85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0670 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_0670  peptidase M50  100 
 
 		 697 aa  1360    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.726178  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0147  peptidase M50  71.98 
 
 		 698 aa  983    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0567  peptidase M50  59.11 
 
 		 701 aa  805    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0479  peptidase M50  59.74 
 
 		 701 aa  805    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0390  peptidase M50  61.66 
 
 		 707 aa  844    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.270715  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0472  peptidase M50  59.03 
 
 		 702 aa  818    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1149  peptidase M50  41.62 
 
 		 714 aa  499  1e-140  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0681  hypothetical protein  40.4 
 
 		 709 aa  491  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0909  hypothetical protein  40.03 
 
 		 709 aa  479  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2056  hypothetical protein  40.83 
 
 		 709 aa  457  1e-127  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3180  peptidase M50  38.31 
 
 		 688 aa  452  1e-125  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0300  hypothetical protein  37.55 
 
 		 719 aa  450  1e-125  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0133976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0417  peptidase M50  38.81 
 
 		 701 aa  431  1e-119  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1674  peptidase M50  34.8 
 
 		 703 aa  404  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.607865  normal  0.551659 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3074  peptidase M50  37.8 
 
 		 696 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.688769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5411  putative membrane Zinc metallopeptidase, M50 family  36.52 
 
 		 699 aa  370  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000871616  normal  0.282869 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0372  hypothetical protein  41.95 
 
 		 474 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.707522  normal  0.611726 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3741  HlyD domain-containing protein  36.3 
 
 		 720 aa  344  2.9999999999999997e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1407  M50 family peptidase  28.62 
 
 		 720 aa  201  3e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0925  M50 family peptidase  27.12 
 
 		 715 aa  181  5.999999999999999e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135222  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1342  M50 family peptidase  25.64 
 
 		 714 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3235  M50 family peptidase  27.82 
 
 		 711 aa  159  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.347928 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3966  peptidase M50  26.01 
 
 		 741 aa  158  4e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.884919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0619  M50 family peptidase  26.61 
 
 		 715 aa  157  8e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2198  peptidase M50  26.98 
 
 		 720 aa  140  7e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961426 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2358  peptidase, M50 family  27.3 
 
 		 715 aa  140  7.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.398035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2399  M50 family peptidase  26.61 
 
 		 715 aa  137  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2176  M50 family peptidase  26.11 
 
 		 721 aa  120  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.510962  normal  0.28263 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0366  peptidase M50  26.04 
 
 		 736 aa  115  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4341  peptidase M50  27.67 
 
 		 367 aa  92.4  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0325098  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3220  sterol-regulatory element binding protein (SREBP) site 2 protease family protein  31.9 
 
 		 413 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.496668  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1793  cyclic nucleotide-binding protein  32.02 
 
 		 1171 aa  87.8  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.18567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2624  cyclic nucleotide-binding protein  28.42 
 
 		 1177 aa  83.2  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4373  hypothetical protein  37.31 
 
 		 825 aa  80.5  0.00000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2293  hypothetical protein  31.16 
 
 		 838 aa  77  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3579  hypothetical protein  30 
 
 		 350 aa  77  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00448549  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2722  hypothetical protein  30.91 
 
 		 847 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0895227  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2708  hypothetical protein  30.91 
 
 		 844 aa  76.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.577877 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2677  hypothetical protein  30.91 
 
 		 847 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2911  cyclic nucleotide-binding protein  27.56 
 
 		 1124 aa  73.9  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.965385  normal  0.0176228 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2919  hypothetical protein  34.71 
 
 		 824 aa  73.6  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1596  hypothetical protein  35.95 
 
 		 497 aa  72  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0373  hypothetical protein  30.6 
 
 		 205 aa  70.5  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.5146 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33960  hypothetical protein  37.01 
 
 		 238 aa  68.6  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331304  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3233  hypothetical protein  32.04 
 
 		 812 aa  67  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0921  hypothetical protein  34.81 
 
 		 398 aa  65.1  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4351  cyclic nucleotide-binding protein  29.02 
 
 		 948 aa  62.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0680  hypothetical protein  26.51 
 
 		 451 aa  60.5  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2055  hypothetical protein  28.22 
 
 		 442 aa  60.1  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3142  hypothetical protein  31.75 
 
 		 761 aa  58.5  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0154209  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13940  Zn-dependent protease  31.62 
 
 		 379 aa  55.1  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.909069 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2470  hypothetical protein  34.48 
 
 		 176 aa  54.7  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1691  RND family efflux transporter MFP subunit  34.52 
 
 		 335 aa  53.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0418  membrane-fusion protein  27.46 
 
 		 436 aa  52.4  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3230  sterol-regulatory element binding protein  39.29 
 
 		 171 aa  51.6  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.258333  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0908  hypothetical protein  27.51 
 
 		 451 aa  49.7  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1951  hypothetical protein  26.09 
 
 		 1097 aa  49.3  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00270024  hitchhiker  0.000836755 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3231  sterol-regulatory element binding protein  37.93 
 
 		 235 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.329955  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3740  HlyD family secretion protein  29.17 
 
 		 441 aa  48.9  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3073  hypothetical protein  26.75 
 
 		 448 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.880129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2582  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.64 
 
 		 379 aa  48.5  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000306136  normal  0.19553 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1241  RND family efflux transporter MFP subunit  27.53 
 
 		 398 aa  48.5  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2808  membrane fusion protein; cation efflux system protein  23.5 
 
 		 353 aa  47.8  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1361  RND efflux membrane protein  29.7 
 
 		 383 aa  47.8  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1251  RND family efflux transporter MFP subunit  29.17 
 
 		 383 aa  47.8  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0652431  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1680  RND family efflux transporter MFP subunit  29.52 
 
 		 360 aa  46.6  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.560813 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2255  secretion protein HlyD family protein  28.83 
 
 		 294 aa  46.6  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0614  membrane fusion protein  25.24 
 
 		 404 aa  47.4  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3694  ABC transporter related  27.94 
 
 		 756 aa  47  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0299  hypothetical protein  27.27 
 
 		 450 aa  46.2  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.251177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1919  RND family efflux transporter MFP subunit  28.74 
 
 		 383 aa  46.6  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2685  RND family efflux transporter MFP subunit  28.74 
 
 		 383 aa  46.2  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.133522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3906  peptidase M50  33.33 
 
 		 267 aa  45.8  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0618  RND family efflux transporter MFP subunit  23.48 
 
 		 387 aa  46.2  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3851  RND family efflux transporter MFP subunit  28.74 
 
 		 383 aa  46.6  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3834  RND family efflux transporter MFP subunit  28.74 
 
 		 383 aa  46.6  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3253  RND family efflux transporter MFP subunit  31.82 
 
 		 397 aa  46.6  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0514  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.69 
 
 		 393 aa  45.4  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.770818  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0568  hypothetical protein  25.45 
 
 		 442 aa  45.1  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0145  RND family efflux transporter MFP subunit  29.14 
 
 		 383 aa  45.4  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5410  hypothetical protein  28.1 
 
 		 449 aa  44.7  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.288703  normal  0.36048 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3183  AcrA-like protein  27.61 
 
 		 244 aa  44.7  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0473  hypothetical protein  26.11 
 
 		 442 aa  44.3  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.796891  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0090  putative multidrug transporter, HlyD family  21.17 
 
 		 368 aa  43.9  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1046  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.54 
 
 		 378 aa  43.9  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0357289  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>