18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3075 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3075  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  260  4e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.168163  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3603  hypothetical protein  60 
 
 		 135 aa  160  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.481966  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3516  hypothetical protein  58.87 
 
 		 126 aa  146  8e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1864  hypothetical protein  55.74 
 
 		 124 aa  144  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0703562  normal  0.174095 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1960  hypothetical protein  52.46 
 
 		 126 aa  141  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2920  hypothetical protein  53.78 
 
 		 128 aa  137  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5526  hypothetical protein  38.74 
 
 		 121 aa  82  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3970  hypothetical protein  35.96 
 
 		 116 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.497278  normal  0.256817 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2914  hypothetical protein  41.38 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304715  normal  0.0262549 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1890  hypothetical protein  35.59 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1860  aminoglycoside phosphotransferase  31.53 
 
 		 447 aa  57.8  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.257775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4470  hypothetical protein  36.28 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381642 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4584  aminoglycoside phosphotransferase  32.43 
 
 		 475 aa  55.1  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1554  hypothetical protein  35.14 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.279924  normal  0.425 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1608  hypothetical protein  35.14 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1584  hypothetical protein  35.14 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.534117  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2479  hypothetical protein  42.19 
 
 		 114 aa  51.6  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00448035  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0281  aminoglycoside phosphotransferase  29.91 
 
 		 443 aa  43.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>