224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3590 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3590  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 370 aa  712    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17900  predicted aminoglycoside phosphotransferase  57.14 
 
 		 323 aa  313  2.9999999999999996e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.215694  normal  0.505418 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1901  aminoglycoside phosphotransferase  39.48 
 
 		 327 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.05669  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1947  aminoglycoside phosphotransferase  39.48 
 
 		 327 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1881  aminoglycoside phosphotransferase  39.48 
 
 		 327 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.465558  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4570  aminoglycoside phosphotransferase  37.77 
 
 		 362 aa  140  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.303984  normal  0.410057 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  33.86 
 
 		 339 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  31.76 
 
 		 354 aa  108  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  32.65 
 
 		 341 aa  107  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5523  aminoglycoside phosphotransferase  29.97 
 
 		 354 aa  107  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  31.75 
 
 		 356 aa  107  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  29.71 
 
 		 338 aa  106  6e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3865  aminoglycoside phosphotransferase  32.33 
 
 		 350 aa  104  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0767712  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  32.03 
 
 		 348 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4000  aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 		 347 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2010  aminoglycoside phosphotransferase  33.13 
 
 		 367 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0773583  normal  0.266634 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2027  aminoglycoside phosphotransferase  33.13 
 
 		 366 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  31.61 
 
 		 344 aa  100  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2073  aminoglycoside phosphotransferase  33.13 
 
 		 366 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4518  aminoglycoside phosphotransferase  29.33 
 
 		 339 aa  97.8  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  30.18 
 
 		 315 aa  95.1  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3209  aminoglycoside phosphotransferase  28.74 
 
 		 391 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1885  aminoglycoside phosphotransferase  30.82 
 
 		 347 aa  93.6  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1035  aminoglycoside phosphotransferase  29.04 
 
 		 353 aa  92.4  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2903  aminoglycoside phosphotransferase  29.36 
 
 		 353 aa  92.8  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  28.05 
 
 		 352 aa  91.7  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2397  aminoglycoside phosphotransferase  32.3 
 
 		 362 aa  91.7  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0222  aminoglycoside phosphotransferase  32.3 
 
 		 355 aa  92  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.193801  normal  0.0244768 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  26.1 
 
 		 356 aa  91.7  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  28.09 
 
 		 338 aa  90.9  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2810  aminoglycoside phosphotransferase  27.87 
 
 		 336 aa  90.9  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  27.19 
 
 		 352 aa  90.1  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  28.19 
 
 		 352 aa  89.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  30.64 
 
 		 344 aa  89  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  31.49 
 
 		 352 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3072  aminoglycoside phosphotransferase  25.55 
 
 		 388 aa  87.4  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0164  aminoglycoside phosphotransferase  28.71 
 
 		 357 aa  86.7  6e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2658  aminoglycoside phosphotransferase  27.76 
 
 		 348 aa  86.7  6e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2202  aminoglycoside phosphotransferase  25.83 
 
 		 354 aa  86.7  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0249474  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2519  aminoglycoside phosphotransferase  31.1 
 
 		 349 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3481  aminoglycoside phosphotransferase  26.83 
 
 		 353 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0724682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1149  aminoglycoside phosphotransferase  29.55 
 
 		 337 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0011  aminoglycoside phosphotransferase  26.94 
 
 		 337 aa  84.7  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477677  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2209  aminoglycoside phosphotransferase  30 
 
 		 350 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375246  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1248  aminoglycoside phosphotransferase  24.93 
 
 		 354 aa  85.1  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.437649  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  29.24 
 
 		 346 aa  84.3  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  29.24 
 
 		 346 aa  84  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  29.49 
 
 		 353 aa  83.6  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4576  aminoglycoside phosphotransferase  28.57 
 
 		 357 aa  83.6  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3748  aminoglycoside phosphotransferase  26.46 
 
 		 350 aa  82.8  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6361  aminoglycoside phosphotransferase  28.7 
 
 		 342 aa  82.8  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00784596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  27.89 
 
 		 345 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1108  aminoglycoside phosphotransferase  28.96 
 
 		 362 aa  81.6  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  29.5 
 
 		 358 aa  81.3  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2908  aminoglycoside phosphotransferase  31.65 
 
 		 347 aa  81.6  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.1681 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3709  aminoglycoside phosphotransferase  26.49 
 
 		 352 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6405  aminoglycoside phosphotransferase  29.94 
 
 		 343 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1885  aminoglycoside phosphotransferase  27 
 
 		 354 aa  80.9  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  24.22 
 
 		 344 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1003  aminoglycoside phosphotransferase  34.55 
 
 		 337 aa  80.9  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.083137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0116  aminoglycoside phosphotransferase  27.04 
 
 		 379 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  27.81 
 
 		 343 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0994  aminoglycoside phosphotransferase  25.5 
 
 		 358 aa  80.5  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.739164  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1847  aminoglycoside phosphotransferase  27.33 
 
 		 362 aa  80.1  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.00532112 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1018  aminoglycoside phosphotransferase  30.35 
 
 		 358 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7669  phosphotransferase family protein  30.06 
 
 		 349 aa  80.1  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1805  aminoglycoside phosphotransferase  24.24 
 
 		 352 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18680  predicted aminoglycoside phosphotransferase  31.71 
 
 		 357 aa  80.1  0.00000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.571289 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4318  aminoglycoside phosphotransferase  27.16 
 
 		 350 aa  79.7  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3736  aminoglycoside phosphotransferase  26.46 
 
 		 350 aa  79.7  0.00000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3809  aminoglycoside phosphotransferase  26.46 
 
 		 350 aa  79.7  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.274581 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2171  aminoglycoside phosphotransferase  27.33 
 
 		 362 aa  79.3  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0620475  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2064  aminoglycoside phosphotransferase  26.17 
 
 		 361 aa  79.3  0.00000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449993  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2016  hypothetical protein  26.73 
 
 		 358 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120817  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  28.74 
 
 		 364 aa  79  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1831  aminoglycoside phosphotransferase  27.93 
 
 		 451 aa  79  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0634  aminoglycoside phosphotransferase  24.01 
 
 		 370 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  26.87 
 
 		 348 aa  78.2  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1459  aminoglycoside phosphotransferase  25.16 
 
 		 354 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.049097  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0182  aminoglycoside phosphotransferase  29.77 
 
 		 339 aa  77.8  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2476  aminoglycoside phosphotransferase  28.3 
 
 		 338 aa  77.8  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000012289  decreased coverage  0.00166754 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3076  aminoglycoside phosphotransferase  29.93 
 
 		 337 aa  77.8  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.422792  normal  0.609725 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5287  aminoglycoside phosphotransferase  27.34 
 
 		 353 aa  77.4  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599023  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1559  aminoglycoside phosphotransferase  25.42 
 
 		 344 aa  77.4  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  26.71 
 
 		 359 aa  77  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1186  aminoglycoside phosphotransferase  22.25 
 
 		 429 aa  77  0.0000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.161649  normal  0.0723481 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1393  aminoglycoside phosphotransferase  24.86 
 
 		 363 aa  77  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3076  aminoglycoside phosphotransferase  27.18 
 
 		 361 aa  77  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.986116  normal  0.214027 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1007  aminoglycoside phosphotransferase  25.58 
 
 		 358 aa  76.6  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3187  putative tyrosine protein kinase/aminoglycoside phosphotransferase  26.67 
 
 		 368 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0618  putative phosphotransferase  28.26 
 
 		 350 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172758  normal  0.0703036 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  26.27 
 
 		 344 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5078  aminoglycoside phosphotransferase  28.53 
 
 		 357 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3218  aminoglycoside phosphotransferase  28.21 
 
 		 343 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  26.65 
 
 		 348 aa  75.1  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2652  aminoglycoside phosphotransferase  29.5 
 
 		 353 aa  74.3  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000355622  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1706  aminoglycoside phosphotransferase  28.47 
 
 		 355 aa  74.7  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.9599  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2337  aminoglycoside phosphotransferase  28.05 
 
 		 353 aa  74.7  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0927  aminoglycoside phosphotransferase  26.15 
 
 		 351 aa  74.7  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.993496  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5046  aminoglycoside phosphotransferase  29.01 
 
 		 342 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.895104 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>