139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1132 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1132  hypothetical protein  100 
 
 		 259 aa  498  1e-140  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1670  hypothetical protein  69.14 
 
 		 255 aa  302  3.0000000000000004e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2924  hypothetical protein  46.74 
 
 		 271 aa  186  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.825508 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2935  hypothetical protein  45.98 
 
 		 266 aa  176  4e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3784  hypothetical protein  42.69 
 
 		 256 aa  146  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.570332 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09020  hypothetical protein  46.45 
 
 		 253 aa  142  6e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0452  transmembrane protein  40.59 
 
 		 251 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0249922  normal  0.582839 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4809  hypothetical protein  38.62 
 
 		 256 aa  122  5e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0761  protein of unknown function DUF218  40.4 
 
 		 262 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1123  hypothetical protein  38.98 
 
 		 253 aa  119  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4350  hypothetical protein  36.36 
 
 		 256 aa  118  7e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.571973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0343  hypothetical protein  39.55 
 
 		 251 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.132846  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2685  hypothetical protein  37.55 
 
 		 251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0188872  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4792  hypothetical protein  34.24 
 
 		 253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.261557 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12270  hypothetical protein  42.22 
 
 		 253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4845  hypothetical protein  32.46 
 
 		 253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4667  hypothetical protein  34.24 
 
 		 253 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0629  hypothetical protein  36.77 
 
 		 253 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0550137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0547  hypothetical protein  44.44 
 
 		 252 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2494  protein of unknown function DUF218  42.11 
 
 		 215 aa  112  5e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4693  protein of unknown function DUF218  40.62 
 
 		 247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203354  normal  0.120378 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0162  hypothetical protein  43.32 
 
 		 247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0817  protein of unknown function DUF218  41.05 
 
 		 259 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.562858  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4955  hypothetical protein  36.2 
 
 		 259 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371656 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1968  hypothetical protein  38.06 
 
 		 265 aa  98.6  9e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0451  hypothetical protein  36.13 
 
 		 230 aa  98.2  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0851165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  28.35 
 
 		 242 aa  95.9  6e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2201  protein of unknown function DUF218  33.98 
 
 		 264 aa  86.3  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0561041  normal  0.0364927 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2571  hypothetical protein  34.26 
 
 		 266 aa  85.9  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0069  protein of unknown function DUF218  29.21 
 
 		 261 aa  82.4  0.000000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  28.97 
 
 		 256 aa  80.1  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  29.02 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  29.05 
 
 		 251 aa  75.9  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  26.85 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  28.36 
 
 		 260 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0964  protein of unknown function DUF218  28.25 
 
 		 244 aa  73.2  0.000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000017074  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  33.87 
 
 		 262 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0549  protein of unknown function DUF218  32.08 
 
 		 262 aa  70.1  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4460  hypothetical protein  28.86 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472125  normal  0.336495 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  29.33 
 
 		 263 aa  67.8  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4276  protein of unknown function DUF218  26.24 
 
 		 272 aa  67.8  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1666  hypothetical protein  35.11 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1910  protein of unknown function DUF218  31.39 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0244729 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0148  hypothetical protein  35.36 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.692112  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  31.09 
 
 		 265 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2287  protein of unknown function DUF218  28.29 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  31.09 
 
 		 265 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  28.63 
 
 		 280 aa  61.6  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2573  hypothetical protein  28.97 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  32.31 
 
 		 281 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1557  hypothetical protein  31.52 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1321  hypothetical protein  27.73 
 
 		 282 aa  59.3  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000340007  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0886  hypothetical protein  24.5 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.351499  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1177  hypothetical protein  29.88 
 
 		 268 aa  58.9  0.00000007  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00488097  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2014  hypothetical protein  30.59 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2002  hypothetical protein  27.38 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3555  hypothetical protein  31.12 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12821  hypothetical protein  32.58 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0127  protein of unknown function DUF218  30.83 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.703428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1136  hypothetical protein  29.46 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  26.17 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4612  hypothetical protein  32.78 
 
 		 262 aa  54.7  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1732  protein of unknown function DUF218  28.35 
 
 		 250 aa  55.1  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000709574  normal  0.252079 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0731  hypothetical protein  27.56 
 
 		 287 aa  54.3  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.853147  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  26.17 
 
 		 237 aa  54.7  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  32.54 
 
 		 278 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2596  hypothetical protein  29.06 
 
 		 250 aa  53.1  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0625  protein of unknown function DUF218  32.61 
 
 		 248 aa  53.1  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0050402  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  31.16 
 
 		 265 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2431  hypothetical protein  30.96 
 
 		 267 aa  52.8  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53127  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2730  protein of unknown function DUF218  30.51 
 
 		 279 aa  52  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.111496 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  31.62 
 
 		 278 aa  52  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3453  hypothetical protein  27.32 
 
 		 262 aa  50.4  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1322  hypothetical protein  31.03 
 
 		 252 aa  49.7  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2551  hypothetical protein  36 
 
 		 206 aa  49.3  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1622  protein of unknown function DUF218  29.57 
 
 		 262 aa  49.3  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.278756 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0755  protein of unknown function DUF218  30.22 
 
 		 264 aa  49.3  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000325401 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2878  protein of unknown function DUF218  30.22 
 
 		 260 aa  48.9  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2405  hypothetical protein  32.4 
 
 		 259 aa  48.9  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000200717  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00924  conserved inner membrane protein  31.87 
 
 		 259 aa  48.9  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0692012  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2723  protein of unknown function DUF218  31.87 
 
 		 259 aa  48.9  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00143107  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2681  hypothetical protein  25.9 
 
 		 250 aa  48.9  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00931  hypothetical protein  31.87 
 
 		 259 aa  48.9  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0659639  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1080  hypothetical protein  31.87 
 
 		 259 aa  48.9  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00727998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1027  hypothetical protein  31.87 
 
 		 259 aa  48.9  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000464041  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1017  hypothetical protein  31.87 
 
 		 259 aa  48.9  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000186844  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2676  hypothetical protein  31.87 
 
 		 259 aa  48.9  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000584627  normal  0.41839 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2201  hypothetical protein  31.87 
 
 		 259 aa  48.9  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000670511  normal  0.151519 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0773  hypothetical protein  24.57 
 
 		 300 aa  48.1  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000262461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1673  hypothetical protein  32.88 
 
 		 284 aa  48.5  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.255885 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2830  putative lipoprotein transmembrane  27.71 
 
 		 225 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.160067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1206  hypothetical protein  34.83 
 
 		 251 aa  47.4  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1021  hypothetical protein  27.49 
 
 		 267 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47504  normal  0.0154431 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01585  hypothetical protein  27.11 
 
 		 268 aa  47.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2554  hypothetical protein  33.75 
 
 		 264 aa  47.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.509149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3832  protein of unknown function DUF218  29.21 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1098  hypothetical protein  26.09 
 
 		 342 aa  47  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0131403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1088  hypothetical protein  34.72 
 
 		 258 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.213248  normal  0.252564 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1104  hypothetical protein  34.72 
 
 		 258 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0147337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2266  hypothetical protein  30.04 
 
 		 268 aa  46.6  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>