More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1658 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1658  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
243 aa  485  1e-136  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000026827  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18770  extracellular solute-binding protein family 3  59.59 
 
 
244 aa  286  2e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.74936e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  39.53 
 
 
250 aa  174  9.999999999999999e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1692  extracellular solute-binding protein family 3  39.73 
 
 
258 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.350495 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  43.69 
 
 
247 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  41.33 
 
 
263 aa  169  3e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0031  extracellular solute-binding protein  37.22 
 
 
272 aa  167  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.246666  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0032  extracellular solute-binding protein  39.29 
 
 
276 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.427857  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1804  extracellular solute-binding protein family 3  38.05 
 
 
267 aa  156  2e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  41.89 
 
 
246 aa  154  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1664  extracellular solute-binding protein family 3  35.29 
 
 
294 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0778  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  41.44 
 
 
246 aa  152  4e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0125  extracellular solute-binding protein family 3  37.56 
 
 
270 aa  150  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  36.25 
 
 
271 aa  150  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1361  extracellular solute-binding protein  36.61 
 
 
257 aa  148  7e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1803  extracellular solute-binding protein  37.61 
 
 
288 aa  147  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.363702  normal  0.037594 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3903  extracellular solute-binding protein  41.63 
 
 
252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.754855  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3517  extracellular solute-binding protein family 3  34.98 
 
 
273 aa  143  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1868  extracellular solute-binding protein family 3  35.91 
 
 
247 aa  143  3e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.265180000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2184  extracellular solute-binding protein  36.68 
 
 
295 aa  142  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092646 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1148  extracellular solute-binding protein  35.56 
 
 
283 aa  142  5e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  37.44 
 
 
257 aa  142  6e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1135  extracellular solute-binding protein  38.12 
 
 
268 aa  141  7e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0567537  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3397  extracellular solute-binding protein  37.89 
 
 
245 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0589  extracellular solute-binding protein family 3  33.87 
 
 
247 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0251025  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0489  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.87 
 
 
490 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  36.77 
 
 
264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1126  extracellular solute-binding protein  37 
 
 
284 aa  139  3.9999999999999997e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0588  extracellular solute-binding protein family 3  34.14 
 
 
247 aa  138  6e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00341778  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2054  extracellular solute-binding protein  34.82 
 
 
258 aa  138  7.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.179486 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.8 
 
 
513 aa  136  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3166  extracellular solute-binding protein  34.38 
 
 
242 aa  135  4e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.190587  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  38.77 
 
 
260 aa  135  5e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0413  homoserine kinase (HSK; HK)  37.05 
 
 
256 aa  135  6.0000000000000005e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.862983  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0805  extracellular solute-binding protein family 3  33.73 
 
 
247 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.789569  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0210  hypothetical protein  33.46 
 
 
263 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3760  extracellular solute-binding protein  36 
 
 
245 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000882813  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2011  extracellular solute-binding protein  34.53 
 
 
282 aa  135  8e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.986691  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0928  extracellular solute-binding protein family 3  37.27 
 
 
254 aa  134  9.999999999999999e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3053  extracellular solute-binding protein  35.71 
 
 
244 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000807518  normal  0.0316275 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0501  extracellular solute-binding protein  34.84 
 
 
281 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1259  extracellular solute-binding protein  33.93 
 
 
295 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0882  extracellular solute-binding protein  35.71 
 
 
244 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00121366  normal  0.225798 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  35.71 
 
 
264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0186  extracellular solute-binding protein  31.2 
 
 
251 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0178  extracellular solute-binding protein  33.78 
 
 
299 aa  132  5e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0919  extracellular solute-binding protein  34.82 
 
 
244 aa  131  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1863  extracellular solute-binding protein  33.04 
 
 
292 aa  131  9e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3027  extracellular solute-binding protein  35.71 
 
 
244 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3442  extracellular solute-binding protein  33.19 
 
 
285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1655  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  33.47 
 
 
243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.568539 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0986  extracellular solute-binding protein  34.38 
 
 
244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0951  extracellular solute-binding protein  34.38 
 
 
244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0860  extracellular solute-binding protein family 3  34.52 
 
 
246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.599972 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3392  extracellular solute-binding protein  34.38 
 
 
244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0624048  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0419  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.78 
 
 
260 aa  129  3e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000266261  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2452  extracellular solute-binding protein family 3  36.77 
 
 
259 aa  129  3e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1379  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  35.08 
 
 
243 aa  129  5.0000000000000004e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1044  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.36 
 
 
244 aa  128  6e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1023  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtI  33.87 
 
 
243 aa  129  6e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.916151 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_362  amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  32.76 
 
 
260 aa  128  6e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000000733431  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  34.23 
 
 
260 aa  128  7.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2733  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  33.87 
 
 
243 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0727882  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00868  arginine transporter subunit  33.87 
 
 
243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.208844  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2779  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  33.87 
 
 
243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0149314  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00874  hypothetical protein  33.87 
 
 
243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.183806  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2468  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtI  33.87 
 
 
243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.381979  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0936  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtI  33.87 
 
 
243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.570643  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2280  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  32.79 
 
 
244 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0967  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtI  33.87 
 
 
243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0131  glutamine transport system substrate-binding protein  33.48 
 
 
285 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.210199  normal  0.0525108 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2782  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  33.06 
 
 
243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0257892  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1571  extracellular solute-binding protein family 3  32.74 
 
 
249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1767  extracellular solute-binding protein  33.48 
 
 
276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.99488  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0962  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtI  34.26 
 
 
245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0927  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtI  34.26 
 
 
245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00865  arginine transporter subunit  33.06 
 
 
243 aa  126  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0932  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  33.06 
 
 
243 aa  126  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00871  hypothetical protein  33.06 
 
 
243 aa  126  3e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0994  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtI  34.27 
 
 
243 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.633483  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0891  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtI  33.47 
 
 
243 aa  126  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.437353  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0964  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  33.06 
 
 
243 aa  126  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1025  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtI  34.27 
 
 
243 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1446  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.05 
 
 
494 aa  126  3e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.233096  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0161  extracellular solute-binding protein family 3  33.33 
 
 
246 aa  126  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.377397  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1044  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtI  34.27 
 
 
243 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.180668  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2736  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  33.06 
 
 
243 aa  126  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0318086  normal  0.950747 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2306  extracellular solute-binding protein  30 
 
 
246 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000079937  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1758  extracellular solute-binding protein family 3  32.74 
 
 
247 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.809792  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0906  extracellular solute-binding protein  36.2 
 
 
279 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.663665  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1869  extracellular solute-binding protein family 3  34.08 
 
 
272 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000802311  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0398  extracellular solute-binding protein  32.59 
 
 
257 aa  125  5e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000444097  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2724  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  34.01 
 
 
243 aa  125  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00108182  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3886  amino acid ABC transporter permease  31.86 
 
 
501 aa  125  6e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2471  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  31.98 
 
 
243 aa  125  6e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.198291  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1345  extracellular solute-binding protein family 3  32.14 
 
 
244 aa  125  6e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.706269 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0429  extracellular solute-binding protein family 3  36.65 
 
 
283 aa  125  6e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1964  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  31.98 
 
 
243 aa  125  7e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.822983  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3512  extracellular solute-binding protein family 3  30.4 
 
 
256 aa  125  7e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.249774  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2391  extracellular solute-binding protein family 3  35.45 
 
 
254 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>