256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0284 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0284  putative aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
351 aa  714    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.846831  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2010  aminoglycoside phosphotransferase  31.56 
 
 
367 aa  149  9e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0773583  normal  0.266634 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2027  aminoglycoside phosphotransferase  31.25 
 
 
366 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2073  aminoglycoside phosphotransferase  31.25 
 
 
366 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4407  aminoglycoside phosphotransferase  32.23 
 
 
340 aa  126  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.219591  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2501  aminoglycoside phosphotransferase  25.08 
 
 
346 aa  119  6e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113216 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35990  FadE36, aminoglycoside phosphotransferase  26.79 
 
 
398 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.139022  hitchhiker  0.0000000000000200155 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1559  aminoglycoside phosphotransferase  26.91 
 
 
344 aa  98.2  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1018  aminoglycoside phosphotransferase  35.59 
 
 
358 aa  97.4  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2791  aminoglycoside phosphotransferase  26.09 
 
 
376 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  33.46 
 
 
348 aa  94  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1393  aminoglycoside phosphotransferase  27.49 
 
 
363 aa  93.2  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  30.56 
 
 
344 aa  92.8  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2064  aminoglycoside phosphotransferase  29.06 
 
 
361 aa  92.8  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449993  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0116  aminoglycoside phosphotransferase  29.93 
 
 
379 aa  92.4  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4518  aminoglycoside phosphotransferase  30.17 
 
 
339 aa  92  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2519  aminoglycoside phosphotransferase  31.47 
 
 
349 aa  91.7  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177703  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  26.69 
 
 
348 aa  90.5  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0927  aminoglycoside phosphotransferase  25.69 
 
 
351 aa  90.1  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.993496  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1585  aminoglycoside phosphotransferase  25.48 
 
 
319 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1609  aminoglycoside phosphotransferase  25.48 
 
 
319 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3187  putative tyrosine protein kinase/aminoglycoside phosphotransferase  25.71 
 
 
368 aa  89.4  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  33.33 
 
 
352 aa  88.6  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  28.32 
 
 
338 aa  88.2  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  31.94 
 
 
352 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  26.88 
 
 
359 aa  88.6  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0471  aminoglycoside phosphotransferase  26.51 
 
 
403 aa  88.2  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  33.52 
 
 
346 aa  88.6  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2209  aminoglycoside phosphotransferase  32.2 
 
 
350 aa  87.4  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375246  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  32.77 
 
 
339 aa  87.4  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3076  aminoglycoside phosphotransferase  30.94 
 
 
361 aa  87.4  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.986116  normal  0.214027 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  32.95 
 
 
346 aa  87  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  28.87 
 
 
358 aa  86.7  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1368  aminoglycoside phosphotransferase  32.58 
 
 
368 aa  86.3  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544786  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3286  aminoglycoside phosphotransferase  31.11 
 
 
361 aa  86.3  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5350  aminoglycoside phosphotransferase  31.56 
 
 
338 aa  85.9  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4969  aminoglycoside phosphotransferase  31.56 
 
 
338 aa  85.9  9e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5057  aminoglycoside phosphotransferase  31.56 
 
 
338 aa  85.9  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560893  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1805  phosphotransferase enzyme family protein  33.16 
 
 
368 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113334  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0164  aminoglycoside phosphotransferase  27.82 
 
 
357 aa  85.5  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1460  phosphotransferase family protein  33.16 
 
 
368 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  25.88 
 
 
352 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3209  aminoglycoside phosphotransferase  27.57 
 
 
391 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79954  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1323  phosphotransferase enzyme family protein  33.16 
 
 
368 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1555  aminoglycoside phosphotransferase  25.16 
 
 
319 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200581  normal  0.346641 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1154  phosphotransferase enzyme family protein  33.16 
 
 
368 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.119269  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0714  phosphotransferase enzyme family protein  33.16 
 
 
368 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.701125  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0437  phosphotransferase enzyme family protein  33.16 
 
 
368 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1314  phosphotransferase enzyme family protein  33.16 
 
 
368 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2397  aminoglycoside phosphotransferase  29.32 
 
 
362 aa  84.3  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2337  aminoglycoside phosphotransferase  29.32 
 
 
353 aa  84  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01993  predicted aminoglycoside phosphotransferase  28.33 
 
 
380 aa  84  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000191703  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  30.38 
 
 
341 aa  83.6  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1891  aminoglycoside phosphotransferase  27.31 
 
 
350 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1186  aminoglycoside phosphotransferase  26.18 
 
 
429 aa  83.6  0.000000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.161649  normal  0.0723481 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1805  aminoglycoside phosphotransferase  25.88 
 
 
352 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7669  phosphotransferase family protein  26.57 
 
 
349 aa  83.2  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1944  aminoglycoside phosphotransferase  26.32 
 
 
361 aa  82.8  0.000000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2050  aminoglycoside phosphotransferase  33.5 
 
 
450 aa  83.2  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.299693  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1778  aminoglycoside phosphotransferase  26.32 
 
 
361 aa  82.8  0.000000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.221845  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  32.38 
 
 
344 aa  82.8  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0625  aminoglycoside phosphotransferase  24.91 
 
 
354 aa  82  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.149436 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  27.1 
 
 
348 aa  82.4  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2919  hypothetical protein  27.42 
 
 
316 aa  81.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.695501  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4469  aminoglycoside phosphotransferase  25 
 
 
323 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00940393 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  24.56 
 
 
364 aa  81.6  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3076  aminoglycoside phosphotransferase  25.89 
 
 
337 aa  81.3  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.422792  normal  0.609725 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2202  aminoglycoside phosphotransferase  26.55 
 
 
354 aa  82  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0249474  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1084  phosphotransferase enzyme family protein  32.22 
 
 
368 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4576  aminoglycoside phosphotransferase  29.89 
 
 
357 aa  80.9  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2483  aminoglycoside phosphotransferase  26.62 
 
 
323 aa  80.9  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0370489  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0994  aminoglycoside phosphotransferase  26.44 
 
 
358 aa  80.5  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.739164  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4490  aminoglycoside phosphotransferase  33.88 
 
 
344 aa  79.7  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  32.18 
 
 
315 aa  79.7  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0243  phosphotransferase enzyme family protein  27.08 
 
 
358 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4452  aminoglycoside phosphotransferase  25.88 
 
 
346 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.744873  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0894  aminoglycoside phosphotransferase  32.58 
 
 
459 aa  79  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.184458  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0279  phosphotransferase enzyme family protein  27.08 
 
 
358 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.438432  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2216  aminoglycoside phosphotransferase  28.57 
 
 
355 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1426  phosphotransferase enzyme family protein  27.08 
 
 
358 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1623  phosphotransferase enzyme family protein  27.08 
 
 
358 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0011  aminoglycoside phosphotransferase  26.61 
 
 
337 aa  78.2  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477677  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  34.83 
 
 
344 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0634  aminoglycoside phosphotransferase  29.05 
 
 
370 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3517  aminoglycoside phosphotransferase  38.71 
 
 
334 aa  77.8  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3559  aminoglycoside phosphotransferase  27.17 
 
 
355 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595969  normal  0.25426 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1459  aminoglycoside phosphotransferase  25.57 
 
 
354 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.049097  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2658  aminoglycoside phosphotransferase  27.84 
 
 
348 aa  77  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3709  aminoglycoside phosphotransferase  28.25 
 
 
352 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1108  aminoglycoside phosphotransferase  24.91 
 
 
362 aa  77  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0521  phosphotransferase enzyme family protein  26.35 
 
 
358 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.828343  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3327  aminoglycoside phosphotransferase  27.22 
 
 
361 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1863  aminoglycoside phosphotransferase  28.97 
 
 
329 aa  77  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0353182  normal  0.189268 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1035  aminoglycoside phosphotransferase  25.36 
 
 
353 aa  76.6  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0835  aminoglycoside phosphotransferase  28.57 
 
 
360 aa  76.6  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.407131  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1910  aminoglycoside phosphotransferase  27.17 
 
 
355 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107516  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2515  phosphotransferase enzyme family protein  26.71 
 
 
358 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.538126  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3072  aminoglycoside phosphotransferase  26.82 
 
 
388 aa  75.9  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267154  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  26.71 
 
 
344 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1912  aminoglycoside phosphotransferase  28.18 
 
 
363 aa  75.9  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.143156  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>