108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4620 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4620  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 300 aa  611  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.505321  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4634  hypothetical protein  90.4 
 
 		 314 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4496  alpha/beta hydrolase-like protein  90.07 
 
 		 302 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0805  alpha/beta hydrolase fold  84.05 
 
 		 302 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0316  Alpha/beta hydrolase fold  66.32 
 
 		 317 aa  410  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2670  hypothetical protein  57.1 
 
 		 417 aa  340  1e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.686285  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2728  hypothetical protein  57.1 
 
 		 336 aa  340  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0371718  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0643  hypothetical protein  56.77 
 
 		 336 aa  339  4e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.107821  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2369  hypothetical protein  56.77 
 
 		 336 aa  339  4e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.841526  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2916  hypothetical protein  56.77 
 
 		 336 aa  339  4e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.282253  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1684  hypothetical protein  56.77 
 
 		 336 aa  339  4e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.490109  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1818  hypothetical protein  56.67 
 
 		 473 aa  334  1e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2192  alpha/beta hydrolase  56.11 
 
 		 346 aa  328  9e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5485  Alpha/beta hydrolase  56.44 
 
 		 346 aa  324  1e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5902  alpha/beta hydrolase  55.78 
 
 		 346 aa  323  2e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.169357  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2175  alpha/beta hydrolase  55.78 
 
 		 346 aa  323  2e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.306533  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2214  alpha/beta hydrolase  56.21 
 
 		 357 aa  320  3e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2091  alpha/beta hydrolase  56.91 
 
 		 352 aa  319  3e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1095  alpha/beta hydrolase fold  57.14 
 
 		 348 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1918  alpha/beta hydrolase  53.47 
 
 		 325 aa  296  2e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1457  alpha/beta hydrolase  52.17 
 
 		 303 aa  290  3e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0569  alpha/beta hydrolase  53.49 
 
 		 325 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0205  alpha/beta hydrolase  47.7 
 
 		 328 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1984  alpha/beta hydrolase  47.57 
 
 		 327 aa  243  3e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21420  predicted alpha/beta hydrolase  43.16 
 
 		 300 aa  198  1.0000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0815  putative hydrolase  41.86 
 
 		 298 aa  177  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0596  putative hydrolase  40.23 
 
 		 298 aa  167  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.443892 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3867  alpha/beta hydrolase-like protein  39.44 
 
 		 305 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4327  alpha/beta hydrolase-like protein  39.44 
 
 		 305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1341  putative hydrolase  37.59 
 
 		 300 aa  159  5e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5870  alpha/beta hydrolase-like protein  38.73 
 
 		 305 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.205699 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3931  alpha/beta hydrolase-like  38.38 
 
 		 305 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.269531  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4435  alpha/beta hydrolase-like protein  38.38 
 
 		 305 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0575  putative hydrolase  40.61 
 
 		 298 aa  154  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1527  alpha/beta hydrolase-like  36.97 
 
 		 305 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.114402 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3462  putative hydrolase  35.77 
 
 		 291 aa  153  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.339923  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2079  hypothetical protein  38.15 
 
 		 301 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.16044 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40820  putative hydrolase  33.7 
 
 		 291 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4709  alpha/beta hydrolase-like protein  37.23 
 
 		 295 aa  142  5e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0396894  decreased coverage  0.00396778 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3632  alpha/beta hydrolase-like protein  37.23 
 
 		 295 aa  142  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01912  hypothetical protein  35.19 
 
 		 290 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0438  hypothetical protein  36.9 
 
 		 312 aa  133  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48210  putative hydrolase  34.11 
 
 		 294 aa  125  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000506825  normal  0.0564296 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4058  alpha/beta hydrolase-like protein  33.21 
 
 		 292 aa  120  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1490  alpha/beta fold family hydrolase  33.98 
 
 		 462 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.679445  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3029  hypothetical protein  33.98 
 
 		 295 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1594  alpha/beta fold family hydrolase  33.98 
 
 		 293 aa  119  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1265  hypothetical protein  33.98 
 
 		 293 aa  119  7e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00885366  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0605  hypothetical protein  33.98 
 
 		 293 aa  119  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1460  alpha/beta fold family hydrolase  33.98 
 
 		 293 aa  119  7e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0548  hypothetical protein  33.98 
 
 		 293 aa  119  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.491359  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1273  hypothetical protein  31.75 
 
 		 296 aa  119  9e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0496483  hitchhiker  0.00827301 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2795  hypothetical protein  33.46 
 
 		 293 aa  117  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0611315  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1964  hypothetical protein  32.23 
 
 		 291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0677628  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0686  hypothetical protein  31.79 
 
 		 286 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0130174 
 
 
-
 
NC_004310  BR0288  hypothetical protein  32.3 
 
 		 290 aa  109  5e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935727  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0301  hypothetical protein  32.3 
 
 		 290 aa  109  5e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.851897  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0808  hypothetical protein  27.38 
 
 		 285 aa  108  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00976323  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3610  Alpha/beta hydrolase  30.88 
 
 		 289 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1897  alpha/beta hydrolase-like protein  26.97 
 
 		 321 aa  108  1e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.249943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0427  alpha/beta hydrolase fold  32.34 
 
 		 289 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2212  hypothetical protein  25.94 
 
 		 297 aa  104  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.140894 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2873  alpha/beta hydrolase  30.37 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.723814  normal  0.157524 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1464  hypothetical protein  28.06 
 
 		 328 aa  100  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0520  hypothetical protein  27.27 
 
 		 287 aa  98.6  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3956  alpha/beta hydrolase fold  32.23 
 
 		 334 aa  95.9  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00786101  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00524  alpha/beta hydrolase-like protein  27.38 
 
 		 288 aa  95.9  8e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1450  alpha/beta hydrolase  53.26 
 
 		 104 aa  90.5  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0797  putative hydrolase  30.8 
 
 		 330 aa  87.8  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1678  hypothetical protein  32.49 
 
 		 284 aa  85.9  8e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47510  putative hydrolase  31.37 
 
 		 279 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1672  alpha/beta hydrolase fold  30.95 
 
 		 288 aa  80.9  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.324929  normal  0.537045 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3622  alpha/beta hydrolase fold protein  32.53 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2936  alpha/beta hydrolase fold  30.28 
 
 		 317 aa  79.7  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0681221 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3343  alpha/beta hydrolase-like protein  29.92 
 
 		 306 aa  76.3  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2996  alpha/beta hydrolase-like protein  29.28 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.983134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2606  alpha/beta hydrolase  30.56 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal  0.690565 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3544  alpha/beta hydrolase fold  30.09 
 
 		 317 aa  54.3  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.941882  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2331  hypothetical protein  32.39 
 
 		 305 aa  51.2  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.978321  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1504  hypothetical protein  26.23 
 
 		 308 aa  50.1  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0349086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2756  alpha/beta hydrolase fold  34.21 
 
 		 311 aa  47.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.623251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0878  hypothetical protein  29.86 
 
 		 334 aa  45.8  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000343609  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1572  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 		 306 aa  45.8  0.0009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2086  hypothetical protein  25.89 
 
 		 329 aa  45.8  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.671906  normal  0.0731474 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1017  alpha/beta hydrolase fold  28.98 
 
 		 302 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2622  alpha/beta hydrolase fold  34.78 
 
 		 314 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.790671  normal  0.924395 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2931  hypothetical protein  29.09 
 
 		 316 aa  45.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2032  hypothetical protein  34.82 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.287773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2246  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 311 aa  45.1  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.1275  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0371  hypothetical protein  25.93 
 
 		 615 aa  43.9  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0579  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 		 302 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2034  alpha/beta hydrolase fold  30.37 
 
 		 311 aa  43.9  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1058  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 		 302 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1988  hypothetical protein  25.77 
 
 		 354 aa  44.3  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0758  alpha/beta hydrolase fold protein  29.92 
 
 		 315 aa  43.9  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.539161  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3679  alpha/beta hydrolase fold protein  26.45 
 
 		 279 aa  43.5  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.2542  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2528  alpha/beta hydrolase fold protein  31.25 
 
 		 327 aa  43.1  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.757367  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1597  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 		 274 aa  43.1  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2119  hypothetical protein  27.71 
 
 		 314 aa  43.1  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.651142  normal  0.48644 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2882  alpha/beta hydrolase fold protein  31.63 
 
 		 309 aa  43.1  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355624  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>