19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2479 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2479  hypothetical protein  100 
 
 
114 aa  220  6e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00448035  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3970  hypothetical protein  65.14 
 
 
116 aa  129  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.497278  normal  0.256817 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1554  hypothetical protein  50.96 
 
 
116 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.279924  normal  0.425 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1608  hypothetical protein  50.96 
 
 
116 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1584  hypothetical protein  50.96 
 
 
116 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.534117  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1890  hypothetical protein  50.47 
 
 
109 aa  83.6  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4470  hypothetical protein  45.28 
 
 
111 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00381642 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3516  hypothetical protein  39.47 
 
 
126 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1864  hypothetical protein  36.84 
 
 
124 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0703562  normal  0.174095 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5526  hypothetical protein  34.82 
 
 
121 aa  55.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3075  hypothetical protein  32.46 
 
 
127 aa  55.1  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.168163  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4584  aminoglycoside phosphotransferase  39.45 
 
 
475 aa  54.3  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1960  hypothetical protein  35.96 
 
 
126 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2920  hypothetical protein  34.21 
 
 
128 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182044  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4453  TPR repeat-containing protein  41.67 
 
 
109 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1860  aminoglycoside phosphotransferase  33.65 
 
 
447 aa  47.8  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.257775  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3603  hypothetical protein  33.33 
 
 
135 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.481966  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0281  aminoglycoside phosphotransferase  45.76 
 
 
443 aa  44.7  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2792  hypothetical protein  33.91 
 
 
118 aa  40  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>