More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0121 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_0121  regulatory protein, TetR  100 
 
 		 209 aa  422  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.602969 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4161  putative transcriptional regulator  60.3 
 
 		 202 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.674844  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3535  TetR family transcriptional regulator  62.87 
 
 		 210 aa  232  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.926686  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48420  putative transcriptional regulator  59.2 
 
 		 202 aa  229  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0011363  normal  0.230392 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2442  transcriptional regulator, TetR family  59.39 
 
 		 223 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35780  TetR family regulatory protein  52.45 
 
 		 205 aa  213  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0836  transcriptional regulator, TetR family  53.12 
 
 		 199 aa  207  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3067  TetR family transcriptional regulator  57.07 
 
 		 199 aa  198  5e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3641  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 197 aa  193  1e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.334684 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3073  TetR family transcriptional regulator  53.03 
 
 		 198 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4995  transcriptional regulator, TetR family  48.4 
 
 		 198 aa  188  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2069  TetR family transcriptional regulator  51.24 
 
 		 198 aa  185  4e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3539  TetR family transcriptional regulator  47.78 
 
 		 203 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318561 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19560  transcriptional regulator, tetR family  40.43 
 
 		 205 aa  141  7e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.186862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3389  transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 		 187 aa  123  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0771  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 204 aa  96.7  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  39.44 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1597  putative transcriptional regulator, TetR family  54.17 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0584  transcriptional regulator, TetR family  43.66 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  34.09 
 
 		 237 aa  54.3  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 271 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2468  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 216 aa  52.8  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 217 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  40.68 
 
 		 220 aa  51.6  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5697  TetR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 227 aa  51.6  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.949992  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0133  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 218 aa  51.6  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.440249 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6061  TetR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 191 aa  51.6  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1394  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 185 aa  51.6  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.546688  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 388 aa  50.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3256  transcriptional regulator, TetR family  48.33 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.757999  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  34.31 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1005  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  36.04 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  44.44 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0051  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 250 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 233 aa  49.7  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 215 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 215 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 200 aa  50.1  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6545  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 227 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129926 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  42.19 
 
 		 226 aa  49.3  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1156  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 193 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.813518  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0054  transcriptional regulator, TetR family  36.19 
 
 		 250 aa  49.3  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 224 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 197 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 225 aa  49.7  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1137  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 193 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 220 aa  48.9  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 		 248 aa  48.9  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5365  transcriptional regulator, TetR family  31.97 
 
 		 176 aa  48.5  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27670  transcriptional regulator  33.73 
 
 		 254 aa  48.5  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 215 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0275989 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1217  transcriptional regulator, TetR family  25.68 
 
 		 193 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 231 aa  48.5  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 215 aa  48.1  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4217  transcriptional regulator, TetR family  25.75 
 
 		 193 aa  48.1  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.152492 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0141  nucleoid occlusion protein  25.56 
 
 		 219 aa  48.1  0.00009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.102052  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0974  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 194 aa  48.1  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 224 aa  48.1  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 216 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4944  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 199 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5007  TetR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.908463 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 224 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  43.24 
 
 		 186 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5032  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 199 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 257 aa  47.8  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  33.63 
 
 		 216 aa  47.4  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5325  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 199 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.586018  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3146  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 215 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0376592  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0554  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  32.43 
 
 		 215 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0982  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0971  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1515  regulatory protein, TetR  36.84 
 
 		 208 aa  46.6  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0540  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  32.43 
 
 		 215 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 224 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 217 aa  47.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0518  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  33.78 
 
 		 217 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35266  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 224 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00420  hypothetical protein  32.43 
 
 		 215 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5866  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 236 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>