More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2108 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2108  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 		 367 aa  745    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.347982  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4145  ATPase central domain-containing protein  39.3 
 
 		 388 aa  267  2e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147452 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3059  ATPase central domain-containing protein  36.36 
 
 		 363 aa  231  2e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.96383  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0291  AAA ATPase  31.39 
 
 		 370 aa  196  6e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00325104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7319  ATPase central domain-containing protein  43.48 
 
 		 355 aa  188  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal  0.136646 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0522  ATPase central domain-containing protein  33.33 
 
 		 391 aa  187  3e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3738  ATPase central domain-containing protein  33.51 
 
 		 387 aa  182  7e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00636  ATPase, AAA family  36.13 
 
 		 325 aa  178  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113631  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2097  AAA ATPase central domain protein  35.56 
 
 		 369 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0513  AAA ATPase, central region  32.04 
 
 		 401 aa  168  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2298  ATPase central domain-containing protein  35.5 
 
 		 345 aa  165  9e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00265806 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3794  AAA ATPase, central region  36.07 
 
 		 369 aa  160  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.437647  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1971  ATPase central domain-containing protein  35.35 
 
 		 390 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.68669  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6418  AAA ATPase, central region  34.33 
 
 		 405 aa  159  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.255051  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2442  ATPase central domain-containing protein  34.3 
 
 		 388 aa  159  8e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3321  AAA family ATPase  36.84 
 
 		 326 aa  158  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.81305  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5696  AAA ATPase, central region  39.91 
 
 		 389 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1081  AAA ATPase, central region  35.48 
 
 		 360 aa  151  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3109  putative ATPase  50.38 
 
 		 366 aa  147  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2659  AAA ATPase central domain protein  42.92 
 
 		 322 aa  146  5e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000788626  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3503  AAA ATPase, central region  30.42 
 
 		 348 aa  145  8.000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0097  ATPase central domain-containing protein  36.82 
 
 		 338 aa  144  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0747  AAA ATPase central domain protein  35.37 
 
 		 335 aa  142  9e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.425262  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5901  AAA ATPase central domain protein  39.8 
 
 		 352 aa  139  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777397 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0449  AAA ATPase, central region  36.36 
 
 		 335 aa  137  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2338  AAA ATPase, central region  45.36 
 
 		 425 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2522  ATPase central domain-containing protein  31.16 
 
 		 324 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2254  ATPase of the AAA+ class  28.52 
 
 		 321 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3822  ATPase central domain-containing protein  47.66 
 
 		 322 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0247422 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2677  ATPase central domain-containing protein  29.93 
 
 		 328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0190  ATPase central domain-containing protein  39.38 
 
 		 425 aa  134  3e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384028  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0486  ATPase central domain-containing protein  36.87 
 
 		 424 aa  133  3.9999999999999996e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0386  AAA ATPase central domain protein  31.49 
 
 		 327 aa  133  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.156492 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1467  AAA ATPase, central region  39.11 
 
 		 332 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1490  ATPase central domain-containing protein  39.11 
 
 		 332 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4460  ATPase central domain-containing protein  37.24 
 
 		 320 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2326  ATPase central domain-containing protein  39 
 
 		 419 aa  131  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3431  AAA ATPase central domain protein  34.76 
 
 		 477 aa  130  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1958  AAA ATPase central domain protein  40 
 
 		 468 aa  130  3e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.268075 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5573  AAA ATPase, central region  39 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.292045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5976  ATPase central domain-containing protein  39 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4803  ATPase central domain-containing protein  32.6 
 
 		 328 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0735  AAA ATPase central domain protein  34.19 
 
 		 459 aa  129  9.000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2089  ATPase central domain-containing protein  38.35 
 
 		 428 aa  129  9.000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2215  AAA ATPase central domain protein  35.04 
 
 		 451 aa  129  9.000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0998186  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1642  AAA-family ATPase  33.48 
 
 		 308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1955  AAA ATPase  36.74 
 
 		 430 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1585  AAA ATPase, central domain-containing protein  35.38 
 
 		 329 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3863  ATPase central domain-containing protein  35.38 
 
 		 329 aa  127  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000266484 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0086  ATPase  29.52 
 
 		 335 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1301  AAA ATPase central domain protein  32.65 
 
 		 493 aa  126  8.000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2089  AAA ATPase  30.41 
 
 		 336 aa  125  9e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1291  ATPase central domain-containing protein  30.67 
 
 		 328 aa  125  9e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262565  normal  0.0615786 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0529  cell division cycle protein 48-like protein  39.56 
 
 		 426 aa  125  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5489  AAA ATPase central domain protein  31.17 
 
 		 336 aa  125  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3852  AAA ATPase central domain protein  29.21 
 
 		 335 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3671  ATPase central domain-containing protein  30.94 
 
 		 330 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5327  ATPase central domain-containing protein  35.35 
 
 		 327 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.449619  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4229  ATPase central domain-containing protein  32.9 
 
 		 328 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1017  hypothetical protein  35.98 
 
 		 427 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2775  ATPase central domain-containing protein  31.03 
 
 		 325 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.36839  normal  0.706454 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4892  AAA ATPase central domain protein  28.39 
 
 		 326 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2583  AAA ATPase central domain protein  35.64 
 
 		 419 aa  119  7e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2822  AAA ATPase central domain protein  36.31 
 
 		 239 aa  119  9e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03290  ATPase, putative  34.65 
 
 		 405 aa  117  3e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10210  AAA+ family ATPase  36.52 
 
 		 336 aa  117  3e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.954892  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1692  putative ATPase  30.97 
 
 		 322 aa  117  3e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2857  ATPase central domain-containing protein  32.27 
 
 		 328 aa  117  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3536  ATPase central domain-containing protein  29.66 
 
 		 336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22928 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4254  AAA ATPase central domain protein  31.7 
 
 		 332 aa  115  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.656455  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01550  endopeptidase, putative  33.48 
 
 		 464 aa  114  3e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.865518  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2106  AAA ATPase  32.11 
 
 		 371 aa  114  3e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85761  26S protease subunit RPT4 (26S protease subunit SUG2) (Proteasomal cap subunit)  35.48 
 
 		 416 aa  114  4.0000000000000004e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.341718  normal  0.159026 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0961  ATPase central domain-containing protein  29.67 
 
 		 336 aa  113  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0441  putative cell division protease FtsH-like protein  30.98 
 
 		 641 aa  113  6e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.375713  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2640  ATPase central domain-containing protein  30.49 
 
 		 332 aa  113  6e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.288063  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2076  AAA ATPase central domain protein  30.36 
 
 		 473 aa  113  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.698999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4276  ATPase central domain-containing protein  32.98 
 
 		 327 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7802  cell division protein  32.55 
 
 		 630 aa  112  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4417  ATPase central domain-containing protein  32.98 
 
 		 327 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.6 
 
 		 721 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1196  cell division protein FtsH  30.98 
 
 		 648 aa  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.266432  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2786  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.74 
 
 		 601 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2472  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.08 
 
 		 601 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05991  peroxisome biogenesis protein peroxin 1 (Eurofung)  40.11 
 
 		 1225 aa  110  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.453589 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0166  cell division protein FtsH  29.17 
 
 		 651 aa  110  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000721667  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1901  FtsH-2 peptidase  31.56 
 
 		 659 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0559  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.04 
 
 		 801 aa  111  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05747  hypothetical protein similar to PSMC6 subunit (Broad)  34.2 
 
 		 393 aa  110  4.0000000000000004e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.222803  normal  0.0253751 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.72 
 
 		 737 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1140  ATPase central domain-containing protein  31.28 
 
 		 372 aa  110  5e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.42 
 
 		 739 aa  110  5e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002603  cell division protein FtsH  31.78 
 
 		 660 aa  109  6e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000182706  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1429  ATPase central domain-containing protein  35.11 
 
 		 464 aa  109  6e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2069  AAA ATPase central domain protein  35.64 
 
 		 776 aa  109  6e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.963415  normal  0.166628 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03404  hypothetical protein  31.78 
 
 		 658 aa  109  7.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0101  AAA family ATPase  33.01 
 
 		 722 aa  109  7.000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2569  peptidase M41, FtsH  34.56 
 
 		 641 aa  109  8.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000845189  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.72 
 
 		 738 aa  109  9.000000000000001e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.033227 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3486  ATP-dependent metalloprotease  27.34 
 
 		 647 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000528036  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>