16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2920 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_2920  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  256  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182044  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3603  hypothetical protein  68.33 
 
 
135 aa  169  9e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.481966  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1960  hypothetical protein  66.67 
 
 
126 aa  167  5e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1864  hypothetical protein  68.33 
 
 
124 aa  167  6e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0703562  normal  0.174095 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3075  hypothetical protein  53.78 
 
 
127 aa  137  6e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.168163  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3516  hypothetical protein  51.69 
 
 
126 aa  120  9e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5526  hypothetical protein  36.61 
 
 
121 aa  82.8  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1860  aminoglycoside phosphotransferase  37.84 
 
 
447 aa  66.6  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.257775  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3970  hypothetical protein  37.39 
 
 
116 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.497278  normal  0.256817 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1584  hypothetical protein  49.15 
 
 
116 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.534117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1608  hypothetical protein  49.15 
 
 
116 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1554  hypothetical protein  49.15 
 
 
116 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.279924  normal  0.425 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2479  hypothetical protein  33.33 
 
 
114 aa  44.7  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00448035  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1890  hypothetical protein  30.7 
 
 
109 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2914  hypothetical protein  33.91 
 
 
121 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304715  normal  0.0262549 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4584  aminoglycoside phosphotransferase  31.86 
 
 
475 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>