More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4859 on replicon NC_008759
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008759  Pnap_4859  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 310 aa  619  1e-176  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.311707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4628  cation diffusion facilitator family transporter  55.33 
 
 		 308 aa  335  7e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0300132  normal  0.143648 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4528  cation diffusion facilitator family transporter  56.71 
 
 		 301 aa  317  1e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0843  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  56.71 
 
 		 327 aa  298  5e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2798  cation diffusion facilitator family transporter  37.93 
 
 		 300 aa  217  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1390  cation diffusion facilitator family transporter  39.86 
 
 		 309 aa  208  8e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2205  cation diffusion facilitator family transporter  41.75 
 
 		 317 aa  208  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.244213 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0759  cation diffusion facilitator family transporter  39.58 
 
 		 319 aa  206  5e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  0.101295 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4986  cation diffusion facilitator family transporter  39.67 
 
 		 318 aa  199  5e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.992274 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0964  cation diffusion facilitator family transporter  38.64 
 
 		 323 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1482  cation diffusion facilitator family transporter  39.6 
 
 		 305 aa  196  3e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348371  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4060  cation diffusion facilitator family transporter  38.19 
 
 		 315 aa  194  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1782  cation efflux protein  36.39 
 
 		 321 aa  193  3e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5899  cation diffusion facilitator family transporter  40.79 
 
 		 312 aa  192  9e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.847836 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1671  cation diffusion facilitator family transporter  43.89 
 
 		 341 aa  191  1e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.357995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4358  cation diffusion facilitator family transporter  37.78 
 
 		 312 aa  187  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0273314 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4176  cation diffusion facilitator family transporter  37.95 
 
 		 318 aa  187  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  0.120202 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4570  cation diffusion facilitator family transporter  41.69 
 
 		 308 aa  186  3e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0901  cation diffusion facilitator family transporter  40.53 
 
 		 323 aa  186  6e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.549098  normal  0.0315614 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1771  cation transporter, permease component  37.92 
 
 		 312 aa  185  7e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.52517  normal  0.0251557 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2403  cation diffusion facilitator family transporter  40.33 
 
 		 308 aa  185  9e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0831069 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6323  cation diffusion facilitator family transporter  36.79 
 
 		 305 aa  185  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.275453  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1222  cation diffusion facilitator family transporter  37.42 
 
 		 335 aa  182  9.000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0856853  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1141  cation diffusion facilitator family transporter  42.31 
 
 		 344 aa  179  4.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3754  cation diffusion facilitator family transporter  36.97 
 
 		 319 aa  177  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal  0.0201065 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04980  cation diffusion facilitator family transporter  33.11 
 
 		 351 aa  173  3.9999999999999995e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1337  cation diffusion facilitator family transporter  32.19 
 
 		 297 aa  172  5.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09160  cation diffusion facilitator family transporter  38.61 
 
 		 311 aa  171  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.236518 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01760  cation transport protein  34.14 
 
 		 310 aa  169  4e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.664458  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0314  cation diffusion facilitator family transporter  32.41 
 
 		 315 aa  169  8e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00366516  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4836  cation diffusion facilitator family transporter  34.58 
 
 		 344 aa  167  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0438  cation diffusion facilitator family transporter  31.85 
 
 		 305 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1360  cation diffusion facilitator family transporter  36.16 
 
 		 308 aa  165  6.9999999999999995e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.733609  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2733  cation diffusion facilitator family transporter  34.92 
 
 		 303 aa  162  5.0000000000000005e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.924366 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4688  cation diffusion facilitator family transporter  34.15 
 
 		 340 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.105315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3642  cation diffusion facilitator family transporter  36.67 
 
 		 306 aa  161  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18150  cation diffusion facilitator family transporter  39.66 
 
 		 333 aa  161  1e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.040003  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4319  cation diffusion facilitator family transporter  32.68 
 
 		 340 aa  160  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.337852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2294  cation diffusion facilitator family transporter  34.36 
 
 		 316 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.547422  normal  0.0692994 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4489  cation diffusion facilitator family transporter  41.95 
 
 		 298 aa  159  4e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0696938  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1535  cation transporter  39.55 
 
 		 314 aa  159  7e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000520481  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0337  cation diffusion facilitator family transporter  32.59 
 
 		 317 aa  159  8e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6007  cation diffusion facilitator family transporter  36.81 
 
 		 318 aa  157  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000180235  normal  0.0482641 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0719  cation diffusion facilitator family transporter  32.24 
 
 		 317 aa  157  2e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.176085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0824  cation diffusion facilitator family transporter  33.13 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1776  cation diffusion facilitator family transporter  33.12 
 
 		 331 aa  154  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15840  cation diffusion facilitator family transporter  41.77 
 
 		 330 aa  152  5.9999999999999996e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0295816  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4110  cation diffusion facilitator family transporter  31.02 
 
 		 317 aa  152  8.999999999999999e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3015  cation diffusion facilitator family transporter  36.45 
 
 		 327 aa  151  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137928  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3687  cation diffusion facilitator family transporter  40.32 
 
 		 321 aa  150  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.271523 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3824  cation diffusion facilitator family transporter  34.21 
 
 		 283 aa  148  9e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2745  cation diffusion facilitator family transporter  31.97 
 
 		 363 aa  149  9e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1993  cation diffusion facilitator family transporter  30.53 
 
 		 326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0065  cation diffusion facilitator family transporter  36.03 
 
 		 329 aa  142  9e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0908  cation diffusion facilitator family transporter  37.46 
 
 		 353 aa  138  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00327359  normal  0.0207813 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1593  cation diffusion facilitator family transporter  36.36 
 
 		 302 aa  137  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.315476  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4497  cation diffusion facilitator family transporter  28.99 
 
 		 353 aa  135  6.0000000000000005e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0733  cation diffusion facilitator family transporter  36.55 
 
 		 365 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.299752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26540  cation diffusion facilitator family transporter  30.34 
 
 		 426 aa  133  5e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0548124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1307  cation diffusion facilitator family transporter  30.61 
 
 		 321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1655  cation diffusion facilitator family transporter  33.21 
 
 		 318 aa  125  6e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39741  CDF family transporter: cation efflux  33.2 
 
 		 345 aa  123  4e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_13994  predicted protein  31.05 
 
 		 336 aa  118  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455794  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0672  zinc transporter ZitB  24.65 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00307439  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2381  cation diffusion facilitator family transporter  25.12 
 
 		 388 aa  70.5  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000223883  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3245  cation efflux protein  27.91 
 
 		 309 aa  69.3  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3406  cation diffusion facilitator family transporter  27.13 
 
 		 337 aa  69.3  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2127  cation diffusion facilitator family transporter  22.73 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139968  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09106  cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcD  28.99 
 
 		 313 aa  66.2  0.0000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.341807  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0076  cation diffusion facilitator family transporter  26.33 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.097535  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  22.68 
 
 		 312 aa  65.5  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  24.82 
 
 		 305 aa  65.5  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0339  cation diffusion facilitator family transporter  25.32 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000143188  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0706  cation efflux family protein  27.08 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04870  cation diffusion facilitator family transporter  33.63 
 
 		 374 aa  63.5  0.000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0272  MMT1 protein  27.5 
 
 		 372 aa  63.2  0.000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00381399  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2334  cation efflux family protein  22.38 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4494  cation efflux family protein  27.08 
 
 		 298 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2093  cation efflux protein  22.38 
 
 		 296 aa  62.4  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0345856  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  26.35 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2343  cation efflux family protein  22.38 
 
 		 293 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.412902  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2155  cation efflux family protein  22.38 
 
 		 296 aa  62.4  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.112799  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2089  cation efflux protein  22.38 
 
 		 296 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.328738  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2310  cation efflux family protein  22.38 
 
 		 296 aa  62.4  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2291  cation efflux family protein  22.38 
 
 		 293 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2418  cation efflux family protein  22.38 
 
 		 293 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3033  cation efflux family protein  22.38 
 
 		 293 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2890  cation diffusion facilitator family transporter  23.78 
 
 		 313 aa  62  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00172729  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2910  zinc transporter ZitB  23.78 
 
 		 313 aa  62  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.248313  normal  0.320086 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0778  zinc transporter ZitB  23.78 
 
 		 313 aa  62  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000446188  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0806  zinc transporter ZitB  23.78 
 
 		 313 aa  62  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.002525  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1410  cation diffusion facilitator family transporter  21.61 
 
 		 333 aa  62  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00705  zinc transporter ZitB  23.78 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0137871  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08140  cation diffusion facilitator family transporter  22.94 
 
 		 369 aa  61.2  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.150714  normal  0.172071 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0576  cation efflux family protein  23.14 
 
 		 393 aa  61.2  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00694  hypothetical protein  23.78 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0161088  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  30.66 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0853  zinc transporter ZitB  23.43 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0287649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  30.66 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0586  cation efflux family protein  23.14 
 
 		 393 aa  60.8  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0440871  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>