222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2501 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2501  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 346 aa  707    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113216 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4407  aminoglycoside phosphotransferase  53.94 
 
 		 340 aa  333  3e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.219591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0284  putative aminoglycoside phosphotransferase  25.16 
 
 		 351 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.846831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2919  hypothetical protein  34.36 
 
 		 316 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.695501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3076  aminoglycoside phosphotransferase  32.89 
 
 		 337 aa  123  4e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.422792  normal  0.609725 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2483  aminoglycoside phosphotransferase  33.01 
 
 		 323 aa  119  6e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0370489  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2010  aminoglycoside phosphotransferase  27.63 
 
 		 367 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0773583  normal  0.266634 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4584  aminoglycoside phosphotransferase  31.87 
 
 		 475 aa  119  7e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2791  aminoglycoside phosphotransferase  28.57 
 
 		 376 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2027  aminoglycoside phosphotransferase  27.33 
 
 		 366 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2073  aminoglycoside phosphotransferase  27.33 
 
 		 366 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35990  FadE36, aminoglycoside phosphotransferase  29.39 
 
 		 398 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.139022  hitchhiker  0.0000000000000200155 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1863  aminoglycoside phosphotransferase  30.34 
 
 		 329 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0353182  normal  0.189268 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3604  aminoglycoside phosphotransferase  30.9 
 
 		 331 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1585  aminoglycoside phosphotransferase  30.42 
 
 		 319 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1609  aminoglycoside phosphotransferase  30.42 
 
 		 319 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3517  aminoglycoside phosphotransferase  48.67 
 
 		 334 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4452  aminoglycoside phosphotransferase  29.76 
 
 		 346 aa  105  9e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.744873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1555  aminoglycoside phosphotransferase  30.1 
 
 		 319 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200581  normal  0.346641 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1959  aminoglycoside phosphotransferase  29.62 
 
 		 331 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1860  aminoglycoside phosphotransferase  29.69 
 
 		 447 aa  100  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.257775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1505  aminoglycoside phosphotransferase  30.1 
 
 		 358 aa  99.8  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.290971  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1528  aminoglycoside phosphotransferase  30.1 
 
 		 358 aa  99.8  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0281  aminoglycoside phosphotransferase  30.03 
 
 		 443 aa  98.2  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4469  aminoglycoside phosphotransferase  29.49 
 
 		 323 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00940393 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1505  aminoglycoside phosphotransferase  30.1 
 
 		 357 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1891  aminoglycoside phosphotransferase  28.33 
 
 		 350 aa  94  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3968  aminoglycoside phosphotransferase  37.58 
 
 		 332 aa  90.5  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.574254  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  28.95 
 
 		 338 aa  87.4  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  29.39 
 
 		 356 aa  87  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  28.22 
 
 		 352 aa  86.3  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1035  aminoglycoside phosphotransferase  28.82 
 
 		 353 aa  85.5  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2913  aminoglycoside phosphotransferase  29.83 
 
 		 325 aa  85.9  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.605881  normal  0.0304684 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  28.71 
 
 		 341 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2658  aminoglycoside phosphotransferase  29.96 
 
 		 348 aa  85.1  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  29.73 
 
 		 354 aa  83.6  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  30.93 
 
 		 344 aa  82.8  0.000000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2476  aminoglycoside phosphotransferase  30.52 
 
 		 338 aa  82.8  0.000000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000012289  decreased coverage  0.00166754 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  28.57 
 
 		 348 aa  82.4  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  28.08 
 
 		 348 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  27.85 
 
 		 344 aa  80.5  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  27.07 
 
 		 315 aa  80.1  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  29.73 
 
 		 359 aa  80.1  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2397  aminoglycoside phosphotransferase  26.67 
 
 		 362 aa  80.1  0.00000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3709  aminoglycoside phosphotransferase  26.97 
 
 		 352 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  26.88 
 
 		 352 aa  78.2  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7669  phosphotransferase family protein  29.54 
 
 		 349 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  25.6 
 
 		 344 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  26.44 
 
 		 348 aa  78.2  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  27.95 
 
 		 356 aa  77.8  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3865  aminoglycoside phosphotransferase  31.09 
 
 		 350 aa  77.4  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0767712  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1003  aminoglycoside phosphotransferase  30.97 
 
 		 337 aa  77  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.083137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  28.57 
 
 		 352 aa  77  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  25.55 
 
 		 339 aa  76.6  0.0000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  27.8 
 
 		 352 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1831  aminoglycoside phosphotransferase  29.74 
 
 		 451 aa  76.3  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2903  aminoglycoside phosphotransferase  27.55 
 
 		 353 aa  75.9  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1393  aminoglycoside phosphotransferase  25.89 
 
 		 363 aa  75.5  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5523  aminoglycoside phosphotransferase  27.82 
 
 		 354 aa  75.5  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3214  aminoglycoside phosphotransferase  26.19 
 
 		 355 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.457678 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  29.54 
 
 		 338 aa  75.9  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  26.43 
 
 		 345 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3209  aminoglycoside phosphotransferase  28.25 
 
 		 391 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5527  putative aminoglycoside phosphotransferase  28.91 
 
 		 311 aa  74.7  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  28.95 
 
 		 346 aa  74.3  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  28.95 
 
 		 346 aa  73.9  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1910  aminoglycoside phosphotransferase  26.61 
 
 		 355 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0994  aminoglycoside phosphotransferase  29.44 
 
 		 358 aa  73.9  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.739164  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3559  aminoglycoside phosphotransferase  26.1 
 
 		 355 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595969  normal  0.25426 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3925  aminoglycoside phosphotransferase  24.92 
 
 		 355 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138496  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01993  predicted aminoglycoside phosphotransferase  26.17 
 
 		 380 aa  72.8  0.000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000191703  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0011  aminoglycoside phosphotransferase  27.31 
 
 		 337 aa  72  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477677  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2519  aminoglycoside phosphotransferase  26.33 
 
 		 349 aa  72.4  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  28.8 
 
 		 343 aa  72  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1186  aminoglycoside phosphotransferase  24.61 
 
 		 429 aa  72  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.161649  normal  0.0723481 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2908  aminoglycoside phosphotransferase  28.38 
 
 		 347 aa  71.2  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.1681 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1559  aminoglycoside phosphotransferase  24.23 
 
 		 344 aa  72  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1108  aminoglycoside phosphotransferase  26.57 
 
 		 362 aa  71.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0894  aminoglycoside phosphotransferase  39.45 
 
 		 459 aa  71.6  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.184458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5287  aminoglycoside phosphotransferase  30.57 
 
 		 353 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599023  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  23.81 
 
 		 344 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40103  predicted protein  25.21 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2050  aminoglycoside phosphotransferase  55 
 
 		 450 aa  70.1  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.299693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3286  aminoglycoside phosphotransferase  24.68 
 
 		 361 aa  70.1  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1368  aminoglycoside phosphotransferase  27.87 
 
 		 368 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544786  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1248  aminoglycoside phosphotransferase  26.32 
 
 		 354 aa  70.1  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.437649  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3481  aminoglycoside phosphotransferase  28 
 
 		 353 aa  69.7  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0724682  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1805  phosphotransferase enzyme family protein  27.9 
 
 		 368 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113334  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1460  phosphotransferase family protein  27.9 
 
 		 368 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0437  phosphotransferase enzyme family protein  27.9 
 
 		 368 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2216  aminoglycoside phosphotransferase  24.51 
 
 		 355 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1154  phosphotransferase enzyme family protein  27.9 
 
 		 368 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.119269  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0714  phosphotransferase enzyme family protein  27.9 
 
 		 368 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.701125  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1323  phosphotransferase enzyme family protein  27.9 
 
 		 368 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2810  aminoglycoside phosphotransferase  26.29 
 
 		 336 aa  69.3  0.00000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541387  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2724  hypothetical protein  24.91 
 
 		 355 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6367  aminoglycoside phosphotransferase  29.52 
 
 		 353 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0624  aminoglycoside phosphotransferase  29.88 
 
 		 355 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2337  aminoglycoside phosphotransferase  26.03 
 
 		 353 aa  68.9  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0625  aminoglycoside phosphotransferase  26.87 
 
 		 354 aa  68.9  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.149436 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>