14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3603 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3603  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  272  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.481966  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1960  hypothetical protein  80.33 
 
 		 126 aa  207  4e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1864  hypothetical protein  81.3 
 
 		 124 aa  203  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0703562  normal  0.174095 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2920  hypothetical protein  68.33 
 
 		 128 aa  169  9e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3075  hypothetical protein  60 
 
 		 127 aa  160  4.0000000000000004e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.168163  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3516  hypothetical protein  50.79 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5526  hypothetical protein  34.82 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1860  aminoglycoside phosphotransferase  32.43 
 
 		 447 aa  56.2  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.257775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3970  hypothetical protein  35.96 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.497278  normal  0.256817 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2914  hypothetical protein  33.91 
 
 		 121 aa  43.9  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304715  normal  0.0262549 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2479  hypothetical protein  31.58 
 
 		 114 aa  42.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00448035  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1584  hypothetical protein  32.73 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.534117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1608  hypothetical protein  32.73 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1554  hypothetical protein  32.73 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.279924  normal  0.425 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>