233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1959 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1959  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 331 aa  660    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3604  aminoglycoside phosphotransferase  86.4 
 
 		 331 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1863  aminoglycoside phosphotransferase  81.65 
 
 		 329 aa  548  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0353182  normal  0.189268 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2919  hypothetical protein  77.81 
 
 		 316 aa  489  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.695501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3076  aminoglycoside phosphotransferase  63.8 
 
 		 337 aa  395  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.422792  normal  0.609725 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3517  aminoglycoside phosphotransferase  55.84 
 
 		 334 aa  310  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2913  aminoglycoside phosphotransferase  49.69 
 
 		 325 aa  278  9e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.605881  normal  0.0304684 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2483  aminoglycoside phosphotransferase  45.98 
 
 		 323 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0370489  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1860  aminoglycoside phosphotransferase  43.12 
 
 		 447 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.257775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3968  aminoglycoside phosphotransferase  45.37 
 
 		 332 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.574254  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4584  aminoglycoside phosphotransferase  42.19 
 
 		 475 aa  192  8e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1585  aminoglycoside phosphotransferase  39.49 
 
 		 319 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1609  aminoglycoside phosphotransferase  39.49 
 
 		 319 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5527  putative aminoglycoside phosphotransferase  38.66 
 
 		 311 aa  179  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1555  aminoglycoside phosphotransferase  39.17 
 
 		 319 aa  179  8e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200581  normal  0.346641 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4469  aminoglycoside phosphotransferase  38.41 
 
 		 323 aa  175  9e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00940393 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0281  aminoglycoside phosphotransferase  37.06 
 
 		 443 aa  172  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1891  aminoglycoside phosphotransferase  35.01 
 
 		 350 aa  163  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4452  aminoglycoside phosphotransferase  33.54 
 
 		 346 aa  159  9e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.744873  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2791  aminoglycoside phosphotransferase  34.39 
 
 		 376 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35990  FadE36, aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 		 398 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.139022  hitchhiker  0.0000000000000200155 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4407  aminoglycoside phosphotransferase  29.59 
 
 		 340 aa  114  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.219591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2501  aminoglycoside phosphotransferase  29.62 
 
 		 346 aa  100  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113216 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  29.66 
 
 		 346 aa  94.4  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  29.66 
 
 		 346 aa  94  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  25.07 
 
 		 344 aa  93.2  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0894  aminoglycoside phosphotransferase  38.04 
 
 		 459 aa  89.7  6e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.184458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  30.36 
 
 		 358 aa  89.4  9e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1505  aminoglycoside phosphotransferase  31.27 
 
 		 358 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.290971  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1528  aminoglycoside phosphotransferase  31.27 
 
 		 358 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0011  aminoglycoside phosphotransferase  28.48 
 
 		 337 aa  87.4  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477677  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2202  aminoglycoside phosphotransferase  26.9 
 
 		 354 aa  85.9  9e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0249474  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4576  aminoglycoside phosphotransferase  31.17 
 
 		 357 aa  85.9  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  31.23 
 
 		 348 aa  85.5  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0182  aminoglycoside phosphotransferase  29.17 
 
 		 339 aa  83.6  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1505  aminoglycoside phosphotransferase  31.62 
 
 		 357 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0116  aminoglycoside phosphotransferase  30.67 
 
 		 379 aa  83.6  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1003  aminoglycoside phosphotransferase  32.13 
 
 		 337 aa  83.2  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.083137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2908  aminoglycoside phosphotransferase  28.92 
 
 		 347 aa  83.2  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.1681 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5046  aminoglycoside phosphotransferase  30.87 
 
 		 342 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1368  aminoglycoside phosphotransferase  26.28 
 
 		 368 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544786  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2397  aminoglycoside phosphotransferase  26.73 
 
 		 362 aa  82.4  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  29.54 
 
 		 315 aa  82  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0471  aminoglycoside phosphotransferase  28.38 
 
 		 403 aa  81.6  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  25.45 
 
 		 352 aa  80.5  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5287  aminoglycoside phosphotransferase  28.07 
 
 		 353 aa  80.1  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599023  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1559  aminoglycoside phosphotransferase  25.08 
 
 		 344 aa  80.5  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  28.03 
 
 		 344 aa  79.7  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0625  aminoglycoside phosphotransferase  30.15 
 
 		 354 aa  79.3  0.00000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.149436 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  26.83 
 
 		 356 aa  79.7  0.00000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  27.64 
 
 		 345 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3038  aminoglycoside phosphotransferase  31.15 
 
 		 343 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0634  aminoglycoside phosphotransferase  26.45 
 
 		 370 aa  79.3  0.00000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0222  aminoglycoside phosphotransferase  27.99 
 
 		 355 aa  79.3  0.00000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.193801  normal  0.0244768 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3218  aminoglycoside phosphotransferase  31.15 
 
 		 343 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1186  aminoglycoside phosphotransferase  29 
 
 		 429 aa  79  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.161649  normal  0.0723481 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6367  aminoglycoside phosphotransferase  27.14 
 
 		 353 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3187  putative tyrosine protein kinase/aminoglycoside phosphotransferase  25.68 
 
 		 368 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2683  aminoglycoside phosphotransferase-like protein  30.4 
 
 		 372 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.124499  normal  0.283498 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2658  aminoglycoside phosphotransferase  28.81 
 
 		 348 aa  77.8  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5019  aminoglycoside phosphotransferase  31.15 
 
 		 343 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5841  aminoglycoside phosphotransferase  31.15 
 
 		 343 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  27.91 
 
 		 359 aa  77  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  29.93 
 
 		 354 aa  77  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5523  aminoglycoside phosphotransferase  26.13 
 
 		 354 aa  77  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  27.92 
 
 		 344 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3467  hypothetical protein  27.81 
 
 		 356 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4307  aminoglycoside phosphotransferase  27.73 
 
 		 362 aa  76.3  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0855792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  29.69 
 
 		 344 aa  75.9  0.0000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5078  aminoglycoside phosphotransferase  31.62 
 
 		 357 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114652  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2016  hypothetical protein  24.39 
 
 		 358 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120817  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2064  aminoglycoside phosphotransferase  29.34 
 
 		 361 aa  75.1  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40880  hypothetical protein  31 
 
 		 356 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2457  aminoglycoside phosphotransferase  27.06 
 
 		 355 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00764802 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  28.37 
 
 		 356 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4338  aminoglycoside phosphotransferase  30.74 
 
 		 343 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5718  aminoglycoside phosphotransferase  30.22 
 
 		 343 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3418  aminoglycoside phosphotransferase  26.58 
 
 		 355 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.949755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1459  aminoglycoside phosphotransferase  26.85 
 
 		 354 aa  73.9  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.049097  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1952  hypothetical protein  27.73 
 
 		 363 aa  73.6  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.126845 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1149  aminoglycoside phosphotransferase  28.88 
 
 		 337 aa  73.6  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2216  aminoglycoside phosphotransferase  26.69 
 
 		 355 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  30.04 
 
 		 353 aa  73.6  0.000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2171  aminoglycoside phosphotransferase  24.09 
 
 		 362 aa  73.6  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0620475  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0284  putative aminoglycoside phosphotransferase  27.06 
 
 		 351 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.846831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  29.39 
 
 		 343 aa  72  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  29.2 
 
 		 344 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2075  aminoglycoside phosphotransferase  27.1 
 
 		 355 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0283964  normal  0.0813065 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  28.87 
 
 		 339 aa  71.6  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1706  aminoglycoside phosphotransferase  29.66 
 
 		 355 aa  71.6  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.9599  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1847  aminoglycoside phosphotransferase  23.73 
 
 		 362 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.00532112 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1986  aminoglycoside phosphotransferase  26.3 
 
 		 368 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1108  aminoglycoside phosphotransferase  27.63 
 
 		 362 aa  70.9  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1035  aminoglycoside phosphotransferase  24.91 
 
 		 353 aa  70.5  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  35.51 
 
 		 348 aa  70.5  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3590  aminoglycoside phosphotransferase  37.17 
 
 		 370 aa  70.5  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6405  aminoglycoside phosphotransferase  30.57 
 
 		 343 aa  70.1  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2050  aminoglycoside phosphotransferase  28.83 
 
 		 450 aa  70.1  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.299693  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  27.19 
 
 		 348 aa  70.1  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4490  aminoglycoside phosphotransferase  27.97 
 
 		 344 aa  69.7  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>