18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3516 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B3516  hypothetical protein  100 
 
 
126 aa  249  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3075  hypothetical protein  58.87 
 
 
127 aa  146  8e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.168163  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1960  hypothetical protein  49.18 
 
 
126 aa  126  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3603  hypothetical protein  50.79 
 
 
135 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.481966  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1864  hypothetical protein  51.22 
 
 
124 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0703562  normal  0.174095 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2920  hypothetical protein  51.69 
 
 
128 aa  120  9e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182044  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5526  hypothetical protein  38.05 
 
 
121 aa  80.1  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3970  hypothetical protein  37.72 
 
 
116 aa  60.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.497278  normal  0.256817 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2914  hypothetical protein  45.38 
 
 
121 aa  57.8  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304715  normal  0.0262549 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2479  hypothetical protein  39.47 
 
 
114 aa  57.8  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00448035  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4470  hypothetical protein  36.94 
 
 
111 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00381642 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4584  aminoglycoside phosphotransferase  36.94 
 
 
475 aa  50.1  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1890  hypothetical protein  33.9 
 
 
109 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1554  hypothetical protein  35.45 
 
 
116 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.279924  normal  0.425 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1608  hypothetical protein  35.45 
 
 
116 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1584  hypothetical protein  35.45 
 
 
116 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.534117  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0281  aminoglycoside phosphotransferase  33.04 
 
 
443 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1860  aminoglycoside phosphotransferase  28.18 
 
 
447 aa  41.6  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.257775  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>