83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3740 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3740  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  296  6e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00447243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3624  hypothetical protein  75.4 
 
 		 147 aa  203  5e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1674  hypothetical protein  74.36 
 
 		 147 aa  193  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1887  hypothetical protein  65.73 
 
 		 146 aa  189  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0912  hypothetical protein  58.5 
 
 		 145 aa  181  3e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3433  hypothetical protein  57.14 
 
 		 145 aa  174  3e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1333  hypothetical protein  69.57 
 
 		 123 aa  173  8e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.497148 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2734  hypothetical protein  61.02 
 
 		 156 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0802358 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4924  hypothetical protein  45.26 
 
 		 169 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195094  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3426  hypothetical protein  43.45 
 
 		 178 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4360  hypothetical protein  44.2 
 
 		 165 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1973  hypothetical protein  46.34 
 
 		 179 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0974788 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5490  hypothetical protein  44.53 
 
 		 204 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4974  hypothetical protein  42.75 
 
 		 203 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2287  hypothetical protein  45.53 
 
 		 170 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56667 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2011  hypothetical protein  45.53 
 
 		 170 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5160  hypothetical protein  41.73 
 
 		 204 aa  106  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.131388 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4945  hypothetical protein  41.22 
 
 		 199 aa  104  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1710  hypothetical protein  37.86 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.661743  normal  0.276056 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2974  hypothetical protein  40.85 
 
 		 207 aa  102  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.155724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6942  hypothetical protein  41.27 
 
 		 202 aa  100  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2264  hypothetical protein  37.93 
 
 		 213 aa  99  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.144386 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0487  hypothetical protein  43.22 
 
 		 154 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492113  normal  0.732049 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0175  hypothetical protein  37.23 
 
 		 135 aa  98.2  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1740  hypothetical protein  39.16 
 
 		 138 aa  97.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2677  hypothetical protein  39.33 
 
 		 231 aa  97.1  8e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5609  hypothetical protein  40.29 
 
 		 136 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.343437  normal  0.446429 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3606  conserved hypothetical proteinn  40.83 
 
 		 228 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00367306  normal  0.482079 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2595  hypothetical protein  38.33 
 
 		 167 aa  92  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.13732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3722  hypothetical protein  39.83 
 
 		 228 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  0.0261827 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3413  hypothetical protein  39.83 
 
 		 230 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1874  hypothetical protein  34.62 
 
 		 225 aa  89.7  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1853  Protein of unknown function DUF2147  37.19 
 
 		 149 aa  87.8  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3114  hypothetical protein  34.56 
 
 		 142 aa  87  7e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3305  hypothetical protein  35.04 
 
 		 134 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3794  hypothetical protein  40.65 
 
 		 134 aa  86.7  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4359  hypothetical protein  41.03 
 
 		 133 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4354  hypothetical protein  37.5 
 
 		 134 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3048  hypothetical protein  35.46 
 
 		 143 aa  85.1  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  0.0139913 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5701  hypothetical protein  39.32 
 
 		 111 aa  85.1  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479655 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3728  hypothetical protein  40.17 
 
 		 137 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.607549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3095  hypothetical protein  39.1 
 
 		 143 aa  83.6  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2348  hypothetical protein  36.69 
 
 		 146 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2668  hypothetical protein  35.25 
 
 		 147 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6201  Protein of unknown function DUF2147  30.2 
 
 		 151 aa  81.6  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2391  hypothetical protein  35.25 
 
 		 147 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.69026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4129  hypothetical protein  33.33 
 
 		 300 aa  77.8  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409896 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4374  hypothetical protein  38.3 
 
 		 139 aa  77.4  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6444  Protein of unknown function DUF2147  36.64 
 
 		 140 aa  77  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1034  hypothetical protein  35.9 
 
 		 168 aa  76.6  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.74359 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1747  hypothetical protein  35.9 
 
 		 128 aa  75.9  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838706  normal  0.0182475 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2639  hypothetical protein  35.04 
 
 		 283 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000954423 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3442  hypothetical protein  31.58 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000636062  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1379  hypothetical protein  34.75 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.951506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1499  hypothetical protein  32 
 
 		 272 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0914941 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2829  hypothetical protein  31.93 
 
 		 280 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.023481  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0555  hypothetical protein  34.07 
 
 		 136 aa  68.6  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0594263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3722  Protein of unknown function DUF2147  32.54 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.861772  normal  0.147522 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1598  hypothetical protein  26.97 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.267519  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1884  hypothetical protein  35 
 
 		 119 aa  62  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6391  putative signal peptide protein  28.67 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0129  hypothetical protein  33.33 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.374028  normal  0.0265018 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4317  hypothetical protein  27.89 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1124  hypothetical protein  29.31 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4794  hypothetical protein  26.05 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0246667  normal  0.215514 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6197  hypothetical protein  29.41 
 
 		 262 aa  54.7  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.701843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2244  hypothetical protein  32.2 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3056  hypothetical protein  27.42 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.560509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0919  hypothetical protein  31.36 
 
 		 126 aa  51.6  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0539754  normal  0.0895293 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4322  putative signal peptide protein  24.83 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.338595  normal  0.0273369 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1033  hypothetical protein  26.17 
 
 		 148 aa  51.6  0.000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1542  hypothetical protein  29.25 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714923 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4104  hypothetical protein  32.73 
 
 		 141 aa  50.4  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.713286  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1867  hypothetical protein  29.25 
 
 		 151 aa  50.4  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.526654  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2038  hypothetical protein  27.73 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03893  putative signal peptide protein  24.62 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.536357 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0576  Protein of unknown function DUF2147  30 
 
 		 166 aa  47.8  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2925  hypothetical protein  34.57 
 
 		 147 aa  47.8  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.771304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2791  hypothetical protein  27.14 
 
 		 129 aa  47.4  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.385318  normal  0.988228 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2874  putative signal peptide protein  37.8 
 
 		 157 aa  47  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000419101  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3698  hypothetical protein  27.27 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3075  putative signal peptide protein  34.94 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.973881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0418  hypothetical protein  31.3 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.130226  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>