236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3517 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3517  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 334 aa  664    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3076  aminoglycoside phosphotransferase  58.41 
 
 		 337 aa  358  6e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.422792  normal  0.609725 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1863  aminoglycoside phosphotransferase  55.76 
 
 		 329 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0353182  normal  0.189268 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3604  aminoglycoside phosphotransferase  54.77 
 
 		 331 aa  328  9e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1959  aminoglycoside phosphotransferase  55.84 
 
 		 331 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2919  hypothetical protein  56.05 
 
 		 316 aa  325  6e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.695501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2913  aminoglycoside phosphotransferase  52.58 
 
 		 325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.605881  normal  0.0304684 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1860  aminoglycoside phosphotransferase  44.73 
 
 		 447 aa  224  1e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.257775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5527  putative aminoglycoside phosphotransferase  43.59 
 
 		 311 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2483  aminoglycoside phosphotransferase  45.91 
 
 		 323 aa  218  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0370489  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3968  aminoglycoside phosphotransferase  45.43 
 
 		 332 aa  211  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.574254  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4469  aminoglycoside phosphotransferase  41.64 
 
 		 323 aa  192  5e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00940393 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4584  aminoglycoside phosphotransferase  41.74 
 
 		 475 aa  186  5e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1585  aminoglycoside phosphotransferase  40.19 
 
 		 319 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1609  aminoglycoside phosphotransferase  40.19 
 
 		 319 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1555  aminoglycoside phosphotransferase  39.87 
 
 		 319 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200581  normal  0.346641 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1891  aminoglycoside phosphotransferase  39.27 
 
 		 350 aa  176  4e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0281  aminoglycoside phosphotransferase  40.32 
 
 		 443 aa  172  7.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4452  aminoglycoside phosphotransferase  37.5 
 
 		 346 aa  169  8e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.744873  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2791  aminoglycoside phosphotransferase  32.14 
 
 		 376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35990  FadE36, aminoglycoside phosphotransferase  31.79 
 
 		 398 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.139022  hitchhiker  0.0000000000000200155 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4407  aminoglycoside phosphotransferase  32.11 
 
 		 340 aa  108  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.219591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2501  aminoglycoside phosphotransferase  48.67 
 
 		 346 aa  98.6  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113216 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0894  aminoglycoside phosphotransferase  39.36 
 
 		 459 aa  94.7  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.184458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5523  aminoglycoside phosphotransferase  32.49 
 
 		 354 aa  85.1  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1505  aminoglycoside phosphotransferase  30.71 
 
 		 358 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.290971  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1528  aminoglycoside phosphotransferase  30.71 
 
 		 358 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0011  aminoglycoside phosphotransferase  30.29 
 
 		 337 aa  85.5  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477677  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0471  aminoglycoside phosphotransferase  29.21 
 
 		 403 aa  84.7  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1881  aminoglycoside phosphotransferase  32.23 
 
 		 327 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.465558  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0618  putative phosphotransferase  28.98 
 
 		 350 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172758  normal  0.0703036 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1505  aminoglycoside phosphotransferase  31.12 
 
 		 357 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0284  putative aminoglycoside phosphotransferase  38.71 
 
 		 351 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.846831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1901  aminoglycoside phosphotransferase  31.82 
 
 		 327 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.05669  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1947  aminoglycoside phosphotransferase  31.82 
 
 		 327 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  27.85 
 
 		 346 aa  74.7  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0116  aminoglycoside phosphotransferase  30.13 
 
 		 379 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  27.85 
 
 		 346 aa  74.7  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  26.64 
 
 		 344 aa  73.2  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0370  aminoglycoside phosphotransferase  28.1 
 
 		 345 aa  72.8  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.380981  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  35.53 
 
 		 348 aa  72.4  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  30.55 
 
 		 348 aa  72.4  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3038  aminoglycoside phosphotransferase  29.84 
 
 		 343 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3218  aminoglycoside phosphotransferase  29.03 
 
 		 343 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  28.39 
 
 		 344 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  31.2 
 
 		 345 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4576  aminoglycoside phosphotransferase  31.14 
 
 		 357 aa  70.9  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5019  aminoglycoside phosphotransferase  29.03 
 
 		 343 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5078  aminoglycoside phosphotransferase  29.03 
 
 		 357 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5841  aminoglycoside phosphotransferase  29.03 
 
 		 343 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2171  aminoglycoside phosphotransferase  30.98 
 
 		 362 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0620475  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1186  aminoglycoside phosphotransferase  27 
 
 		 429 aa  70.5  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.161649  normal  0.0723481 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1478  aminoglycoside phosphotransferase  29.83 
 
 		 353 aa  70.1  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4338  aminoglycoside phosphotransferase  29.03 
 
 		 343 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  28.02 
 
 		 352 aa  70.1  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5046  aminoglycoside phosphotransferase  29.25 
 
 		 342 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1393  aminoglycoside phosphotransferase  27.39 
 
 		 363 aa  69.7  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1847  aminoglycoside phosphotransferase  30.43 
 
 		 362 aa  69.3  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.00532112 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2010  aminoglycoside phosphotransferase  26.6 
 
 		 367 aa  69.7  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0773583  normal  0.266634 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0634  aminoglycoside phosphotransferase  26.37 
 
 		 370 aa  69.3  0.00000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1912  aminoglycoside phosphotransferase  30.69 
 
 		 363 aa  69.3  0.00000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.143156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  36.28 
 
 		 344 aa  68.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  30.03 
 
 		 356 aa  68.9  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2027  aminoglycoside phosphotransferase  26.6 
 
 		 366 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2073  aminoglycoside phosphotransferase  26.6 
 
 		 366 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  27.97 
 
 		 344 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3590  aminoglycoside phosphotransferase  30.87 
 
 		 370 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  28.63 
 
 		 343 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  28.21 
 
 		 353 aa  68.2  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3076  aminoglycoside phosphotransferase  31.61 
 
 		 361 aa  67.8  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.986116  normal  0.214027 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4307  aminoglycoside phosphotransferase  31.28 
 
 		 362 aa  68.2  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0855792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0972  aminoglycoside phosphotransferase  32.97 
 
 		 358 aa  67.4  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0454764 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2050  aminoglycoside phosphotransferase  31.71 
 
 		 450 aa  67.4  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.299693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4490  aminoglycoside phosphotransferase  28.39 
 
 		 344 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1786  aminoglycoside phosphotransferase  28.91 
 
 		 354 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0286679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1805  aminoglycoside phosphotransferase  28.91 
 
 		 354 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.726443  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1852  aminoglycoside phosphotransferase  28.91 
 
 		 354 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.906902  normal  0.283402 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2016  hypothetical protein  31.02 
 
 		 358 aa  66.6  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120817  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  26.09 
 
 		 356 aa  66.6  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3925  aminoglycoside phosphotransferase  27.43 
 
 		 355 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138496  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1944  aminoglycoside phosphotransferase  28.14 
 
 		 361 aa  66.2  0.0000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1778  aminoglycoside phosphotransferase  28.14 
 
 		 361 aa  65.9  0.0000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.221845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1910  aminoglycoside phosphotransferase  27.43 
 
 		 355 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1007  aminoglycoside phosphotransferase  29.57 
 
 		 358 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5287  aminoglycoside phosphotransferase  27.21 
 
 		 353 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599023  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44815  predicted protein  26.94 
 
 		 401 aa  65.5  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3327  aminoglycoside phosphotransferase  29 
 
 		 361 aa  65.5  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3559  aminoglycoside phosphotransferase  27.39 
 
 		 355 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595969  normal  0.25426 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6367  aminoglycoside phosphotransferase  30.58 
 
 		 353 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6405  aminoglycoside phosphotransferase  30.43 
 
 		 343 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4318  aminoglycoside phosphotransferase  28.21 
 
 		 350 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2216  aminoglycoside phosphotransferase  27.91 
 
 		 355 aa  64.7  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1035  aminoglycoside phosphotransferase  28.17 
 
 		 353 aa  64.3  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  26.03 
 
 		 359 aa  64.3  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  27.97 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3286  aminoglycoside phosphotransferase  30.39 
 
 		 361 aa  64.3  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2810  aminoglycoside phosphotransferase  28.4 
 
 		 336 aa  63.9  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2960  aminoglycoside phosphotransferase  31.22 
 
 		 363 aa  63.9  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  30.35 
 
 		 359 aa  63.9  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  27.89 
 
 		 352 aa  63.5  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>