More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1238 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3860  BCCT family transporter  58.49 
 
 		 519 aa  650    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.99321  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06536  choline/carnitine/betaine transporter  64.65 
 
 		 539 aa  707    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1813  BCCT transporter  79.85 
 
 		 561 aa  891    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.566263 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000659  putative glycine betaine transporter  66.15 
 
 		 528 aa  706    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0875  glycine betaine transporter OpuD  78.13 
 
 		 524 aa  804    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0576373  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3674  BCCT transporter  63.13 
 
 		 549 aa  712    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0815  BCCT transporter  72.53 
 
 		 530 aa  795    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.820785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2126  BCCT transporter  76.58 
 
 		 533 aa  830    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00109884  hitchhiker  0.00218719 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1238  BCCT transporter  100 
 
 		 554 aa  1110    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.332872 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0335  BCCT transporter  52.01 
 
 		 534 aa  570  1e-161  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.568613  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3383  BCCT transporter  55.58 
 
 		 514 aa  557  1e-157  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.198067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0579  choline-glycine betaine transporter  55.21 
 
 		 519 aa  555  1e-156  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5125  BCCT family osmoprotectant transporter  51.61 
 
 		 522 aa  552  1e-156  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5625  osmoprotectant transporter, BCCT family  51.3 
 
 		 522 aa  550  1e-155  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5237  BCCT transporter  51.61 
 
 		 522 aa  549  1e-155  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5140  BCCT family osmoprotectant transporter  51.62 
 
 		 522 aa  549  1e-155  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5577  BCCT family osmoprotectant transporter  50.9 
 
 		 522 aa  546  1e-154  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5298  BCCT family osmoprotectant transporter  51.1 
 
 		 522 aa  546  1e-154  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5694  BCCT family osmoprotectant transporter  51.1 
 
 		 522 aa  546  1e-154  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5539  osmoprotectant transporter, BCCT family  51.1 
 
 		 522 aa  546  1e-154  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5380  osmoprotectant transporter, BCCT family  51.81 
 
 		 522 aa  526  1e-148  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.274616  normal  0.0982886 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5569  osmoprotectant transporter, BCCT family  51.61 
 
 		 522 aa  528  1e-148  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2888  BCCT transporter  49.69 
 
 		 555 aa  493  9.999999999999999e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.696836  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2692  BCCT family transporter  51.36 
 
 		 516 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.315858 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3060  BCCT transporter  51.36 
 
 		 516 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.892998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2920  BCCT transporter  49.49 
 
 		 518 aa  468  1.0000000000000001e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00190717  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2887  BCCT transporter  45.47 
 
 		 529 aa  457  1e-127  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2467  BCCT transporter  47.08 
 
 		 537 aa  433  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05503  choline/carnitine/betaine transporter  66.67 
 
 		 341 aa  431  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16031  hypothetical protein  36.23 
 
 		 519 aa  342  9e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.034717  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0251  BCCT family glycine betaine transporter  37.57 
 
 		 516 aa  318  2e-85  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0223  BCCT family glycine betaine transporter  38.66 
 
 		 518 aa  310  4e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18950  choline/carnitine/betaine transport  33.2 
 
 		 606 aa  255  2.0000000000000002e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.318822  normal  0.131435 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0079  choline/carnitine/betaine transporter  31.67 
 
 		 558 aa  253  5.000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0845  choline/carnitine/betaine transport  29.62 
 
 		 551 aa  251  3e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.626779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4866  choline/carnitine/betaine transporter  35.33 
 
 		 659 aa  248  3e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0140106 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0608  choline/carnitine/betaine transporter  32.42 
 
 		 490 aa  247  4e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1736  choline/carnitine/betaine transporter  32.53 
 
 		 506 aa  246  6e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00814809  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0920  choline/carnitine/betaine transporter  34.02 
 
 		 546 aa  246  8e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0705081  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4403  choline/carnitine/betaine transporter  36.02 
 
 		 659 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3305  choline/carnitine/betaine transport  31.81 
 
 		 545 aa  245  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0826  BCCT family choline/carnitine/betaine transporter  32.31 
 
 		 550 aa  244  3.9999999999999997e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3957  choline/carnitine/betaine transporter family protein  32.65 
 
 		 657 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0148602  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4324  choline/carnitine/betaine transporter  31.12 
 
 		 494 aa  241  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2216  choline/carnitine/betaine transporter  33.11 
 
 		 520 aa  241  2.9999999999999997e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2255  choline/carnitine/betaine transporter  33.11 
 
 		 520 aa  241  2.9999999999999997e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2475  choline/carnitine/betaine transporter  32.73 
 
 		 538 aa  239  6.999999999999999e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.172611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3426  choline/carnitine/betaine transporter  31.9 
 
 		 531 aa  239  9e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0758867  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0160  choline/carnitine/betaine transporter  35.51 
 
 		 497 aa  239  1e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2667  choline/carnitine/betaine transporter  33.61 
 
 		 606 aa  238  3e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0383388 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1888  choline/carnitine/betaine transporter  33.41 
 
 		 606 aa  236  1.0000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.541906  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1410  choline/carnitine/betaine transporter  32.04 
 
 		 548 aa  235  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000212445  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1437  choline/carnitine/betaine transporter  32.04 
 
 		 548 aa  235  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000110122  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2472  choline/carnitine/betaine transporter  34.63 
 
 		 667 aa  234  4.0000000000000004e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0022  choline/carnitine/betaine transporter  32.96 
 
 		 580 aa  233  6e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.499144 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2648  choline/carnitine/betaine transporter  31.54 
 
 		 534 aa  233  7.000000000000001e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2215  choline/carnitine/betaine transporter  31.68 
 
 		 523 aa  232  1e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2320  choline/carnitine/betaine transporter  31.58 
 
 		 530 aa  232  1e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.439021  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01010  choline/carnitine/betaine transport  30.81 
 
 		 573 aa  232  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.883034  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1219  choline/carnitine/betaine transporter  34.16 
 
 		 503 aa  231  2e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1610  hypothetical protein  31.57 
 
 		 646 aa  231  2e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00096761  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0293  choline/carnitine/betaine transporter  32.66 
 
 		 637 aa  232  2e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0308209  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69850  putative choline transporter  32.99 
 
 		 661 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2851  choline/carnitine/betaine transporter  29.03 
 
 		 600 aa  231  3e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152332  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5310  choline/carnitine/betaine transporter  32.38 
 
 		 698 aa  231  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.910175  normal  0.618905 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06510  choline/carnitine/betaine transport  33.84 
 
 		 642 aa  231  4e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0877  choline/carnitine/betaine transporter  31.95 
 
 		 542 aa  230  5e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.359976  hitchhiker  0.00000108541 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5032  choline/carnitine/betaine transporter  33.11 
 
 		 504 aa  229  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1390  choline/carnitine/betaine transporter  34.61 
 
 		 582 aa  227  3e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.211195 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5089  glycine betaine transporter  32.61 
 
 		 505 aa  227  3e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5479  glycine betaine transporter  32.61 
 
 		 505 aa  227  3e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.231091  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3532  choline/carnitine/betaine transporter  30.68 
 
 		 556 aa  228  3e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.825969 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3803  choline/carnitine/betaine transporter  30.77 
 
 		 531 aa  227  4e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.19587 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1356  choline/carnitine/betaine transport  34.36 
 
 		 582 aa  227  4e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.379286  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1374  choline/carnitine/betaine transporter  34.36 
 
 		 582 aa  227  4e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796407  normal  0.760016 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0044  choline/carnitine/betaine transporter  31.64 
 
 		 610 aa  227  5.0000000000000005e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4919  glycine betaine transporter  32.61 
 
 		 505 aa  227  5.0000000000000005e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5329  glycine betaine transporter  32.61 
 
 		 505 aa  227  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.52581e-23 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4934  glycine betaine transporter  32.61 
 
 		 505 aa  227  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1109  choline/carnitine/betaine transporter  32.65 
 
 		 676 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.507446  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5411  glycine betaine transporter  32.61 
 
 		 505 aa  227  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5593  glycine betaine transporter  33.91 
 
 		 504 aa  226  6e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000183656 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1765  choline/carnitine/betaine transporter  30.73 
 
 		 573 aa  226  7e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582743 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4042  choline/carnitine/betaine transporter  30.02 
 
 		 526 aa  226  9e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3341  choline/carnitine/betaine transporter  31.63 
 
 		 637 aa  226  1e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5358  glycine betaine transporter  32.61 
 
 		 505 aa  225  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6064  putative choline transporter  32.79 
 
 		 661 aa  225  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1512  choline transport protein BetT  31.52 
 
 		 679 aa  225  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0971262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0077  choline/carnitine/betaine transporter  33.57 
 
 		 546 aa  225  1e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00270  choline transporter of high affinity  30.14 
 
 		 677 aa  225  2e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3292  choline/carnitine/betaine transporter  30.14 
 
 		 677 aa  225  2e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3309  choline transport protein BetT  30.14 
 
 		 677 aa  225  2e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0331  choline transport protein BetT  30.14 
 
 		 677 aa  225  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00273  hypothetical protein  30.14 
 
 		 677 aa  225  2e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5363  glycine betaine transporter  33.91 
 
 		 504 aa  225  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2364  choline/carnitine/betaine transporter  36.26 
 
 		 685 aa  225  2e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0376  choline transport protein BetT  30.14 
 
 		 677 aa  225  2e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0597337 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0373  choline transport protein BetT  30.14 
 
 		 677 aa  225  2e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.834443  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0345  choline transport protein BetT  29.94 
 
 		 677 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2376  choline/carnitine/betaine transporter  33.05 
 
 		 508 aa  223  6e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157817  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>