224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1852 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1805  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
354 aa  719    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.726443  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1852  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
354 aa  719    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.906902  normal  0.283402 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1786  aminoglycoside phosphotransferase  99.72 
 
 
354 aa  717    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0286679  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4318  aminoglycoside phosphotransferase  75.65 
 
 
350 aa  537  9.999999999999999e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136216  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2028  aminoglycoside phosphotransferase  75.87 
 
 
350 aa  528  1e-149  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00704541  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0370  aminoglycoside phosphotransferase  42.09 
 
 
345 aa  266  4e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.380981  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1885  aminoglycoside phosphotransferase  41.3 
 
 
354 aa  261  8.999999999999999e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2652  aminoglycoside phosphotransferase  45.29 
 
 
353 aa  258  1e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000355622  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6361  aminoglycoside phosphotransferase  43.37 
 
 
342 aa  254  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00784596  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0618  putative phosphotransferase  43.07 
 
 
350 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172758  normal  0.0703036 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2519  aminoglycoside phosphotransferase  38.79 
 
 
349 aa  196  7e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177703  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3748  aminoglycoside phosphotransferase  38.99 
 
 
350 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3736  aminoglycoside phosphotransferase  38.36 
 
 
350 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3809  aminoglycoside phosphotransferase  38.36 
 
 
350 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.274581 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2450  aminoglycoside phosphotransferase  36.33 
 
 
343 aa  186  5e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4201  aminoglycoside phosphotransferase  38.89 
 
 
343 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0097  aminoglycoside phosphotransferase  34.41 
 
 
340 aa  179  9e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.92974  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  35.31 
 
 
359 aa  166  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0861  aminoglycoside phosphotransferase  34.65 
 
 
354 aa  166  5e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.622757  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  34.58 
 
 
338 aa  156  6e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  32.04 
 
 
338 aa  150  3e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2514  aminoglycoside phosphotransferase  30.48 
 
 
365 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  33.12 
 
 
339 aa  146  5e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  35.28 
 
 
344 aa  146  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2209  aminoglycoside phosphotransferase  31.94 
 
 
350 aa  144  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375246  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  34.82 
 
 
341 aa  143  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  32.81 
 
 
354 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2337  aminoglycoside phosphotransferase  32.04 
 
 
353 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  33.22 
 
 
344 aa  140  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3559  aminoglycoside phosphotransferase  29.83 
 
 
355 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595969  normal  0.25426 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5980  aminoglycoside phosphotransferase  35.31 
 
 
353 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2903  aminoglycoside phosphotransferase  30.5 
 
 
353 aa  140  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1035  aminoglycoside phosphotransferase  30.19 
 
 
353 aa  140  3.9999999999999997e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  31.43 
 
 
358 aa  139  4.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3925  aminoglycoside phosphotransferase  30.17 
 
 
355 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138496  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  31.52 
 
 
315 aa  139  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0182  aminoglycoside phosphotransferase  33.56 
 
 
339 aa  138  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1393  aminoglycoside phosphotransferase  29.09 
 
 
363 aa  139  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3214  aminoglycoside phosphotransferase  29.59 
 
 
355 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.457678 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1559  aminoglycoside phosphotransferase  30.3 
 
 
344 aa  138  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2064  aminoglycoside phosphotransferase  31.08 
 
 
361 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449993  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  28.27 
 
 
353 aa  136  4e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7669  phosphotransferase family protein  31.9 
 
 
349 aa  136  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4576  aminoglycoside phosphotransferase  30.4 
 
 
357 aa  136  6.0000000000000005e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  32.18 
 
 
356 aa  136  7.000000000000001e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1910  aminoglycoside phosphotransferase  29.49 
 
 
355 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107516  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1108  aminoglycoside phosphotransferase  32.04 
 
 
362 aa  135  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0164  aminoglycoside phosphotransferase  30.63 
 
 
357 aa  135  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0222  aminoglycoside phosphotransferase  32.75 
 
 
355 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.193801  normal  0.0244768 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0835  aminoglycoside phosphotransferase  35.2 
 
 
360 aa  133  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.407131  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40880  hypothetical protein  30.64 
 
 
356 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2075  aminoglycoside phosphotransferase  28.96 
 
 
355 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0283964  normal  0.0813065 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1186  aminoglycoside phosphotransferase  27.09 
 
 
429 aa  131  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.161649  normal  0.0723481 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  30.23 
 
 
344 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1831  aminoglycoside phosphotransferase  34.21 
 
 
451 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  30.49 
 
 
364 aa  131  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0471  aminoglycoside phosphotransferase  27.97 
 
 
403 aa  130  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1459  aminoglycoside phosphotransferase  26.48 
 
 
354 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.049097  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0927  aminoglycoside phosphotransferase  27.52 
 
 
351 aa  129  6e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.993496  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2658  aminoglycoside phosphotransferase  32.57 
 
 
348 aa  129  7.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1248  aminoglycoside phosphotransferase  27.91 
 
 
354 aa  129  7.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.437649  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3467  hypothetical protein  30.3 
 
 
356 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1805  aminoglycoside phosphotransferase  26.69 
 
 
352 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2171  aminoglycoside phosphotransferase  29.94 
 
 
362 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0620475  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1847  aminoglycoside phosphotransferase  29.94 
 
 
362 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.00532112 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  32.79 
 
 
352 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  30.75 
 
 
346 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  32.71 
 
 
348 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4490  aminoglycoside phosphotransferase  30.65 
 
 
344 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  30.41 
 
 
346 aa  127  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0625  aminoglycoside phosphotransferase  28.53 
 
 
354 aa  126  5e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.149436 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  28.73 
 
 
356 aa  125  8.000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3418  aminoglycoside phosphotransferase  27.91 
 
 
355 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.949755  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2476  aminoglycoside phosphotransferase  32.8 
 
 
338 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000012289  decreased coverage  0.00166754 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  30.22 
 
 
352 aa  124  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1952  hypothetical protein  29.82 
 
 
363 aa  123  5e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.126845 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  28.62 
 
 
348 aa  123  6e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2016  hypothetical protein  30.17 
 
 
358 aa  122  7e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120817  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  27.41 
 
 
352 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  29.84 
 
 
352 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2908  aminoglycoside phosphotransferase  30.79 
 
 
347 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.1681 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2457  aminoglycoside phosphotransferase  27.36 
 
 
355 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00764802 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  29.35 
 
 
348 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1944  aminoglycoside phosphotransferase  32.12 
 
 
361 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1778  aminoglycoside phosphotransferase  32.42 
 
 
361 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.221845  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  28.66 
 
 
359 aa  120  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2397  aminoglycoside phosphotransferase  31.13 
 
 
362 aa  120  3e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  28.16 
 
 
344 aa  120  3e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2202  aminoglycoside phosphotransferase  26.36 
 
 
354 aa  120  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0249474  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0972  aminoglycoside phosphotransferase  30.06 
 
 
358 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0454764 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  31.29 
 
 
345 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5046  aminoglycoside phosphotransferase  31.7 
 
 
342 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1706  aminoglycoside phosphotransferase  32.3 
 
 
355 aa  120  4.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.9599  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  26.79 
 
 
344 aa  119  7e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2724  hypothetical protein  25.74 
 
 
355 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3218  aminoglycoside phosphotransferase  30.72 
 
 
343 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3209  aminoglycoside phosphotransferase  28.06 
 
 
391 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79954  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1368  aminoglycoside phosphotransferase  28.08 
 
 
368 aa  119  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544786  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1007  aminoglycoside phosphotransferase  29.06 
 
 
358 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3038  aminoglycoside phosphotransferase  29.86 
 
 
343 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145633  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>