233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2919 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_2919  hypothetical protein  100 
 
 
316 aa  632  1e-180  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.695501  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1863  aminoglycoside phosphotransferase  79.03 
 
 
329 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0353182  normal  0.189268 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1959  aminoglycoside phosphotransferase  77.81 
 
 
331 aa  488  1e-137  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3604  aminoglycoside phosphotransferase  75.24 
 
 
331 aa  475  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252193  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3076  aminoglycoside phosphotransferase  63.38 
 
 
337 aa  389  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.422792  normal  0.609725 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3517  aminoglycoside phosphotransferase  56.05 
 
 
334 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2913  aminoglycoside phosphotransferase  53.38 
 
 
325 aa  291  7e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.605881  normal  0.0304684 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2483  aminoglycoside phosphotransferase  48.11 
 
 
323 aa  227  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0370489  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1860  aminoglycoside phosphotransferase  43.87 
 
 
447 aa  223  4e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.257775  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3968  aminoglycoside phosphotransferase  46.44 
 
 
332 aa  219  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.574254  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4584  aminoglycoside phosphotransferase  44.52 
 
 
475 aa  198  1.0000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1585  aminoglycoside phosphotransferase  40.63 
 
 
319 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1609  aminoglycoside phosphotransferase  40.63 
 
 
319 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5527  putative aminoglycoside phosphotransferase  39.43 
 
 
311 aa  181  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1555  aminoglycoside phosphotransferase  40.32 
 
 
319 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200581  normal  0.346641 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0281  aminoglycoside phosphotransferase  40.68 
 
 
443 aa  179  5.999999999999999e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4469  aminoglycoside phosphotransferase  38.73 
 
 
323 aa  172  9e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00940393 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4452  aminoglycoside phosphotransferase  34.26 
 
 
346 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.744873  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1891  aminoglycoside phosphotransferase  34.63 
 
 
350 aa  157  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2791  aminoglycoside phosphotransferase  32.7 
 
 
376 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35990  FadE36, aminoglycoside phosphotransferase  31.63 
 
 
398 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.139022  hitchhiker  0.0000000000000200155 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2501  aminoglycoside phosphotransferase  34.36 
 
 
346 aa  118  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113216 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4407  aminoglycoside phosphotransferase  29.93 
 
 
340 aa  109  7.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.219591  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  24.7 
 
 
344 aa  92  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  28.53 
 
 
346 aa  91.7  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0011  aminoglycoside phosphotransferase  26.62 
 
 
337 aa  90.1  4e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477677  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  28.21 
 
 
346 aa  90.1  5e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1505  aminoglycoside phosphotransferase  32.24 
 
 
358 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.290971  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1528  aminoglycoside phosphotransferase  32.24 
 
 
358 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1505  aminoglycoside phosphotransferase  30.71 
 
 
357 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  25.4 
 
 
352 aa  82  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0284  putative aminoglycoside phosphotransferase  27.42 
 
 
351 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.846831  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2908  aminoglycoside phosphotransferase  30.68 
 
 
347 aa  80.9  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.1681 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0894  aminoglycoside phosphotransferase  42.06 
 
 
459 aa  79.7  0.00000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.184458  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2397  aminoglycoside phosphotransferase  28.34 
 
 
362 aa  79.3  0.00000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  29.25 
 
 
344 aa  78.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  29.05 
 
 
356 aa  78.6  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5287  aminoglycoside phosphotransferase  28.62 
 
 
353 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599023  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  27.6 
 
 
344 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  28.42 
 
 
315 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1559  aminoglycoside phosphotransferase  25.08 
 
 
344 aa  77.4  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2658  aminoglycoside phosphotransferase  29.28 
 
 
348 aa  77.4  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0116  aminoglycoside phosphotransferase  27.81 
 
 
379 aa  76.6  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  29.02 
 
 
358 aa  76.6  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6367  aminoglycoside phosphotransferase  27.97 
 
 
353 aa  76.3  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1108  aminoglycoside phosphotransferase  28.35 
 
 
362 aa  75.9  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2010  aminoglycoside phosphotransferase  29.15 
 
 
367 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0773583  normal  0.266634 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  28.62 
 
 
344 aa  74.7  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2027  aminoglycoside phosphotransferase  29.15 
 
 
366 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2073  aminoglycoside phosphotransferase  29.15 
 
 
366 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2202  aminoglycoside phosphotransferase  25.97 
 
 
354 aa  74.3  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0249474  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5046  aminoglycoside phosphotransferase  29.69 
 
 
342 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  28.42 
 
 
348 aa  73.9  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3038  aminoglycoside phosphotransferase  29.49 
 
 
343 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145633  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0625  aminoglycoside phosphotransferase  29.22 
 
 
354 aa  73.6  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.149436 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0164  aminoglycoside phosphotransferase  25.7 
 
 
357 aa  73.9  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0634  aminoglycoside phosphotransferase  25.87 
 
 
370 aa  73.2  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4307  aminoglycoside phosphotransferase  28.4 
 
 
362 aa  72.8  0.000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0855792  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0222  aminoglycoside phosphotransferase  28.08 
 
 
355 aa  72  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.193801  normal  0.0244768 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0618  putative phosphotransferase  28.67 
 
 
350 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172758  normal  0.0703036 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1186  aminoglycoside phosphotransferase  25.84 
 
 
429 aa  72.4  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.161649  normal  0.0723481 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5523  aminoglycoside phosphotransferase  26.01 
 
 
354 aa  72  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0182  aminoglycoside phosphotransferase  30.3 
 
 
339 aa  72.4  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2216  aminoglycoside phosphotransferase  25.82 
 
 
355 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1003  aminoglycoside phosphotransferase  31.25 
 
 
337 aa  72  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.083137  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1885  aminoglycoside phosphotransferase  29.03 
 
 
347 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  28.38 
 
 
354 aa  72  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  28.17 
 
 
352 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1007  aminoglycoside phosphotransferase  25.32 
 
 
358 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  28.75 
 
 
348 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2810  aminoglycoside phosphotransferase  26.89 
 
 
336 aa  71.6  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541387  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2064  aminoglycoside phosphotransferase  35.81 
 
 
361 aa  71.2  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449993  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  28.7 
 
 
353 aa  70.9  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1149  aminoglycoside phosphotransferase  29.06 
 
 
337 aa  70.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3218  aminoglycoside phosphotransferase  29.49 
 
 
343 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  28.19 
 
 
364 aa  70.5  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  27.94 
 
 
359 aa  70.5  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5019  aminoglycoside phosphotransferase  29 
 
 
343 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5841  aminoglycoside phosphotransferase  29 
 
 
343 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2016  hypothetical protein  25 
 
 
358 aa  69.7  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120817  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4576  aminoglycoside phosphotransferase  29.49 
 
 
357 aa  69.7  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0972  aminoglycoside phosphotransferase  25.24 
 
 
358 aa  69.3  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0454764 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01993  predicted aminoglycoside phosphotransferase  25.24 
 
 
380 aa  68.9  0.00000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000191703  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2209  aminoglycoside phosphotransferase  27.33 
 
 
350 aa  68.9  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375246  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6405  aminoglycoside phosphotransferase  28.76 
 
 
343 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0471  aminoglycoside phosphotransferase  25.34 
 
 
403 aa  68.6  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  29.91 
 
 
343 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5078  aminoglycoside phosphotransferase  29.49 
 
 
357 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114652  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  28.51 
 
 
345 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3327  aminoglycoside phosphotransferase  25.64 
 
 
361 aa  67.8  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4338  aminoglycoside phosphotransferase  28.57 
 
 
343 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3590  aminoglycoside phosphotransferase  32.72 
 
 
370 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  34.06 
 
 
348 aa  68.2  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0835  aminoglycoside phosphotransferase  29.13 
 
 
360 aa  68.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.407131  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1478  aminoglycoside phosphotransferase  31.33 
 
 
353 aa  67.4  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3187  putative tyrosine protein kinase/aminoglycoside phosphotransferase  25 
 
 
368 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1944  aminoglycoside phosphotransferase  25.9 
 
 
361 aa  67  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1393  aminoglycoside phosphotransferase  26.21 
 
 
363 aa  67.8  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2050  aminoglycoside phosphotransferase  34.59 
 
 
450 aa  67  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.299693  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  25.38 
 
 
356 aa  67  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>