228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2791 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_2791  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
376 aa  762    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35990  FadE36, aminoglycoside phosphotransferase  87.5 
 
 
398 aa  633  1e-180  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.139022  hitchhiker  0.0000000000000200155 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4452  aminoglycoside phosphotransferase  48.21 
 
 
346 aa  296  3e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.744873  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4469  aminoglycoside phosphotransferase  33.96 
 
 
323 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00940393 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3076  aminoglycoside phosphotransferase  35.44 
 
 
337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.422792  normal  0.609725 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1891  aminoglycoside phosphotransferase  35.66 
 
 
350 aa  163  6e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1585  aminoglycoside phosphotransferase  33.65 
 
 
319 aa  159  7e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1609  aminoglycoside phosphotransferase  33.65 
 
 
319 aa  159  7e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1555  aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 
319 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200581  normal  0.346641 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1863  aminoglycoside phosphotransferase  35.58 
 
 
329 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0353182  normal  0.189268 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2483  aminoglycoside phosphotransferase  33.12 
 
 
323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0370489  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1959  aminoglycoside phosphotransferase  34.39 
 
 
331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2919  hypothetical protein  32.7 
 
 
316 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.695501  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3604  aminoglycoside phosphotransferase  34.89 
 
 
331 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252193  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1860  aminoglycoside phosphotransferase  33.04 
 
 
447 aa  138  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.257775  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3968  aminoglycoside phosphotransferase  32.09 
 
 
332 aa  137  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.574254  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5527  putative aminoglycoside phosphotransferase  34.06 
 
 
311 aa  129  8.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4584  aminoglycoside phosphotransferase  33.82 
 
 
475 aa  129  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3517  aminoglycoside phosphotransferase  32.14 
 
 
334 aa  122  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2913  aminoglycoside phosphotransferase  31.91 
 
 
325 aa  119  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.605881  normal  0.0304684 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0281  aminoglycoside phosphotransferase  31.23 
 
 
443 aa  114  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2501  aminoglycoside phosphotransferase  28.57 
 
 
346 aa  114  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113216 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0284  putative aminoglycoside phosphotransferase  26.09 
 
 
351 aa  95.1  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.846831  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  32.63 
 
 
352 aa  92.8  9e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  29.61 
 
 
339 aa  91.7  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  25.16 
 
 
364 aa  89.4  9e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1559  aminoglycoside phosphotransferase  25.53 
 
 
344 aa  87  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  27.39 
 
 
356 aa  85.9  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0182  aminoglycoside phosphotransferase  27.57 
 
 
339 aa  82  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2519  aminoglycoside phosphotransferase  28.74 
 
 
349 aa  82  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177703  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  30.8 
 
 
348 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2050  aminoglycoside phosphotransferase  29.41 
 
 
450 aa  81.3  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.299693  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3327  aminoglycoside phosphotransferase  26.77 
 
 
361 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1805  aminoglycoside phosphotransferase  29.43 
 
 
354 aa  79.7  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.726443  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1852  aminoglycoside phosphotransferase  29.43 
 
 
354 aa  79.7  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.906902  normal  0.283402 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1786  aminoglycoside phosphotransferase  29.43 
 
 
354 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0286679  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2658  aminoglycoside phosphotransferase  30.52 
 
 
348 aa  78.2  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  30.41 
 
 
348 aa  78.6  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4307  aminoglycoside phosphotransferase  28.7 
 
 
362 aa  78.6  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0855792  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2010  aminoglycoside phosphotransferase  25.44 
 
 
367 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0773583  normal  0.266634 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0116  aminoglycoside phosphotransferase  29.62 
 
 
379 aa  77.8  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  28.46 
 
 
315 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0927  aminoglycoside phosphotransferase  24.56 
 
 
351 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.993496  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1944  aminoglycoside phosphotransferase  27.6 
 
 
361 aa  77.4  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5287  aminoglycoside phosphotransferase  29.11 
 
 
353 aa  77.4  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599023  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2027  aminoglycoside phosphotransferase  25.44 
 
 
366 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2073  aminoglycoside phosphotransferase  25.44 
 
 
366 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1778  aminoglycoside phosphotransferase  27.6 
 
 
361 aa  77.4  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.221845  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  27.27 
 
 
348 aa  77  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1393  aminoglycoside phosphotransferase  28 
 
 
363 aa  77  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2476  aminoglycoside phosphotransferase  31.47 
 
 
338 aa  77  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000012289  decreased coverage  0.00166754 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2629  aminoglycoside phosphotransferase  25.71 
 
 
368 aa  76.6  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0566206  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  27.87 
 
 
358 aa  76.3  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  24.83 
 
 
352 aa  76.3  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1805  aminoglycoside phosphotransferase  23.86 
 
 
352 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4318  aminoglycoside phosphotransferase  27.58 
 
 
350 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136216  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6367  aminoglycoside phosphotransferase  31.61 
 
 
353 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7694  aminoglycoside phosphotransferase  29.68 
 
 
382 aa  75.5  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2209  aminoglycoside phosphotransferase  27.02 
 
 
350 aa  75.5  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375246  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3286  aminoglycoside phosphotransferase  26.02 
 
 
361 aa  75.1  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4407  aminoglycoside phosphotransferase  26.12 
 
 
340 aa  75.1  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.219591  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1505  aminoglycoside phosphotransferase  28.91 
 
 
358 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.290971  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1528  aminoglycoside phosphotransferase  28.91 
 
 
358 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1368  aminoglycoside phosphotransferase  27.55 
 
 
368 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544786  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1912  aminoglycoside phosphotransferase  26.38 
 
 
363 aa  73.9  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.143156  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  33.67 
 
 
344 aa  73.6  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  27.53 
 
 
346 aa  73.2  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5523  aminoglycoside phosphotransferase  26.47 
 
 
354 aa  73.2  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  27.53 
 
 
346 aa  73.2  0.000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0835  aminoglycoside phosphotransferase  27.84 
 
 
360 aa  72.8  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.407131  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  29.22 
 
 
356 aa  72.8  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3209  aminoglycoside phosphotransferase  25.4 
 
 
391 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79954  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2397  aminoglycoside phosphotransferase  28.12 
 
 
362 aa  72.4  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2064  aminoglycoside phosphotransferase  30.05 
 
 
361 aa  71.6  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449993  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2450  aminoglycoside phosphotransferase  25.69 
 
 
343 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3072  aminoglycoside phosphotransferase  24.6 
 
 
388 aa  71.2  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267154  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1847  aminoglycoside phosphotransferase  25 
 
 
362 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.00532112 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3076  aminoglycoside phosphotransferase  26.82 
 
 
361 aa  71.6  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.986116  normal  0.214027 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  28.83 
 
 
341 aa  72  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2171  aminoglycoside phosphotransferase  25 
 
 
362 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0620475  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  24.31 
 
 
353 aa  71.2  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3709  aminoglycoside phosphotransferase  25.1 
 
 
352 aa  70.5  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0164  aminoglycoside phosphotransferase  26.15 
 
 
357 aa  70.5  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1831  aminoglycoside phosphotransferase  31.19 
 
 
451 aa  70.5  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3187  putative tyrosine protein kinase/aminoglycoside phosphotransferase  26.61 
 
 
368 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7669  phosphotransferase family protein  30.93 
 
 
349 aa  69.7  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2028  aminoglycoside phosphotransferase  27.63 
 
 
350 aa  70.1  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00704541  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2016  hypothetical protein  26.02 
 
 
358 aa  69.7  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120817  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  25.25 
 
 
344 aa  69.7  0.00000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2960  aminoglycoside phosphotransferase  26.82 
 
 
363 aa  69.3  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  29.71 
 
 
354 aa  69.3  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  25 
 
 
359 aa  68.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1323  phosphotransferase enzyme family protein  27.27 
 
 
368 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1505  aminoglycoside phosphotransferase  28.91 
 
 
357 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1805  phosphotransferase enzyme family protein  27.27 
 
 
368 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113334  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1460  phosphotransferase family protein  27.27 
 
 
368 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  28.79 
 
 
338 aa  68.2  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3481  aminoglycoside phosphotransferase  27.27 
 
 
353 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0724682  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4129  aminoglycoside phosphotransferase  26.82 
 
 
358 aa  68.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.682336  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1154  phosphotransferase enzyme family protein  27.27 
 
 
368 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.119269  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>