa  144  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1035  aminoglycoside phosphotransferase  30.86 
 
 
353 aa  144  3e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  35.44 
 
 
356 aa  142  6e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  33.12 
 
 
344 aa  142  6e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1248  aminoglycoside phosphotransferase  29.24 
 
 
354 aa  142  8e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.437649  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  32.82 
 
 
315 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2064  aminoglycoside phosphotransferase  30.61 
 
 
361 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449993  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1559  aminoglycoside phosphotransferase  30.29 
 
 
344 aa  141  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  35.22 
 
 
344 aa  140  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0222  aminoglycoside phosphotransferase  32.05 
 
 
355 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.193801  normal  0.0244768 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0835  aminoglycoside phosphotransferase  35.39 
 
 
360 aa  139  7.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.407131  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 
344 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0927  aminoglycoside phosphotransferase  26.73 
 
 
351 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.993496  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0164  aminoglycoside phosphotransferase  30.94 
 
 
357 aa  138  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1459  aminoglycoside phosphotransferase  29.14 
 
 
354 aa  138  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.049097  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  31.03 
 
 
364 aa  135  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0471  aminoglycoside phosphotransferase  28.99 
 
 
403 aa  134  3e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3925  aminoglycoside phosphotransferase  29.73 
 
 
355 aa  133  5e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138496  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  32.69 
 
 
348 aa  133  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  31.6 
 
 
358 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  30.74 
 
 
348 aa  131  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1910  aminoglycoside phosphotransferase  29.39 
 
 
355 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107516  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1186  aminoglycoside phosphotransferase  27.25 
 
 
429 aa  131  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.161649  normal  0.0723481 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3559  aminoglycoside phosphotransferase  29.05 
 
 
355 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595969  normal  0.25426 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2397  aminoglycoside phosphotransferase  31.97 
 
 
362 aa  128  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  34.84 
 
 
352 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  28.27 
 
 
353 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6405  aminoglycoside phosphotransferase  31.69 
 
 
343 aa  127  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  28.91 
 
 
348 aa  127  4.0000000000000003e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  30.68 
 
 
346 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4490  aminoglycoside phosphotransferase  31.38 
 
 
344 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  32.15 
 
 
338 aa  126  5e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0182  aminoglycoside phosphotransferase  31.49 
 
 
339 aa  126  6e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3467  hypothetical protein  29.29 
 
 
356 aa  126  6e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  30.54 
 
 
346 aa  126  6e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3214  aminoglycoside phosphotransferase  27.7 
 
 
355 aa  126  7e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.457678 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1393  aminoglycoside phosphotransferase  26.82 
 
 
363 aa  125  9e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  30.06 
 
 
356 aa  125  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40880  hypothetical protein  29.29 
 
 
356 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2171  aminoglycoside phosphotransferase  30.32 
 
 
362 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0620475  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1847  aminoglycoside phosphotransferase  30.32 
 
 
362 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.00532112 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2476  aminoglycoside phosphotransferase  33.87 
 
 
338 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000012289  decreased coverage  0.00166754 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4576  aminoglycoside phosphotransferase  29.64 
 
 
357 aa  124  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3218  aminoglycoside phosphotransferase  30.06 
 
 
343 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0116  aminoglycoside phosphotransferase  28.99 
 
 
379 aa  123  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0011  aminoglycoside phosphotransferase  26.83 
 
 
337 aa  123  5e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477677  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2016  hypothetical protein  30.12 
 
 
358 aa  122  8e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120817  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1007  aminoglycoside phosphotransferase  28.91 
 
 
358 aa  122  8e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1018  aminoglycoside phosphotransferase  28.25 
 
 
358 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5078  aminoglycoside phosphotransferase  30.06 
 
 
357 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114652  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2724  hypothetical protein  26.4 
 
 
355 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  30.77 
 
 
343 aa  120  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  28.73 
 
 
344 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3038  aminoglycoside phosphotransferase  29.94 
 
 
343 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145633  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  27.9 
 
 
352 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0972  aminoglycoside phosphotransferase  29.36 
 
 
358 aa  119  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0454764 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0625  aminoglycoside phosphotransferase  28.53 
 
 
354 aa  119  7e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.149436 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2658  aminoglycoside phosphotransferase  31.67 
 
 
348 aa  119  7e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2075  aminoglycoside phosphotransferase  26.69 
 
 
355 aa  119  7e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0283964  normal  0.0813065 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2457  aminoglycoside phosphotransferase  26.69 
 
 
355 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00764802 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3418  aminoglycoside phosphotransferase  27.03 
 
 
355 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.949755  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  28.79 
 
 
352 aa  118  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5019  aminoglycoside phosphotransferase  29.75 
 
 
343 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5841  aminoglycoside phosphotransferase  29.75 
 
 
343 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4338  aminoglycoside phosphotransferase  29.75 
 
 
343 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3209  aminoglycoside phosphotransferase  28.57 
 
 
391 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79954  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18680  predicted aminoglycoside phosphotransferase  28.91 
 
 
357 aa  117  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.571289 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5718  aminoglycoside phosphotransferase  30.77 
 
 
343 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2202  aminoglycoside phosphotransferase  26.61 
 
 
354 aa  117  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0249474  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  27.83 
 
 
359 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.180797 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>