271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0736 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0702  major facilitator family transporter  98.96 
 
 		 385 aa  744    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0736  major facilitator transporter  100 
 
 		 385 aa  750    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0735  major facilitator transporter  98.44 
 
 		 385 aa  740    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.762648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4482  major facilitator transporter  93.78 
 
 		 386 aa  691    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.937677  normal  0.726 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0238  major facilitator transporter  41.32 
 
 		 382 aa  236  4e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70120  putative MFS transporter  42.51 
 
 		 387 aa  233  5e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6086  MFS family transporter  42.78 
 
 		 387 aa  233  5e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5533  major facilitator transporter  40.97 
 
 		 381 aa  219  6e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.316632  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2704  major facilitator superfamily MFS_1  38.18 
 
 		 388 aa  218  2e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0156259  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3745  major facilitator superfamily MFS_1  36.69 
 
 		 388 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3941  major facilitator superfamily MFS_1  40.41 
 
 		 383 aa  208  1e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3898  major facilitator transporter  37.25 
 
 		 386 aa  206  7e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0783  major facilitator superfamily MFS_1  36.99 
 
 		 386 aa  205  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.724774  normal  0.275511 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3915  major facilitator transporter  36.94 
 
 		 386 aa  204  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0792  major facilitator transporter  37.5 
 
 		 386 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0339  major facilitator transporter  37.5 
 
 		 386 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0822  major facilitator transporter  37.5 
 
 		 386 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426653  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0228  major facilitator transporter  39.34 
 
 		 382 aa  202  7e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0193  major facilitator transporter  37.81 
 
 		 379 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000634988 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0094  hypothetical protein  39.23 
 
 		 382 aa  199  7e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5277  major facilitator family transporter  38.48 
 
 		 379 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5187  major facilitator transporter  38.48 
 
 		 379 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0310386 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0720  major facilitator transporter  36.94 
 
 		 386 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0823919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2433  major facilitator transporter  35.51 
 
 		 385 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0171851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0703  major facilitator transporter  37.32 
 
 		 386 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48020  Major facilitator family transporter protein  40.5 
 
 		 377 aa  196  4.0000000000000005e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5329  major facilitator transporter  38.92 
 
 		 379 aa  196  7e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783792 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3226  major facilitator transporter  35.93 
 
 		 389 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.232754  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2561  major facilitator transporter  36.57 
 
 		 386 aa  189  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2053  transporter, putative  35.93 
 
 		 389 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.198674  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3172  major facilitator transporter  35.93 
 
 		 389 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.162648  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1919  major facilitator family transporter  35.93 
 
 		 389 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2691  putative transporter  35.93 
 
 		 389 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0859  major facilitator family transporter  35.93 
 
 		 389 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.288984  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1399  transporter, putative  35.34 
 
 		 404 aa  187  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.169631  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4139  major facilitator superfamily MFS_1  39.77 
 
 		 392 aa  179  7e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1776  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 389 aa  170  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.909315  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2825  major facilitator transporter  32.2 
 
 		 413 aa  165  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122972  normal  0.402197 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1091  major facilitator transporter  35.83 
 
 		 376 aa  163  4.0000000000000004e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.776047  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1953  major facilitator superfamily MFS_1  34.04 
 
 		 402 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3211  major facilitator family transporter  37.74 
 
 		 311 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4144  major facilitator transporter  34.1 
 
 		 392 aa  145  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.30134 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1275  major facilitator transporter  30.83 
 
 		 388 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0932939  normal  0.823078 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3843  major facilitator superfamily MFS_1  31.22 
 
 		 397 aa  138  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0201188 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3861  major facilitator transporter  31.79 
 
 		 388 aa  138  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3675  major facilitator transporter  30.68 
 
 		 380 aa  135  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491115  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4418  major facilitator transporter  31.1 
 
 		 407 aa  133  6e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.39928  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0608  major facilitator family transporter  30.16 
 
 		 380 aa  130  3e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4927  major facilitator superfamily MFS_1  32.85 
 
 		 389 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.185526 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0573  major facilitator family transporter  29.89 
 
 		 380 aa  126  8.000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4881  major facilitator superfamily MFS_1  31.2 
 
 		 389 aa  120  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.164966  normal  0.758142 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1753  MFS permease  29.89 
 
 		 394 aa  120  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221329  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7414  major facilitator superfamily MFS_1  31.34 
 
 		 388 aa  119  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.085887  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3575  major facilitator transporter  30.32 
 
 		 395 aa  116  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0928  major facilitator transporter  30.33 
 
 		 394 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.569755 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1292  major facilitator superfamily MFS_1  30.19 
 
 		 394 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0691449  hitchhiker  0.0026922 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6676  major facilitator transporter  32.41 
 
 		 388 aa  113  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.518138 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1279  major facilitator transporter  30.41 
 
 		 392 aa  111  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.077943 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1710  major facilitator transporter  29.24 
 
 		 393 aa  107  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.69138  normal  0.65846 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3025  major facilitator transporter  30.35 
 
 		 375 aa  101  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1384  major facilitator superfamily MFS_1  30.45 
 
 		 394 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.381678 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3528  major facilitator transporter  23.84 
 
 		 428 aa  90.5  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000328166  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0613  major facilitator transporter  24.72 
 
 		 416 aa  89  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0957759  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0091  major facilitator transporter  31.8 
 
 		 471 aa  86.7  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2043  major facilitator family transporter  24.61 
 
 		 397 aa  85.5  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2954  major facilitator transporter  27.64 
 
 		 412 aa  85.9  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.126979 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1849  major facilitator transporter  23.98 
 
 		 418 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.513333 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0421  major facilitator superfamily MFS_1  26.51 
 
 		 381 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000714938  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5688  major facilitator superfamily MFS_1  25.75 
 
 		 418 aa  82.4  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0510347  normal  0.192354 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1616  major facilitator transporter  24.26 
 
 		 418 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0546554 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2970  major facilitator transporter  24.26 
 
 		 418 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3097  major facilitator transporter  27.37 
 
 		 421 aa  81.3  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0288565 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1301  major facilitator superfamily MFS_1  27.73 
 
 		 377 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1172  major facilitator transporter  25.6 
 
 		 412 aa  76.6  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1427  major facilitator superfamily MFS_1  25.78 
 
 		 430 aa  76.3  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0414  transporter, MFS superfamily  27.54 
 
 		 411 aa  75.5  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.50103  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1740  transporter, putative  25.95 
 
 		 412 aa  74.3  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.138078  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0226  major facilitator transporter  26.01 
 
 		 446 aa  74.7  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.200681  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64590  putative MFS transporter  26.22 
 
 		 438 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0510632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3245  major facilitator superfamily MFS_1  29.26 
 
 		 432 aa  73.2  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.70819  normal  0.24214 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1547  major facilitator transporter  26.43 
 
 		 447 aa  73.2  0.000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2660  major facilitator transporter  26.01 
 
 		 417 aa  73.2  0.000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3645  major facilitator transporter  27.21 
 
 		 480 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000051219  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0739  major facilitator transporter  27.72 
 
 		 480 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000634429  hitchhiker  0.000161748 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0709  major facilitator transporter  27.21 
 
 		 480 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0602177  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2783  major facilitator transporter  28.88 
 
 		 431 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2175  normal  0.236028 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1775  hypothetical protein  29.57 
 
 		 434 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0730  major facilitator superfamily MFS_1  27.21 
 
 		 480 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000305807  hitchhiker  0.0000000180087 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1598  twin-arginine translocation pathway signal  28.15 
 
 		 426 aa  72.8  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.121654  normal  0.207213 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20680  putative MFS transporter  29.57 
 
 		 434 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3112  hypothetical protein  28.38 
 
 		 520 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0751652 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3542  major facilitator superfamily MFS_1  28.89 
 
 		 432 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1718  major facilitator transporter  25.49 
 
 		 429 aa  72  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.150429 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1456  major facilitator transporter  28.63 
 
 		 446 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.357176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3262  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 476 aa  72  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000595189  hitchhiker  0.0000189305 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4398  major facilitator family transporter  28.63 
 
 		 444 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0644  major facilitator transporter  24.9 
 
 		 429 aa  71.2  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3739  major facilitator transporter  28.24 
 
 		 443 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.272825  normal  0.734833 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0699  major facilitator transporter  28.35 
 
 		 474 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000337729  hitchhiker  0.00021718 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3013  major facilitator transporter  27.46 
 
 		 409 aa  70.9  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.382215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>