208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0362 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0362  protein of unknown function UPF0066  100 
 
 		 155 aa  322  9e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1968  hypothetical protein  53.55 
 
 		 155 aa  175  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00329257  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0989  protein of unknown function UPF0066  42.58 
 
 		 164 aa  134  4e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000019612  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0270  hypothetical protein  48.95 
 
 		 160 aa  134  5e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1885  hypothetical protein  42.67 
 
 		 167 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0552  hypothetical protein  41.78 
 
 		 162 aa  124  3e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0760  hypothetical protein  48.23 
 
 		 143 aa  122  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000599137  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0736  hypothetical protein  48.23 
 
 		 143 aa  122  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000191321  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0337  hypothetical protein  42.96 
 
 		 183 aa  122  2e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0758106  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1562  protein of unknown function UPF0066  44.03 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1018  protein of unknown function UPF0066  40.14 
 
 		 171 aa  118  3.9999999999999996e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1333  hypothetical protein  43.97 
 
 		 181 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.481113  normal  0.0143479 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2088  hypothetical protein  40 
 
 		 183 aa  117  6e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1889  protein of unknown function UPF0066  41.38 
 
 		 164 aa  117  6e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2646  hypothetical protein  39.44 
 
 		 167 aa  114  6e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0470  hypothetical protein  41.13 
 
 		 166 aa  113  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0817214  normal  0.048877 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4260  hypothetical protein  43.28 
 
 		 166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905923  normal  0.100966 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1584  protein of unknown function UPF0066  42.55 
 
 		 166 aa  110  6e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0258  hypothetical protein  36.99 
 
 		 163 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4082  protein of unknown function UPF0066  38.57 
 
 		 166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0340  hypothetical protein  43.28 
 
 		 145 aa  108  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.634355  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2483  protein of unknown function UPF0066  40.44 
 
 		 175 aa  106  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2475  protein of unknown function UPF0066  40.15 
 
 		 294 aa  106  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0512  hypothetical protein  40.14 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.140743  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1330  protein of unknown function UPF0066  36.55 
 
 		 205 aa  100  9e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143351  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1228  protein of unknown function UPF0066  39.19 
 
 		 161 aa  100  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3464  hypothetical protein  35.85 
 
 		 235 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0230966  normal  0.865335 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0265  hypothetical protein  35.62 
 
 		 246 aa  97.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.222677 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0281  hypothetical protein  35.62 
 
 		 246 aa  97.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.236696 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0284  hypothetical protein  35.62 
 
 		 235 aa  98.2  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0270  hypothetical protein  35.62 
 
 		 246 aa  98.2  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0768014 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0265  hypothetical protein  35.62 
 
 		 246 aa  97.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.485834  normal  0.889458 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0843  protein of unknown function UPF0066  35.62 
 
 		 235 aa  97.4  7e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000863698  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0341  protein of unknown function UPF0066  36.81 
 
 		 150 aa  97.1  8e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00194  hypothetical protein  35.85 
 
 		 235 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.043388  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3407  protein of unknown function UPF0066  34.81 
 
 		 235 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000511594  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0189  hypothetical protein  34.81 
 
 		 235 aa  95.5  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0457219  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1186  hypothetical protein  36.3 
 
 		 235 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0202  hypothetical protein  34.81 
 
 		 235 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000993842  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00193  hypothetical protein  35.85 
 
 		 235 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0320479  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0024  protein of unknown function UPF0066  38.28 
 
 		 135 aa  95.9  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0199  hypothetical protein  34.81 
 
 		 235 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0201514  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0874  protein of unknown function UPF0066  35.95 
 
 		 235 aa  94.4  5e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0588086  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0206  hypothetical protein  34.81 
 
 		 235 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0519396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2822  heat shock protein DnaJ-like  37.5 
 
 		 233 aa  94.4  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000736424 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002726  hypothetical protein  38.41 
 
 		 234 aa  94.4  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0430932  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5557  protein of unknown function UPF0066  37.96 
 
 		 162 aa  94  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233079  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3757  hypothetical protein  34.59 
 
 		 235 aa  93.6  8e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  normal  0.0834525 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0207  hypothetical protein  34.18 
 
 		 235 aa  94  8e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.9755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1092  hypothetical protein  35.95 
 
 		 235 aa  93.2  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1440  hypothetical protein  36 
 
 		 241 aa  93.2  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3409  hypothetical protein  35.95 
 
 		 235 aa  93.2  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0939148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1039  hypothetical protein  35.95 
 
 		 235 aa  92.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0011739  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0891  hypothetical protein  38.56 
 
 		 232 aa  92.8  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.150441  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2841  hypothetical protein  38.82 
 
 		 248 aa  92  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03251  hypothetical protein  39.07 
 
 		 231 aa  91.7  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38460  hypothetical protein  34.64 
 
 		 240 aa  91.7  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0733  hypothetical protein  34.59 
 
 		 235 aa  91.7  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0409036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0248  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  39.69 
 
 		 311 aa  91.3  4e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3346  hypothetical protein  35.53 
 
 		 238 aa  91.3  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00404428  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1742  hypothetical protein  36.3 
 
 		 231 aa  91.3  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4023  hypothetical protein  35.17 
 
 		 239 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1388  hypothetical protein  34.48 
 
 		 230 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.767988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3503  protein of unknown function UPF0066  34.87 
 
 		 238 aa  89.7  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0149186  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0276  protein of unknown function UPF0066  38.64 
 
 		 145 aa  89.7  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0401  hypothetical protein  35.9 
 
 		 231 aa  89.7  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000112089  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20260  hypothetical protein  36.3 
 
 		 231 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.675197 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3287  hypothetical protein  34.84 
 
 		 238 aa  89  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.231288  normal  0.0827717 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1936  hypothetical protein  35.61 
 
 		 151 aa  88.6  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2344  protein of unknown function UPF0066  33.33 
 
 		 231 aa  88.2  4e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.183412  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4227  hypothetical protein  34.48 
 
 		 230 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.940222 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1220  hypothetical protein  34.48 
 
 		 230 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.420343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0453  hypothetical protein  37.96 
 
 		 165 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.276022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5324  hypothetical protein  35.04 
 
 		 162 aa  87  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1189  hypothetical protein  34.48 
 
 		 232 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.7243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4020  hypothetical protein  33.79 
 
 		 231 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012325 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0682  protein of unknown function UPF0066  34.62 
 
 		 167 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.354835 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2860  hypothetical protein  38.16 
 
 		 256 aa  85.9  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.486739  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3241  hypothetical protein  35.37 
 
 		 240 aa  84.3  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.488613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0110  protein of unknown function UPF0066  32.89 
 
 		 228 aa  84.3  5e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2266  protein of unknown function UPF0066  36.03 
 
 		 167 aa  84.3  5e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.864742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0709  hypothetical protein  34.62 
 
 		 178 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.045832  normal  0.207854 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4617  protein of unknown function UPF0066  40 
 
 		 163 aa  84  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.521313 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1705  hypothetical protein  32 
 
 		 234 aa  84  8e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.19397 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2362  regulator protein  33.33 
 
 		 237 aa  82.4  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0222  hypothetical protein  34.39 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00354115  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0867  hypothetical protein  37.6 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2853  hypothetical protein  32.3 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00329387  hitchhiker  0.000000086947 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0722  protein of unknown function UPF0066  33.85 
 
 		 168 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0604494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1347  hypothetical protein  34.01 
 
 		 244 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0192591 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1984  hypothetical protein  40 
 
 		 164 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1400  hypothetical protein  34.01 
 
 		 244 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.381665 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3151  hypothetical protein  33.33 
 
 		 244 aa  80.9  0.000000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2542  hypothetical protein  34.93 
 
 		 265 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00464055  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1412  hypothetical protein  34.01 
 
 		 244 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1135  hypothetical protein  35.2 
 
 		 138 aa  80.5  0.000000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00122763  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2516  hypothetical protein  34.69 
 
 		 244 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.507921  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2411  hypothetical protein  32.21 
 
 		 182 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.543009  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6400  protein of unknown function UPF0066  40 
 
 		 174 aa  80.1  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2481  hypothetical protein  41.67 
 
 		 182 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.35717 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>