16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1864 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1864  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  249  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0703562  normal  0.174095 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3603  hypothetical protein  81.3 
 
 		 135 aa  203  6e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.481966  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1960  hypothetical protein  77.05 
 
 		 126 aa  194  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2920  hypothetical protein  68.33 
 
 		 128 aa  167  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3075  hypothetical protein  55.74 
 
 		 127 aa  144  5e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.168163  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3516  hypothetical protein  51.22 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5526  hypothetical protein  32.43 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3970  hypothetical protein  35.96 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.497278  normal  0.256817 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1860  aminoglycoside phosphotransferase  34.82 
 
 		 447 aa  55.5  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.257775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2479  hypothetical protein  35.96 
 
 		 114 aa  50.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00448035  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1584  hypothetical protein  36.04 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.534117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1608  hypothetical protein  36.04 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1554  hypothetical protein  36.04 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.279924  normal  0.425 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1890  hypothetical protein  31.36 
 
 		 109 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4470  hypothetical protein  34.51 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381642 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0281  aminoglycoside phosphotransferase  31.9 
 
 		 443 aa  43.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>