252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3076 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_3076  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
337 aa  683    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.422792  normal  0.609725 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1959  aminoglycoside phosphotransferase  63.98 
 
 
331 aa  391  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2919  hypothetical protein  63.38 
 
 
316 aa  389  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.695501  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3604  aminoglycoside phosphotransferase  61.61 
 
 
331 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252193  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1863  aminoglycoside phosphotransferase  60.25 
 
 
329 aa  378  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0353182  normal  0.189268 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3517  aminoglycoside phosphotransferase  58.41 
 
 
334 aa  344  1e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2913  aminoglycoside phosphotransferase  54.97 
 
 
325 aa  320  1.9999999999999998e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.605881  normal  0.0304684 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2483  aminoglycoside phosphotransferase  47.54 
 
 
323 aa  258  9e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0370489  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3968  aminoglycoside phosphotransferase  48.45 
 
 
332 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.574254  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1860  aminoglycoside phosphotransferase  40.8 
 
 
447 aa  231  1e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.257775  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5527  putative aminoglycoside phosphotransferase  40.07 
 
 
311 aa  205  8e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4584  aminoglycoside phosphotransferase  37.73 
 
 
475 aa  203  4e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4469  aminoglycoside phosphotransferase  38.76 
 
 
323 aa  202  5e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00940393 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1585  aminoglycoside phosphotransferase  40.37 
 
 
319 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1609  aminoglycoside phosphotransferase  40.37 
 
 
319 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1555  aminoglycoside phosphotransferase  40.06 
 
 
319 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200581  normal  0.346641 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1891  aminoglycoside phosphotransferase  36.65 
 
 
350 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0281  aminoglycoside phosphotransferase  37.93 
 
 
443 aa  177  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4452  aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 
346 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.744873  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2791  aminoglycoside phosphotransferase  35.44 
 
 
376 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35990  FadE36, aminoglycoside phosphotransferase  34.94 
 
 
398 aa  160  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.139022  hitchhiker  0.0000000000000200155 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4407  aminoglycoside phosphotransferase  32.15 
 
 
340 aa  124  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.219591  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2501  aminoglycoside phosphotransferase  32.89 
 
 
346 aa  121  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113216 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1505  aminoglycoside phosphotransferase  32.67 
 
 
358 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.290971  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1528  aminoglycoside phosphotransferase  32.67 
 
 
358 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  30.12 
 
 
358 aa  98.6  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1505  aminoglycoside phosphotransferase  31.08 
 
 
357 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2202  aminoglycoside phosphotransferase  24.27 
 
 
354 aa  89.4  7e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0249474  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6367  aminoglycoside phosphotransferase  30.74 
 
 
353 aa  88.6  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5287  aminoglycoside phosphotransferase  30.74 
 
 
353 aa  88.6  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599023  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  24.93 
 
 
344 aa  89  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0994  aminoglycoside phosphotransferase  30.89 
 
 
358 aa  87.4  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.739164  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0894  aminoglycoside phosphotransferase  42.06 
 
 
459 aa  87  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.184458  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0972  aminoglycoside phosphotransferase  30.08 
 
 
358 aa  86.7  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0454764 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1035  aminoglycoside phosphotransferase  27.27 
 
 
353 aa  85.5  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5523  aminoglycoside phosphotransferase  30.84 
 
 
354 aa  85.1  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  28.61 
 
 
348 aa  84.3  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1007  aminoglycoside phosphotransferase  28.86 
 
 
358 aa  84  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5046  aminoglycoside phosphotransferase  29.46 
 
 
342 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3038  aminoglycoside phosphotransferase  30.98 
 
 
343 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145633  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  30.67 
 
 
353 aa  83.2  0.000000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  28.39 
 
 
364 aa  82.8  0.000000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0634  aminoglycoside phosphotransferase  29.87 
 
 
370 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0222  aminoglycoside phosphotransferase  29.74 
 
 
355 aa  82.4  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.193801  normal  0.0244768 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0011  aminoglycoside phosphotransferase  27.98 
 
 
337 aa  81.6  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477677  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4338  aminoglycoside phosphotransferase  31.54 
 
 
343 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1018  aminoglycoside phosphotransferase  30.62 
 
 
358 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0284  putative aminoglycoside phosphotransferase  25.89 
 
 
351 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.846831  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5019  aminoglycoside phosphotransferase  31.54 
 
 
343 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  27.92 
 
 
344 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5841  aminoglycoside phosphotransferase  31.54 
 
 
343 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3076  aminoglycoside phosphotransferase  28.16 
 
 
361 aa  80.5  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.986116  normal  0.214027 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0116  aminoglycoside phosphotransferase  26.79 
 
 
379 aa  80.1  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0625  aminoglycoside phosphotransferase  27.31 
 
 
354 aa  79.7  0.00000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.149436 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  28.18 
 
 
359 aa  79.7  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3286  aminoglycoside phosphotransferase  26.24 
 
 
361 aa  79.3  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3481  aminoglycoside phosphotransferase  28.52 
 
 
353 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0724682  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3218  aminoglycoside phosphotransferase  30.59 
 
 
343 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2658  aminoglycoside phosphotransferase  28.92 
 
 
348 aa  79  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2903  aminoglycoside phosphotransferase  31.03 
 
 
353 aa  78.2  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  28.69 
 
 
345 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1706  aminoglycoside phosphotransferase  28.81 
 
 
355 aa  78.2  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.9599  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3187  putative tyrosine protein kinase/aminoglycoside phosphotransferase  26.97 
 
 
368 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1368  aminoglycoside phosphotransferase  27.42 
 
 
368 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544786  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  29.69 
 
 
348 aa  77.8  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  27.38 
 
 
352 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2010  aminoglycoside phosphotransferase  26.74 
 
 
367 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0773583  normal  0.266634 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  30.18 
 
 
344 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0182  aminoglycoside phosphotransferase  28.72 
 
 
339 aa  77  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2027  aminoglycoside phosphotransferase  26.74 
 
 
366 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  30.47 
 
 
352 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2073  aminoglycoside phosphotransferase  26.74 
 
 
366 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01993  predicted aminoglycoside phosphotransferase  29.82 
 
 
380 aa  77  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000191703  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  29.11 
 
 
359 aa  76.3  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2810  aminoglycoside phosphotransferase  29.03 
 
 
336 aa  76.3  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541387  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1778  aminoglycoside phosphotransferase  27.59 
 
 
361 aa  76.3  0.0000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.221845  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4576  aminoglycoside phosphotransferase  29.31 
 
 
357 aa  76.3  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3590  aminoglycoside phosphotransferase  30.8 
 
 
370 aa  76.3  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1944  aminoglycoside phosphotransferase  27.43 
 
 
361 aa  75.5  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3209  aminoglycoside phosphotransferase  27.46 
 
 
391 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79954  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1478  aminoglycoside phosphotransferase  30.71 
 
 
353 aa  75.5  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  28.1 
 
 
352 aa  75.1  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  29.46 
 
 
352 aa  74.7  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5078  aminoglycoside phosphotransferase  29.8 
 
 
357 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114652  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  28.81 
 
 
354 aa  75.1  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1084  phosphotransferase enzyme family protein  27.89 
 
 
368 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1559  aminoglycoside phosphotransferase  24.23 
 
 
344 aa  73.9  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1901  aminoglycoside phosphotransferase  32.22 
 
 
327 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.05669  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1947  aminoglycoside phosphotransferase  32.22 
 
 
327 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3709  aminoglycoside phosphotransferase  27.05 
 
 
352 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0471  aminoglycoside phosphotransferase  30.4 
 
 
403 aa  73.6  0.000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  28.03 
 
 
343 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  27.55 
 
 
346 aa  72.8  0.000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1149  aminoglycoside phosphotransferase  28.57 
 
 
337 aa  73.2  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1881  aminoglycoside phosphotransferase  31.8 
 
 
327 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.465558  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  26.93 
 
 
348 aa  72.8  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2016  hypothetical protein  27.54 
 
 
358 aa  72.4  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120817  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  31.28 
 
 
344 aa  72.8  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2050  aminoglycoside phosphotransferase  27.01 
 
 
450 aa  72.8  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.299693  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0714  phosphotransferase enzyme family protein  27.09 
 
 
368 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.701125  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>