108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0537 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0537  pentapeptide repeat protein  100 
 
 		 338 aa  690    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0823  pentapeptide repeat-containing protein  67.24 
 
 		 356 aa  484  1e-135  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000611936  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0870  pentapeptide repeat protein  63.16 
 
 		 362 aa  479  1e-134  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3764  pentapeptide repeat protein  51.32 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  37.72 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2990  pentapeptide repeat protein  31.15 
 
 		 356 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3130  pentapeptide repeat protein  31.15 
 
 		 356 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1237  pentapeptide repeat-containing protein  44.3 
 
 		 438 aa  63.2  0.000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.234159 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0893  pentapeptide repeat-containing protein  36.56 
 
 		 357 aa  62.8  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.417756  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0289  pentapeptide repeat protein  40.85 
 
 		 279 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0289  pentapeptide repeat protein  40.85 
 
 		 279 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  41.98 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0521  hypothetical protein  50 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2409  pentapeptide repeat-containing protein  39.51 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3095  pentapeptide repeat protein  42.86 
 
 		 210 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7498  pentapeptide repeat protein  41.86 
 
 		 391 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1777  pentapeptide repeat protein  39.47 
 
 		 432 aa  57  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1048  pentapeptide repeat-containing protein  44.78 
 
 		 420 aa  57  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0897049  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  38.3 
 
 		 412 aa  56.2  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  40.85 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3456  pentapeptide repeat protein  43.06 
 
 		 243 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.651627 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  30.8 
 
 		 515 aa  54.7  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  40.85 
 
 		 262 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1222  pentapeptide repeat protein  31.13 
 
 		 331 aa  53.9  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154284  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0246  pentapeptide repeat protein  38.03 
 
 		 260 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.161553 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  30.38 
 
 		 295 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1728  pentapeptide repeat-containing protein  37.35 
 
 		 389 aa  53.1  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.952308  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  37.5 
 
 		 264 aa  52.4  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  45.76 
 
 		 441 aa  52.4  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2987  pentapeptide repeat protein  39.33 
 
 		 130 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1610  pentapeptide repeat protein  44.62 
 
 		 408 aa  51.6  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000228674  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3446  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 		 206 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  46.94 
 
 		 517 aa  50.1  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  37.76 
 
 		 184 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0651  pentapeptide repeat protein  64.1 
 
 		 300 aa  49.7  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  35.44 
 
 		 340 aa  49.7  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  24.6 
 
 		 600 aa  49.3  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0951  pentapeptide repeat protein  45.33 
 
 		 393 aa  48.9  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1915  pentapeptide repeat protein  28.23 
 
 		 149 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1941  pentapeptide repeat protein  28.23 
 
 		 149 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1326  pentapeptide repeat-containing protein  49.02 
 
 		 497 aa  47.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4550  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  38.16 
 
 		 526 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1862  hypothetical protein  48.21 
 
 		 103 aa  47  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.833098  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  57.78 
 
 		 184 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5479  hypothetical protein  50 
 
 		 279 aa  47  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0226407  decreased coverage  0.00750026 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  42.03 
 
 		 1033 aa  46.6  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  39.13 
 
 		 973 aa  46.6  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0369  pentapeptide repeat-containing protein  42.25 
 
 		 256 aa  46.2  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1437  pentapeptide repeat protein  33.65 
 
 		 411 aa  46.2  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5950  pentapeptide repeat protein  59.52 
 
 		 289 aa  46.2  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1228  hypothetical protein  39.66 
 
 		 168 aa  45.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00146717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  33.33 
 
 		 286 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0020  TPR repeat-containing protein  38.46 
 
 		 256 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3099  pentapeptide repeat-containing protein  62.16 
 
 		 284 aa  45.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.240608  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4923  Serine/threonine protein kinase  36.84 
 
 		 524 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  35.71 
 
 		 447 aa  45.1  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2086  hypothetical protein  51.11 
 
 		 156 aa  44.7  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  62.86 
 
 		 319 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4130  pentapeptide repeat-containing protein  46.55 
 
 		 308 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.745162  normal  0.353762 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1212  pentapeptide repeat-containing protein  53.33 
 
 		 420 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.643735 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  37.21 
 
 		 320 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  41.94 
 
 		 266 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  53.66 
 
 		 309 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0057  pentapeptide repeat protein  45.71 
 
 		 283 aa  44.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5548  pentapeptide repeat protein  59.52 
 
 		 276 aa  44.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.262169  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  56.41 
 
 		 745 aa  44.3  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0258  hypothetical protein  48.89 
 
 		 147 aa  44.3  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0195  hypothetical protein  56.41 
 
 		 142 aa  43.9  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.673966 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  41.3 
 
 		 351 aa  44.3  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  34.52 
 
 		 567 aa  44.3  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2355  pentapeptide repeat protein  43.33 
 
 		 234 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.390943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2944  pentapeptide repeat-containing protein  54.76 
 
 		 172 aa  44.3  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.281269  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3735  pentapeptide repeat-containing protein  57.14 
 
 		 206 aa  44.3  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3786  pentapeptide repeat-containing protein  57.14 
 
 		 206 aa  44.3  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  30.17 
 
 		 408 aa  44.3  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0545  pentapeptide repeat protein  48.94 
 
 		 315 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2304  pentapeptide repeat protein  43.33 
 
 		 234 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  56 
 
 		 277 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3175  pentapeptide repeat-containing protein  42.86 
 
 		 273 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3425  pentapeptide repeat-containing protein  42.86 
 
 		 273 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1482  pentapeptide repeat-containing protein  60.98 
 
 		 392 aa  43.9  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0501113  normal  0.460509 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0256  pentapeptide repeat protein  40.58 
 
 		 442 aa  43.9  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.306319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1850  pentapeptide repeats domain protein  59.46 
 
 		 273 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  43.33 
 
 		 291 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3159  pentapeptide repeat-containing oxetanocin A resistance protein  42.86 
 
 		 273 aa  43.5  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3076  pentapeptide repeat-containing oxetanocin A resistance protein  42.86 
 
 		 273 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  53.66 
 
 		 214 aa  43.5  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0250  hypothetical protein  50 
 
 		 155 aa  43.5  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1107  TPR repeat-containing protein  42.86 
 
 		 266 aa  43.5  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.684682  normal  0.836 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4837  pentapeptide repeat-containing protein  33.75 
 
 		 151 aa  43.5  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000291889  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2406  pentapeptide repeat-containing protein  48.08 
 
 		 288 aa  43.5  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3381  pentapeptide repeats domain protein  42.86 
 
 		 273 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  43.33 
 
 		 291 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0386  pentapeptide repeat protein  46.51 
 
 		 509 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3394  pentapeptide repeats domain protein  42.86 
 
 		 273 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1435  pentapeptide repeat protein  35.85 
 
 		 400 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  44.19 
 
 		 267 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3383  pentapeptide repeat protein  38.67 
 
 		 179 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.438267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0475  pentapeptide repeat-containing protein  45.28 
 
 		 204 aa  43.5  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.019443 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3406  pentapeptide repeats domain protein  42.86 
 
 		 273 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>