209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0624 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0624  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 355 aa  711    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3974  aminoglycoside phosphotransferase  39.26 
 
 		 350 aa  218  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7694  aminoglycoside phosphotransferase  36 
 
 		 382 aa  170  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2683  aminoglycoside phosphotransferase-like protein  34.06 
 
 		 372 aa  159  9e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.124499  normal  0.283498 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4048  aminoglycoside phosphotransferase  32.73 
 
 		 361 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.430148  normal  0.325944 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1530  aminoglycoside phosphotransferase  31.61 
 
 		 373 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.984982  normal  0.641522 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4497  aminoglycoside phosphotransferase  31.16 
 
 		 382 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.609901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1560  aminoglycoside phosphotransferase  31 
 
 		 373 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1584  aminoglycoside phosphotransferase  31 
 
 		 373 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3636  aminoglycoside phosphotransferase  32.3 
 
 		 375 aa  117  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1869  aminoglycoside phosphotransferase  30.38 
 
 		 378 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0573919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4604  aminoglycoside phosphotransferase  32.08 
 
 		 381 aa  108  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.882822  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2027  aminoglycoside phosphotransferase  31.65 
 
 		 366 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2073  aminoglycoside phosphotransferase  31.65 
 
 		 366 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2010  aminoglycoside phosphotransferase  31.65 
 
 		 367 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0773583  normal  0.266634 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13189  hypothetical protein  29.64 
 
 		 378 aa  105  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.23318 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  28 
 
 		 341 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2903  aminoglycoside phosphotransferase  33.21 
 
 		 353 aa  100  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0011  aminoglycoside phosphotransferase  29.76 
 
 		 337 aa  97.8  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477677  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1885  aminoglycoside phosphotransferase  27.48 
 
 		 354 aa  97.8  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1186  aminoglycoside phosphotransferase  29.32 
 
 		 429 aa  96.7  5e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.161649  normal  0.0723481 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1035  aminoglycoside phosphotransferase  31.45 
 
 		 353 aa  95.9  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0222  aminoglycoside phosphotransferase  31.76 
 
 		 355 aa  95.9  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.193801  normal  0.0244768 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  28.22 
 
 		 348 aa  92  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  31.84 
 
 		 346 aa  91.3  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  27.99 
 
 		 348 aa  91.3  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  31.84 
 
 		 346 aa  91.3  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  28.92 
 
 		 358 aa  90.9  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0634  aminoglycoside phosphotransferase  26.79 
 
 		 370 aa  91.3  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  27.31 
 
 		 338 aa  90.9  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2216  aminoglycoside phosphotransferase  27.13 
 
 		 355 aa  89.4  9e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5980  aminoglycoside phosphotransferase  28.94 
 
 		 353 aa  89.4  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  30.35 
 
 		 359 aa  89  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2337  aminoglycoside phosphotransferase  29.09 
 
 		 353 aa  88.2  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5718  aminoglycoside phosphotransferase  32.86 
 
 		 343 aa  87.4  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  31.35 
 
 		 348 aa  87.4  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  26.44 
 
 		 315 aa  87.8  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1003  aminoglycoside phosphotransferase  34.26 
 
 		 337 aa  86.7  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.083137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  28.42 
 
 		 344 aa  86.3  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  26.52 
 
 		 356 aa  85.9  9e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  29.66 
 
 		 353 aa  85.9  9e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1393  aminoglycoside phosphotransferase  26.5 
 
 		 363 aa  85.9  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0182  aminoglycoside phosphotransferase  29.41 
 
 		 339 aa  85.5  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  34.65 
 
 		 343 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2209  aminoglycoside phosphotransferase  27.65 
 
 		 350 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375246  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  29.91 
 
 		 344 aa  84.7  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1847  aminoglycoside phosphotransferase  27.44 
 
 		 362 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.00532112 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2171  aminoglycoside phosphotransferase  27.44 
 
 		 362 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0620475  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2397  aminoglycoside phosphotransferase  27.47 
 
 		 362 aa  84.3  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3038  aminoglycoside phosphotransferase  34.8 
 
 		 343 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3218  aminoglycoside phosphotransferase  34.5 
 
 		 343 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4338  aminoglycoside phosphotransferase  34.06 
 
 		 343 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0164  aminoglycoside phosphotransferase  26.98 
 
 		 357 aa  83.2  0.000000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3559  aminoglycoside phosphotransferase  26.09 
 
 		 355 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595969  normal  0.25426 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5019  aminoglycoside phosphotransferase  34.06 
 
 		 343 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5078  aminoglycoside phosphotransferase  34.06 
 
 		 357 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5841  aminoglycoside phosphotransferase  34.06 
 
 		 343 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  27.71 
 
 		 338 aa  82.4  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1368  aminoglycoside phosphotransferase  28.57 
 
 		 368 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544786  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4490  aminoglycoside phosphotransferase  27.92 
 
 		 344 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  29.22 
 
 		 344 aa  80.9  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2724  hypothetical protein  26.85 
 
 		 355 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4576  aminoglycoside phosphotransferase  29.68 
 
 		 357 aa  81.3  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4407  aminoglycoside phosphotransferase  29.58 
 
 		 340 aa  80.9  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.219591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1805  aminoglycoside phosphotransferase  28.27 
 
 		 354 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.726443  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1559  aminoglycoside phosphotransferase  25.49 
 
 		 344 aa  80.9  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  29.96 
 
 		 344 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1852  aminoglycoside phosphotransferase  28.27 
 
 		 354 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.906902  normal  0.283402 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1786  aminoglycoside phosphotransferase  28.27 
 
 		 354 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0286679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2064  aminoglycoside phosphotransferase  26.71 
 
 		 361 aa  80.5  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1459  aminoglycoside phosphotransferase  27.4 
 
 		 354 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.049097  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1986  aminoglycoside phosphotransferase  28.23 
 
 		 368 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2202  aminoglycoside phosphotransferase  26.2 
 
 		 354 aa  79.7  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0249474  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1018  aminoglycoside phosphotransferase  29.89 
 
 		 358 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0471  aminoglycoside phosphotransferase  27.84 
 
 		 403 aa  79.3  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  29.6 
 
 		 344 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0927  aminoglycoside phosphotransferase  25.86 
 
 		 351 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.993496  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3076  aminoglycoside phosphotransferase  27.55 
 
 		 361 aa  77.8  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.986116  normal  0.214027 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0972  aminoglycoside phosphotransferase  27.24 
 
 		 358 aa  77.8  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0454764 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  29.59 
 
 		 356 aa  77.8  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01993  predicted aminoglycoside phosphotransferase  24.05 
 
 		 380 aa  77.8  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000191703  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3327  aminoglycoside phosphotransferase  27.88 
 
 		 361 aa  77  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2016  hypothetical protein  26.87 
 
 		 358 aa  76.3  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120817  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1248  aminoglycoside phosphotransferase  28.03 
 
 		 354 aa  76.3  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.437649  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4318  aminoglycoside phosphotransferase  25.53 
 
 		 350 aa  76.3  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136216  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3925  aminoglycoside phosphotransferase  27.27 
 
 		 355 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138496  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1805  aminoglycoside phosphotransferase  25.54 
 
 		 352 aa  75.9  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  26.53 
 
 		 339 aa  74.7  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1007  aminoglycoside phosphotransferase  25.81 
 
 		 358 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2658  aminoglycoside phosphotransferase  27.83 
 
 		 348 aa  74.7  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1314  phosphotransferase enzyme family protein  28.14 
 
 		 368 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  28.96 
 
 		 354 aa  74.3  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1084  phosphotransferase enzyme family protein  27.12 
 
 		 368 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6361  aminoglycoside phosphotransferase  29.28 
 
 		 342 aa  73.9  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00784596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0116  aminoglycoside phosphotransferase  27.89 
 
 		 379 aa  73.9  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40880  hypothetical protein  26.91 
 
 		 356 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1805  phosphotransferase enzyme family protein  28.14 
 
 		 368 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113334  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0437  phosphotransferase enzyme family protein  28.14 
 
 		 368 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4201  aminoglycoside phosphotransferase  26.73 
 
 		 343 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1154  phosphotransferase enzyme family protein  28.14 
 
 		 368 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.119269  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>