197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4604 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4604  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 381 aa  768    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.882822  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1869  aminoglycoside phosphotransferase  64.38 
 
 		 378 aa  483  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0573919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4497  aminoglycoside phosphotransferase  63.09 
 
 		 382 aa  483  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.609901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13189  hypothetical protein  61.17 
 
 		 378 aa  475  1e-133  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.23318 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1560  aminoglycoside phosphotransferase  62.6 
 
 		 373 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1584  aminoglycoside phosphotransferase  62.6 
 
 		 373 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1530  aminoglycoside phosphotransferase  62.87 
 
 		 373 aa  461  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.984982  normal  0.641522 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3636  aminoglycoside phosphotransferase  55.59 
 
 		 375 aa  410  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7694  aminoglycoside phosphotransferase  45.23 
 
 		 382 aa  290  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2683  aminoglycoside phosphotransferase-like protein  42.44 
 
 		 372 aa  275  8e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.124499  normal  0.283498 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3974  aminoglycoside phosphotransferase  35.1 
 
 		 350 aa  169  6e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4048  aminoglycoside phosphotransferase  33.1 
 
 		 361 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.430148  normal  0.325944 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0624  aminoglycoside phosphotransferase  32.3 
 
 		 355 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  28.42 
 
 		 338 aa  82  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0182  aminoglycoside phosphotransferase  28.52 
 
 		 339 aa  81.3  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  26.9 
 
 		 346 aa  77.4  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  27.22 
 
 		 346 aa  76.6  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  29.28 
 
 		 344 aa  75.9  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5287  aminoglycoside phosphotransferase  28.32 
 
 		 353 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599023  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3076  aminoglycoside phosphotransferase  28.31 
 
 		 361 aa  72.8  0.000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.986116  normal  0.214027 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1007  aminoglycoside phosphotransferase  25.37 
 
 		 358 aa  72  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  28.62 
 
 		 358 aa  72.8  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1003  aminoglycoside phosphotransferase  31.25 
 
 		 337 aa  72.8  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.083137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6367  aminoglycoside phosphotransferase  27.99 
 
 		 353 aa  72  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1018  aminoglycoside phosphotransferase  29.87 
 
 		 358 aa  71.6  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3327  aminoglycoside phosphotransferase  26.55 
 
 		 361 aa  72  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0972  aminoglycoside phosphotransferase  27.14 
 
 		 358 aa  71.6  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0454764 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3076  aminoglycoside phosphotransferase  25.3 
 
 		 337 aa  71.6  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.422792  normal  0.609725 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3187  putative tyrosine protein kinase/aminoglycoside phosphotransferase  28.52 
 
 		 368 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2903  aminoglycoside phosphotransferase  30.39 
 
 		 353 aa  70.9  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1559  aminoglycoside phosphotransferase  24.5 
 
 		 344 aa  70.5  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  26.11 
 
 		 352 aa  69.7  0.00000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1368  aminoglycoside phosphotransferase  28.18 
 
 		 368 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544786  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2629  aminoglycoside phosphotransferase  29.29 
 
 		 368 aa  69.7  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0566206  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  28.8 
 
 		 356 aa  69.7  0.00000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2027  aminoglycoside phosphotransferase  27.22 
 
 		 366 aa  69.3  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2073  aminoglycoside phosphotransferase  27.22 
 
 		 366 aa  69.3  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4307  aminoglycoside phosphotransferase  28.71 
 
 		 362 aa  69.3  0.00000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0855792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2010  aminoglycoside phosphotransferase  27.22 
 
 		 367 aa  69.7  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0773583  normal  0.266634 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  25.48 
 
 		 352 aa  69.3  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  27 
 
 		 344 aa  69.3  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  27.78 
 
 		 353 aa  68.2  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1959  aminoglycoside phosphotransferase  28.47 
 
 		 331 aa  67.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  24.09 
 
 		 338 aa  67.8  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2919  hypothetical protein  27.92 
 
 		 316 aa  67.8  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.695501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  26.89 
 
 		 344 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  26.39 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1863  aminoglycoside phosphotransferase  27.52 
 
 		 329 aa  67.4  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0353182  normal  0.189268 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1847  aminoglycoside phosphotransferase  25.77 
 
 		 362 aa  67.4  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.00532112 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2171  aminoglycoside phosphotransferase  25.77 
 
 		 362 aa  67.4  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0620475  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5523  aminoglycoside phosphotransferase  26.53 
 
 		 354 aa  66.6  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3286  aminoglycoside phosphotransferase  26.35 
 
 		 361 aa  66.6  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2016  hypothetical protein  27.59 
 
 		 358 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120817  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1986  aminoglycoside phosphotransferase  29.18 
 
 		 368 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1944  aminoglycoside phosphotransferase  28.62 
 
 		 361 aa  65.1  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1778  aminoglycoside phosphotransferase  28.74 
 
 		 361 aa  64.7  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.221845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1084  phosphotransferase enzyme family protein  27.37 
 
 		 368 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3209  aminoglycoside phosphotransferase  26.39 
 
 		 391 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1035  aminoglycoside phosphotransferase  29.83 
 
 		 353 aa  64.7  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2476  aminoglycoside phosphotransferase  26.35 
 
 		 338 aa  64.3  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000012289  decreased coverage  0.00166754 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1952  hypothetical protein  27.2 
 
 		 363 aa  64.3  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.126845 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  25.75 
 
 		 359 aa  63.9  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0994  aminoglycoside phosphotransferase  28.57 
 
 		 358 aa  63.9  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.739164  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1393  aminoglycoside phosphotransferase  25.24 
 
 		 363 aa  63.9  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  25.95 
 
 		 345 aa  63.9  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  26.84 
 
 		 341 aa  63.5  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1912  aminoglycoside phosphotransferase  26.78 
 
 		 363 aa  63.5  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.143156  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  27.53 
 
 		 348 aa  63.5  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  26.96 
 
 		 348 aa  63.5  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0222  aminoglycoside phosphotransferase  30.42 
 
 		 355 aa  63.5  0.000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.193801  normal  0.0244768 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1860  aminoglycoside phosphotransferase  29.38 
 
 		 447 aa  63.5  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.257775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3038  aminoglycoside phosphotransferase  25.67 
 
 		 343 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  25.76 
 
 		 352 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0835  aminoglycoside phosphotransferase  27.85 
 
 		 360 aa  62.4  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.407131  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2397  aminoglycoside phosphotransferase  23.72 
 
 		 362 aa  62  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5078  aminoglycoside phosphotransferase  25.9 
 
 		 357 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1108  aminoglycoside phosphotransferase  27.31 
 
 		 362 aa  61.6  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  27.21 
 
 		 359 aa  61.6  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  26.86 
 
 		 339 aa  61.2  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2810  aminoglycoside phosphotransferase  26.5 
 
 		 336 aa  60.8  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6405  aminoglycoside phosphotransferase  26.83 
 
 		 343 aa  60.5  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3590  aminoglycoside phosphotransferase  33.59 
 
 		 370 aa  60.5  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  25.53 
 
 		 343 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0625  aminoglycoside phosphotransferase  26.49 
 
 		 354 aa  60.1  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.149436 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  27.92 
 
 		 352 aa  59.7  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5718  aminoglycoside phosphotransferase  24.92 
 
 		 343 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  28.12 
 
 		 348 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2960  aminoglycoside phosphotransferase  26.37 
 
 		 363 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3072  aminoglycoside phosphotransferase  25.43 
 
 		 388 aa  58.9  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3709  aminoglycoside phosphotransferase  25.38 
 
 		 352 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3481  aminoglycoside phosphotransferase  24.07 
 
 		 353 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0724682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1805  aminoglycoside phosphotransferase  28.99 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.726443  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1852  aminoglycoside phosphotransferase  28.99 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.906902  normal  0.283402 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4490  aminoglycoside phosphotransferase  24.55 
 
 		 344 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1314  phosphotransferase enzyme family protein  26.76 
 
 		 368 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1323  phosphotransferase enzyme family protein  26.97 
 
 		 368 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  23.55 
 
 		 344 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1805  phosphotransferase enzyme family protein  26.97 
 
 		 368 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113334  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0011  aminoglycoside phosphotransferase  25.57 
 
 		 337 aa  57.4  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477677  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0714  phosphotransferase enzyme family protein  26.97 
 
 		 368 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.701125  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>