235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5527 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5527  putative aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 311 aa  631  1e-180  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3517  aminoglycoside phosphotransferase  44.87 
 
 		 334 aa  242  6e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3076  aminoglycoside phosphotransferase  41.37 
 
 		 337 aa  239  5.999999999999999e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.422792  normal  0.609725 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2919  hypothetical protein  40.06 
 
 		 316 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.695501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1959  aminoglycoside phosphotransferase  38.98 
 
 		 331 aa  208  7e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2913  aminoglycoside phosphotransferase  40.52 
 
 		 325 aa  208  9e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.605881  normal  0.0304684 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3604  aminoglycoside phosphotransferase  38.59 
 
 		 331 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2483  aminoglycoside phosphotransferase  39.74 
 
 		 323 aa  206  3e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0370489  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1863  aminoglycoside phosphotransferase  39.22 
 
 		 329 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0353182  normal  0.189268 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3968  aminoglycoside phosphotransferase  37.85 
 
 		 332 aa  188  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.574254  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1860  aminoglycoside phosphotransferase  34.73 
 
 		 447 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.257775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4584  aminoglycoside phosphotransferase  34.6 
 
 		 475 aa  168  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4452  aminoglycoside phosphotransferase  35.6 
 
 		 346 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.744873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1585  aminoglycoside phosphotransferase  35.46 
 
 		 319 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1609  aminoglycoside phosphotransferase  35.46 
 
 		 319 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4469  aminoglycoside phosphotransferase  35.05 
 
 		 323 aa  165  8e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00940393 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1891  aminoglycoside phosphotransferase  34.64 
 
 		 350 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1555  aminoglycoside phosphotransferase  35.14 
 
 		 319 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200581  normal  0.346641 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2791  aminoglycoside phosphotransferase  31.76 
 
 		 376 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35990  FadE36, aminoglycoside phosphotransferase  31.13 
 
 		 398 aa  143  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.139022  hitchhiker  0.0000000000000200155 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0281  aminoglycoside phosphotransferase  31.86 
 
 		 443 aa  130  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4407  aminoglycoside phosphotransferase  28.72 
 
 		 340 aa  91.3  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.219591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0011  aminoglycoside phosphotransferase  27.24 
 
 		 337 aa  84.7  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477677  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  28.85 
 
 		 346 aa  80.5  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  28.85 
 
 		 346 aa  80.9  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2501  aminoglycoside phosphotransferase  29.47 
 
 		 346 aa  77  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113216 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3187  putative tyrosine protein kinase/aminoglycoside phosphotransferase  28.47 
 
 		 368 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1007  aminoglycoside phosphotransferase  26.16 
 
 		 358 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1847  aminoglycoside phosphotransferase  26.74 
 
 		 362 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.00532112 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2016  hypothetical protein  27.11 
 
 		 358 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120817  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2171  aminoglycoside phosphotransferase  26.37 
 
 		 362 aa  72.8  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0620475  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1368  aminoglycoside phosphotransferase  29.53 
 
 		 368 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544786  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0894  aminoglycoside phosphotransferase  33.98 
 
 		 459 aa  71.2  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.184458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1108  aminoglycoside phosphotransferase  29.63 
 
 		 362 aa  70.5  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  24.68 
 
 		 344 aa  70.1  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0972  aminoglycoside phosphotransferase  27.91 
 
 		 358 aa  69.7  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0454764 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4307  aminoglycoside phosphotransferase  27.18 
 
 		 362 aa  69.3  0.00000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0855792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5287  aminoglycoside phosphotransferase  25.94 
 
 		 353 aa  69.3  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599023  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0835  aminoglycoside phosphotransferase  28.94 
 
 		 360 aa  68.9  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.407131  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  27.34 
 
 		 341 aa  68.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  28.34 
 
 		 348 aa  67  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  26.32 
 
 		 356 aa  66.6  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6367  aminoglycoside phosphotransferase  32.52 
 
 		 353 aa  66.6  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  26.38 
 
 		 358 aa  66.2  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1912  aminoglycoside phosphotransferase  26.74 
 
 		 363 aa  65.9  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.143156  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2629  aminoglycoside phosphotransferase  26.9 
 
 		 368 aa  65.9  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0566206  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3076  aminoglycoside phosphotransferase  27.93 
 
 		 361 aa  65.9  0.0000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.986116  normal  0.214027 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2050  aminoglycoside phosphotransferase  22.91 
 
 		 450 aa  65.1  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.299693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3327  aminoglycoside phosphotransferase  24.1 
 
 		 361 aa  65.1  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3286  aminoglycoside phosphotransferase  26.52 
 
 		 361 aa  65.1  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2450  aminoglycoside phosphotransferase  29.8 
 
 		 343 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1505  aminoglycoside phosphotransferase  25.77 
 
 		 358 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.290971  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1528  aminoglycoside phosphotransferase  25.77 
 
 		 358 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  24.78 
 
 		 353 aa  63.9  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  32.26 
 
 		 348 aa  63.5  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  26.51 
 
 		 359 aa  63.5  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4201  aminoglycoside phosphotransferase  30.61 
 
 		 343 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0284  putative aminoglycoside phosphotransferase  23.74 
 
 		 351 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.846831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  25 
 
 		 352 aa  63.2  0.000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1986  aminoglycoside phosphotransferase  29.38 
 
 		 368 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  25.65 
 
 		 344 aa  62.8  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17900  predicted aminoglycoside phosphotransferase  29.2 
 
 		 323 aa  62.8  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.215694  normal  0.505418 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4497  aminoglycoside phosphotransferase  26.94 
 
 		 382 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.609901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1805  aminoglycoside phosphotransferase  25.71 
 
 		 352 aa  62  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1944  aminoglycoside phosphotransferase  26.34 
 
 		 361 aa  62  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1778  aminoglycoside phosphotransferase  26.34 
 
 		 361 aa  62  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.221845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0182  aminoglycoside phosphotransferase  27.07 
 
 		 339 aa  61.2  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5046  aminoglycoside phosphotransferase  31.21 
 
 		 342 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0370  aminoglycoside phosphotransferase  34.46 
 
 		 345 aa  61.2  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.380981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  27.06 
 
 		 345 aa  61.2  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5523  aminoglycoside phosphotransferase  24.55 
 
 		 354 aa  60.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  23.18 
 
 		 338 aa  60.5  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  24.44 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1018  aminoglycoside phosphotransferase  28.16 
 
 		 358 aa  60.1  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0927  aminoglycoside phosphotransferase  30.58 
 
 		 351 aa  60.5  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.993496  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3218  aminoglycoside phosphotransferase  24.3 
 
 		 343 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2908  aminoglycoside phosphotransferase  26.97 
 
 		 347 aa  60.1  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.1681 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7669  phosphotransferase family protein  24.83 
 
 		 349 aa  59.7  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  33.06 
 
 		 348 aa  59.7  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2519  aminoglycoside phosphotransferase  29.37 
 
 		 349 aa  59.7  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2064  aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 		 361 aa  59.7  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1149  aminoglycoside phosphotransferase  25.78 
 
 		 337 aa  59.3  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2960  aminoglycoside phosphotransferase  25.56 
 
 		 363 aa  59.3  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1885  aminoglycoside phosphotransferase  31.25 
 
 		 354 aa  58.9  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  25.55 
 
 		 339 aa  58.5  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1505  aminoglycoside phosphotransferase  25.43 
 
 		 357 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4338  aminoglycoside phosphotransferase  24.61 
 
 		 343 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7694  aminoglycoside phosphotransferase  26.6 
 
 		 382 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5019  aminoglycoside phosphotransferase  28.57 
 
 		 343 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2337  aminoglycoside phosphotransferase  47.27 
 
 		 353 aa  58.5  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5078  aminoglycoside phosphotransferase  24.3 
 
 		 357 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1952  hypothetical protein  26.26 
 
 		 363 aa  58.5  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.126845 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5841  aminoglycoside phosphotransferase  28.57 
 
 		 343 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  29.22 
 
 		 344 aa  58.5  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3748  aminoglycoside phosphotransferase  28.57 
 
 		 350 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1881  aminoglycoside phosphotransferase  27.27 
 
 		 327 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.465558  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44815  predicted protein  27.4 
 
 		 401 aa  58.2  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3481  aminoglycoside phosphotransferase  30 
 
 		 353 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0724682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  24.46 
 
 		 344 aa  58.2  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0222  aminoglycoside phosphotransferase  31.75 
 
 		 355 aa  58.2  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.193801  normal  0.0244768 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>