230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0281 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0281  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
443 aa  867    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1860  aminoglycoside phosphotransferase  52.82 
 
 
447 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.257775  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2919  hypothetical protein  41.53 
 
 
316 aa  199  6e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.695501  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3076  aminoglycoside phosphotransferase  38.69 
 
 
337 aa  195  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.422792  normal  0.609725 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1863  aminoglycoside phosphotransferase  38.23 
 
 
329 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0353182  normal  0.189268 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1959  aminoglycoside phosphotransferase  38.64 
 
 
331 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3604  aminoglycoside phosphotransferase  37.99 
 
 
331 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252193  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3517  aminoglycoside phosphotransferase  41.25 
 
 
334 aa  176  9e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2913  aminoglycoside phosphotransferase  39.16 
 
 
325 aa  167  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.605881  normal  0.0304684 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4584  aminoglycoside phosphotransferase  33.64 
 
 
475 aa  150  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4469  aminoglycoside phosphotransferase  33.98 
 
 
323 aa  140  6e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00940393 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2483  aminoglycoside phosphotransferase  37.62 
 
 
323 aa  139  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0370489  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1585  aminoglycoside phosphotransferase  34.63 
 
 
319 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1609  aminoglycoside phosphotransferase  34.63 
 
 
319 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4452  aminoglycoside phosphotransferase  33.88 
 
 
346 aa  134  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.744873  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35990  FadE36, aminoglycoside phosphotransferase  31.97 
 
 
398 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.139022  hitchhiker  0.0000000000000200155 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2791  aminoglycoside phosphotransferase  31.97 
 
 
376 aa  133  6e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1555  aminoglycoside phosphotransferase  34.3 
 
 
319 aa  131  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200581  normal  0.346641 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1891  aminoglycoside phosphotransferase  31.09 
 
 
350 aa  125  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5527  putative aminoglycoside phosphotransferase  30.62 
 
 
311 aa  114  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3968  aminoglycoside phosphotransferase  40.37 
 
 
332 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.574254  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2501  aminoglycoside phosphotransferase  30.38 
 
 
346 aa  96.3  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113216 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5523  aminoglycoside phosphotransferase  30.62 
 
 
354 aa  86.3  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0284  putative aminoglycoside phosphotransferase  35.71 
 
 
351 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.846831  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0011  aminoglycoside phosphotransferase  27.37 
 
 
337 aa  84  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477677  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0894  aminoglycoside phosphotransferase  34.43 
 
 
459 aa  83.2  0.000000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.184458  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4490  aminoglycoside phosphotransferase  28.63 
 
 
344 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  30.71 
 
 
346 aa  77.8  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  30.71 
 
 
346 aa  77.8  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1003  aminoglycoside phosphotransferase  33.48 
 
 
337 aa  76.6  0.0000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.083137  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4407  aminoglycoside phosphotransferase  29.65 
 
 
340 aa  76.3  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.219591  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1393  aminoglycoside phosphotransferase  30.36 
 
 
363 aa  76.6  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1018  aminoglycoside phosphotransferase  29.89 
 
 
358 aa  76.3  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  28.38 
 
 
353 aa  75.5  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  30.65 
 
 
344 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  33.19 
 
 
339 aa  74.3  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2519  aminoglycoside phosphotransferase  32.19 
 
 
349 aa  73.9  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177703  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0116  aminoglycoside phosphotransferase  30.53 
 
 
379 aa  73.9  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  28.82 
 
 
356 aa  73.6  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1478  aminoglycoside phosphotransferase  29.75 
 
 
353 aa  72.8  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2171  aminoglycoside phosphotransferase  27.11 
 
 
362 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0620475  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  25.41 
 
 
344 aa  71.6  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1323  phosphotransferase enzyme family protein  28.75 
 
 
368 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1314  phosphotransferase enzyme family protein  28.75 
 
 
368 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1805  phosphotransferase enzyme family protein  28.75 
 
 
368 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113334  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6367  aminoglycoside phosphotransferase  28.99 
 
 
353 aa  70.9  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1460  phosphotransferase family protein  28.75 
 
 
368 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  25.78 
 
 
364 aa  71.2  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0164  aminoglycoside phosphotransferase  29.55 
 
 
357 aa  71.2  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1847  aminoglycoside phosphotransferase  26.86 
 
 
362 aa  70.9  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.00532112 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0437  phosphotransferase enzyme family protein  28.75 
 
 
368 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1154  phosphotransferase enzyme family protein  28.75 
 
 
368 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.119269  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0714  phosphotransferase enzyme family protein  28.75 
 
 
368 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.701125  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0972  aminoglycoside phosphotransferase  26.43 
 
 
358 aa  70.5  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0454764 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2016  hypothetical protein  28.27 
 
 
358 aa  70.1  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120817  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5078  aminoglycoside phosphotransferase  30.56 
 
 
357 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114652  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3038  aminoglycoside phosphotransferase  30.9 
 
 
343 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145633  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1007  aminoglycoside phosphotransferase  27.44 
 
 
358 aa  69.7  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  27.13 
 
 
352 aa  69.7  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  30.2 
 
 
352 aa  69.7  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3218  aminoglycoside phosphotransferase  30.53 
 
 
343 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  30.22 
 
 
348 aa  69.7  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1505  aminoglycoside phosphotransferase  29.19 
 
 
358 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.290971  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1528  aminoglycoside phosphotransferase  29.19 
 
 
358 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  28.11 
 
 
343 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5287  aminoglycoside phosphotransferase  28.57 
 
 
353 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599023  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0471  aminoglycoside phosphotransferase  26.64 
 
 
403 aa  68.6  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0994  aminoglycoside phosphotransferase  29.06 
 
 
358 aa  68.6  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.739164  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3481  aminoglycoside phosphotransferase  29.07 
 
 
353 aa  68.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0724682  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1952  hypothetical protein  27.7 
 
 
363 aa  68.6  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.126845 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  30.13 
 
 
358 aa  67.8  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3209  aminoglycoside phosphotransferase  27.31 
 
 
391 aa  67.8  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79954  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  31.84 
 
 
344 aa  67.8  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1035  aminoglycoside phosphotransferase  27.36 
 
 
353 aa  67.8  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1986  aminoglycoside phosphotransferase  28.84 
 
 
368 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3709  aminoglycoside phosphotransferase  26.28 
 
 
352 aa  67.4  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0927  aminoglycoside phosphotransferase  24.24 
 
 
351 aa  67  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.993496  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  27.2 
 
 
352 aa  67  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3865  aminoglycoside phosphotransferase  30.77 
 
 
350 aa  66.6  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0767712  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5019  aminoglycoside phosphotransferase  30.53 
 
 
343 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1944  aminoglycoside phosphotransferase  27.44 
 
 
361 aa  65.9  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5841  aminoglycoside phosphotransferase  30.53 
 
 
343 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4338  aminoglycoside phosphotransferase  30.92 
 
 
343 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1084  phosphotransferase enzyme family protein  27.59 
 
 
368 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3187  putative tyrosine protein kinase/aminoglycoside phosphotransferase  29.37 
 
 
368 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1805  aminoglycoside phosphotransferase  22.87 
 
 
352 aa  65.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3286  aminoglycoside phosphotransferase  26.99 
 
 
361 aa  65.1  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0182  aminoglycoside phosphotransferase  27.4 
 
 
339 aa  65.1  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4576  aminoglycoside phosphotransferase  29.63 
 
 
357 aa  65.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  29.02 
 
 
338 aa  64.7  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1368  aminoglycoside phosphotransferase  28.97 
 
 
368 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544786  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2397  aminoglycoside phosphotransferase  33.05 
 
 
362 aa  64.7  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2202  aminoglycoside phosphotransferase  28.11 
 
 
354 aa  64.7  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0249474  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1778  aminoglycoside phosphotransferase  27.07 
 
 
361 aa  65.1  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.221845  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  28.43 
 
 
315 aa  64.3  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  25.99 
 
 
359 aa  64.3  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2514  aminoglycoside phosphotransferase  28.33 
 
 
365 aa  63.5  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1559  aminoglycoside phosphotransferase  28.09 
 
 
344 aa  63.5  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2075  aminoglycoside phosphotransferase  27.73 
 
 
355 aa  63.2  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0283964  normal  0.0813065 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2629  aminoglycoside phosphotransferase  38.39 
 
 
368 aa  63.2  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0566206  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>