234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4407 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4407  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
340 aa  686    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.219591  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2501  aminoglycoside phosphotransferase  53.94 
 
 
346 aa  322  7e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113216 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2483  aminoglycoside phosphotransferase  31.45 
 
 
323 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0370489  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0284  putative aminoglycoside phosphotransferase  32.23 
 
 
351 aa  126  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.846831  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3076  aminoglycoside phosphotransferase  32.15 
 
 
337 aa  124  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.422792  normal  0.609725 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1959  aminoglycoside phosphotransferase  28.96 
 
 
331 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3968  aminoglycoside phosphotransferase  31.48 
 
 
332 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.574254  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2919  hypothetical protein  29.93 
 
 
316 aa  109  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.695501  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1863  aminoglycoside phosphotransferase  28.38 
 
 
329 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0353182  normal  0.189268 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3604  aminoglycoside phosphotransferase  29.29 
 
 
331 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252193  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1585  aminoglycoside phosphotransferase  29.7 
 
 
319 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1609  aminoglycoside phosphotransferase  29.7 
 
 
319 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1555  aminoglycoside phosphotransferase  29.37 
 
 
319 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200581  normal  0.346641 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4584  aminoglycoside phosphotransferase  29.72 
 
 
475 aa  103  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4452  aminoglycoside phosphotransferase  28.45 
 
 
346 aa  103  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.744873  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2913  aminoglycoside phosphotransferase  30.85 
 
 
325 aa  103  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.605881  normal  0.0304684 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1505  aminoglycoside phosphotransferase  27.71 
 
 
358 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.290971  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1528  aminoglycoside phosphotransferase  27.71 
 
 
358 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3517  aminoglycoside phosphotransferase  30.1 
 
 
334 aa  97.1  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1505  aminoglycoside phosphotransferase  27.71 
 
 
357 aa  96.3  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1003  aminoglycoside phosphotransferase  31.82 
 
 
337 aa  95.5  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.083137  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  31.69 
 
 
352 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4469  aminoglycoside phosphotransferase  26.69 
 
 
323 aa  93.2  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00940393 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  28.75 
 
 
352 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2658  aminoglycoside phosphotransferase  29.07 
 
 
348 aa  92.4  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2010  aminoglycoside phosphotransferase  28.04 
 
 
367 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0773583  normal  0.266634 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  30.03 
 
 
352 aa  90.5  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2397  aminoglycoside phosphotransferase  28.66 
 
 
362 aa  90.5  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2027  aminoglycoside phosphotransferase  28.62 
 
 
366 aa  89.4  8e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2073  aminoglycoside phosphotransferase  28.62 
 
 
366 aa  89.4  8e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  30.85 
 
 
344 aa  89.4  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  27.24 
 
 
344 aa  89  9e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00272  Phosphotransferase enzyme family domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G02880)  25.39 
 
 
364 aa  88.6  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0403488 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5046  aminoglycoside phosphotransferase  28.99 
 
 
342 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  27.24 
 
 
348 aa  87.8  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  29.66 
 
 
344 aa  86.7  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3709  aminoglycoside phosphotransferase  27.99 
 
 
352 aa  85.9  9e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0011  aminoglycoside phosphotransferase  26.15 
 
 
337 aa  85.9  9e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477677  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5523  aminoglycoside phosphotransferase  28.17 
 
 
354 aa  85.5  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  27.24 
 
 
352 aa  85.5  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3209  aminoglycoside phosphotransferase  28.03 
 
 
391 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79954  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1186  aminoglycoside phosphotransferase  26.95 
 
 
429 aa  84  0.000000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.161649  normal  0.0723481 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  31.67 
 
 
356 aa  83.2  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  27.69 
 
 
345 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  29.53 
 
 
354 aa  82.8  0.000000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5980  aminoglycoside phosphotransferase  31.21 
 
 
353 aa  82.8  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1860  aminoglycoside phosphotransferase  30.04 
 
 
447 aa  82.4  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.257775  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  26.34 
 
 
364 aa  81.3  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0624  aminoglycoside phosphotransferase  29.58 
 
 
355 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0994  aminoglycoside phosphotransferase  26.58 
 
 
358 aa  80.9  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.739164  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3481  aminoglycoside phosphotransferase  28.71 
 
 
353 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0724682  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  25.93 
 
 
346 aa  80.5  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1368  aminoglycoside phosphotransferase  27.09 
 
 
368 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544786  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  25.5 
 
 
346 aa  79.7  0.00000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1891  aminoglycoside phosphotransferase  26.1 
 
 
350 aa  80.1  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  25.84 
 
 
359 aa  79  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2810  aminoglycoside phosphotransferase  27.16 
 
 
336 aa  78.6  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541387  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0625  aminoglycoside phosphotransferase  29.06 
 
 
354 aa  79  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.149436 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1910  aminoglycoside phosphotransferase  29.91 
 
 
355 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107516  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4490  aminoglycoside phosphotransferase  28.57 
 
 
344 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1901  aminoglycoside phosphotransferase  27.99 
 
 
327 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.05669  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1947  aminoglycoside phosphotransferase  27.99 
 
 
327 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2724  hypothetical protein  26.13 
 
 
355 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  28.67 
 
 
338 aa  77.4  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6405  aminoglycoside phosphotransferase  28.73 
 
 
343 aa  77.8  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3214  aminoglycoside phosphotransferase  30 
 
 
355 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.457678 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0471  aminoglycoside phosphotransferase  25.37 
 
 
403 aa  77  0.0000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  27.76 
 
 
348 aa  77  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2209  aminoglycoside phosphotransferase  30.49 
 
 
350 aa  77  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375246  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3925  aminoglycoside phosphotransferase  29.02 
 
 
355 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138496  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  29.01 
 
 
341 aa  76.6  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3187  putative tyrosine protein kinase/aminoglycoside phosphotransferase  27.35 
 
 
368 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3559  aminoglycoside phosphotransferase  29.02 
 
 
355 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595969  normal  0.25426 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0281  aminoglycoside phosphotransferase  36.3 
 
 
443 aa  75.9  0.0000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35990  FadE36, aminoglycoside phosphotransferase  27.3 
 
 
398 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.139022  hitchhiker  0.0000000000000200155 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03575  conserved hypothetical protein  24.16 
 
 
382 aa  75.5  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000000000417881  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2791  aminoglycoside phosphotransferase  26.12 
 
 
376 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  27.35 
 
 
344 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1248  aminoglycoside phosphotransferase  25.81 
 
 
354 aa  75.5  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.437649  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5527  putative aminoglycoside phosphotransferase  28.72 
 
 
311 aa  75.5  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1944  aminoglycoside phosphotransferase  28.06 
 
 
361 aa  75.9  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1778  aminoglycoside phosphotransferase  28.1 
 
 
361 aa  75.5  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.221845  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2016  hypothetical protein  26.49 
 
 
358 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120817  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0521  phosphotransferase enzyme family protein  28.85 
 
 
358 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.828343  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0972  aminoglycoside phosphotransferase  26.47 
 
 
358 aa  74.3  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0454764 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1986  aminoglycoside phosphotransferase  27.27 
 
 
368 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4576  aminoglycoside phosphotransferase  26.51 
 
 
357 aa  75.1  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2171  aminoglycoside phosphotransferase  26.49 
 
 
362 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0620475  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0634  aminoglycoside phosphotransferase  25.22 
 
 
370 aa  74.3  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1847  aminoglycoside phosphotransferase  26.49 
 
 
362 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.00532112 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1007  aminoglycoside phosphotransferase  25.83 
 
 
358 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3327  aminoglycoside phosphotransferase  28.01 
 
 
361 aa  73.6  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40103  predicted protein  27.8 
 
 
264 aa  73.9  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1035  aminoglycoside phosphotransferase  28.53 
 
 
353 aa  73.6  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3072  aminoglycoside phosphotransferase  26.35 
 
 
388 aa  73.6  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267154  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  24.89 
 
 
356 aa  73.6  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  25.42 
 
 
344 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1459  aminoglycoside phosphotransferase  27.07 
 
 
354 aa  73.2  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.049097  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  27.13 
 
 
339 aa  73.2  0.000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1805  aminoglycoside phosphotransferase  28.4 
 
 
354 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.726443  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>