More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0870 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0870  pentapeptide repeat protein  100 
 
 		 362 aa  748    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0823  pentapeptide repeat-containing protein  63.54 
 
 		 356 aa  476  1e-133  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000611936  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0537  pentapeptide repeat protein  63.16 
 
 		 338 aa  462  1e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0893  pentapeptide repeat-containing protein  42.45 
 
 		 357 aa  90.9  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.417756  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3456  pentapeptide repeat protein  47.83 
 
 		 243 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.651627 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  46.88 
 
 		 268 aa  80.9  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3095  pentapeptide repeat protein  43.75 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1777  pentapeptide repeat protein  43.56 
 
 		 432 aa  79  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3764  pentapeptide repeat protein  46.07 
 
 		 218 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3130  pentapeptide repeat protein  38.61 
 
 		 356 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2990  pentapeptide repeat protein  38.61 
 
 		 356 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1222  pentapeptide repeat protein  40.87 
 
 		 331 aa  76.3  0.0000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154284  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  41.44 
 
 		 264 aa  75.5  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7498  pentapeptide repeat protein  40.54 
 
 		 391 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  34.51 
 
 		 515 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0521  hypothetical protein  42.86 
 
 		 195 aa  73.9  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2409  pentapeptide repeat-containing protein  35.34 
 
 		 123 aa  74.3  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0289  pentapeptide repeat protein  44.57 
 
 		 279 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0246  pentapeptide repeat protein  37.3 
 
 		 260 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.161553 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0289  pentapeptide repeat protein  44.57 
 
 		 279 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  36.8 
 
 		 262 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  37.89 
 
 		 285 aa  70.5  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0651  pentapeptide repeat protein  42.42 
 
 		 300 aa  69.3  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  36.8 
 
 		 262 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0951  pentapeptide repeat protein  39.09 
 
 		 393 aa  68.6  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  37.68 
 
 		 295 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  38.33 
 
 		 182 aa  67.8  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  44.71 
 
 		 184 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0114  hypothetical protein  37.14 
 
 		 235 aa  67  0.0000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.149711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3446  pentapeptide repeat protein  30.65 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1941  pentapeptide repeat protein  37.37 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1915  pentapeptide repeat protein  37.37 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2987  pentapeptide repeat protein  35.77 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1375  pentapeptide repeat protein  42.17 
 
 		 514 aa  65.1  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  29.14 
 
 		 446 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  42.35 
 
 		 340 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  28.79 
 
 		 450 aa  63.2  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0256  pentapeptide repeat protein  30.59 
 
 		 442 aa  63.2  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.306319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  56.14 
 
 		 267 aa  62.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  40.62 
 
 		 245 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1728  pentapeptide repeat-containing protein  39.81 
 
 		 389 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.952308  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1048  pentapeptide repeat-containing protein  37.93 
 
 		 420 aa  62  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0897049  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  39.08 
 
 		 412 aa  62  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  36 
 
 		 441 aa  61.2  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  44.16 
 
 		 517 aa  61.2  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  53.23 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0020  TPR repeat-containing protein  47.37 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4093  pentapeptide repeat-containing protein  46.67 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.864447  normal  0.810345 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2355  pentapeptide repeat protein  45.07 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.390943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2304  pentapeptide repeat protein  45.07 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3807  pentapeptide repeat protein  53.33 
 
 		 259 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1107  TPR repeat-containing protein  45.71 
 
 		 266 aa  58.9  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.684682  normal  0.836 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  45.76 
 
 		 525 aa  59.3  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  33.06 
 
 		 286 aa  58.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  47.76 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3418  pentapeptide repeat-containing protein  39.76 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0386  pentapeptide repeat protein  52.63 
 
 		 509 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  49.18 
 
 		 386 aa  58.5  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1228  hypothetical protein  47.06 
 
 		 168 aa  57.8  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00146717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1237  pentapeptide repeat-containing protein  39.25 
 
 		 438 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.234159 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  51.72 
 
 		 343 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3313  hypothetical protein  49.25 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  29.41 
 
 		 447 aa  57.4  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  51.72 
 
 		 343 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  33.08 
 
 		 320 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  46.58 
 
 		 408 aa  57  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  37.17 
 
 		 449 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  38.95 
 
 		 1033 aa  56.6  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3383  pentapeptide repeat protein  44.44 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.438267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  49.23 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2944  pentapeptide repeat-containing protein  47.06 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.281269  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  39.18 
 
 		 903 aa  56.2  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  34.96 
 
 		 567 aa  56.2  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  35.14 
 
 		 900 aa  55.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  31.39 
 
 		 333 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  35.71 
 
 		 381 aa  55.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3090  hypothetical protein  43.28 
 
 		 362 aa  55.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0391882  normal  0.0374194 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  45.45 
 
 		 576 aa  55.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  29.31 
 
 		 447 aa  55.8  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.81 
 
 		 14916 aa  55.5  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1326  pentapeptide repeat-containing protein  44.93 
 
 		 497 aa  55.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1610  pentapeptide repeat protein  36.47 
 
 		 408 aa  55.5  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000228674  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0019  pentapeptide repeat-containing protein  43.33 
 
 		 292 aa  55.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400102  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4620  pentapeptide repeat protein  50.7 
 
 		 115 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4550  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  45 
 
 		 526 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4964  pentapeptide repeat-containing protein  44.44 
 
 		 250 aa  55.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  47.62 
 
 		 263 aa  55.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2086  hypothetical protein  38.78 
 
 		 156 aa  54.7  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0810  pentapeptide repeat protein  39.58 
 
 		 149 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  29.93 
 
 		 493 aa  55.1  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0580  pentapeptide repeat-containing protein  50 
 
 		 194 aa  55.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0783  pentapeptide repeat protein  39.58 
 
 		 149 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  49.21 
 
 		 351 aa  54.7  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3776  pentapeptide repeat-containing protein  46.03 
 
 		 255 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.109684 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2972  pentapeptide repeat protein  42.86 
 
 		 145 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2170  pentapeptide repeat protein  46.25 
 
 		 296 aa  54.3  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  42.53 
 
 		 309 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  44.93 
 
 		 184 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  31.91 
 
 		 225 aa  54.3  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  41.79 
 
 		 521 aa  53.9  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>