More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0105 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2134  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  52.95 
 
 		 647 aa  668    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.208796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1273  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  54.53 
 
 		 648 aa  665    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.804783  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0105  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  100 
 
 		 635 aa  1309    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0719  DNA topoisomerase IV subunit B  44.97 
 
 		 649 aa  550  1e-155  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1044  DNA gyrase, B subunit  43.2 
 
 		 675 aa  545  1e-154  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11740  DNA gyrase, B subunit  44.27 
 
 		 637 aa  548  1e-154  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00171708  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0671  DNA gyrase, B subunit  45.89 
 
 		 627 aa  546  1e-154  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.958816  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  43.89 
 
 		 636 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  43.89 
 
 		 636 aa  538  9.999999999999999e-153  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  44.65 
 
 		 644 aa  541  9.999999999999999e-153  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  44.55 
 
 		 628 aa  541  9.999999999999999e-153  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0051  DNA gyrase, B subunit  44.67 
 
 		 640 aa  536  1e-151  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  43.8 
 
 		 632 aa  538  1e-151  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  43.38 
 
 		 640 aa  535  1e-150  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2717  DNA gyrase, B subunit  43.86 
 
 		 649 aa  531  1e-149  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  43.99 
 
 		 644 aa  529  1e-149  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000155334 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2173  DNA topoisomerase IV subunit B  47.38 
 
 		 678 aa  531  1e-149  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  44.62 
 
 		 633 aa  530  1e-149  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000695632  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0005  DNA gyrase subunit B  46.38 
 
 		 640 aa  527  1e-148  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00215329  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2748  DNA gyrase, B subunit  42.68 
 
 		 637 aa  523  1e-147  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000339515  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0015  DNA gyrase, B subunit  43.82 
 
 		 644 aa  522  1e-147  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000401037  normal  0.862842 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0015  DNA gyrase, B subunit  44.13 
 
 		 643 aa  524  1e-147  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00473367  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  43.4 
 
 		 633 aa  525  1e-147  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  42.74 
 
 		 633 aa  522  1e-147  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0966  DNA gyrase, B subunit  45.02 
 
 		 650 aa  523  1e-147  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2428  DNA topoisomerase IV subunit B  47.05 
 
 		 663 aa  519  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.221174  normal  0.0343641 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0772  DNA topoisomerase IV subunit B  47.2 
 
 		 663 aa  520  1e-146  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.117663  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4757  DNA topoisomerase IV subunit B  46.5 
 
 		 678 aa  519  1e-146  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.125119 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  42.9 
 
 		 650 aa  521  1e-146  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000273734  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0004  DNA gyrase, B subunit  44.09 
 
 		 642 aa  517  1.0000000000000001e-145  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0005  DNA gyrase subunit B  45.75 
 
 		 640 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0010  DNA gyrase, B subunit  44.62 
 
 		 644 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000291276  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0006  DNA gyrase B subunit  44.17 
 
 		 656 aa  517  1.0000000000000001e-145  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.381905 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1328  DNA topoisomerase IV subunit B  46.12 
 
 		 672 aa  516  1.0000000000000001e-145  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.070173  normal  0.202878 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1547  DNA gyrase, B subunit  45.25 
 
 		 635 aa  512  1e-144  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00189026  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0407  DNA topoisomerase IV subunit B  46.66 
 
 		 663 aa  514  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2254  DNA gyrase, B subunit  42.86 
 
 		 646 aa  513  1e-144  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1653  DNA topoisomerase IV subunit B  45.31 
 
 		 685 aa  512  1e-144  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.0034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0029  DNA gyrase, B subunit  43.73 
 
 		 637 aa  513  1e-144  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0041  DNA gyrase, B subunit  43.26 
 
 		 634 aa  513  1e-144  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  44.41 
 
 		 634 aa  512  1e-144  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2317  DNA topoisomerase IV subunit B  45.4 
 
 		 683 aa  512  1e-144  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1015  DNA topoisomerase IV subunit B  46.06 
 
 		 683 aa  514  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0005  DNA gyrase subunit B  44.41 
 
 		 666 aa  512  1e-144  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2729  DNA gyrase, B subunit  42.66 
 
 		 641 aa  511  1e-143  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.739794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0029  DNA topoisomerase IV subunit B  44.22 
 
 		 653 aa  511  1e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0005  DNA gyrase, B subunit  42.08 
 
 		 686 aa  510  1e-143  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.217672  normal  0.192252 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0820  DNA gyrase, B subunit  43.78 
 
 		 644 aa  509  1e-143  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.929877  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0006  DNA gyrase, B subunit  44.95 
 
 		 638 aa  511  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.014329  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0007  DNA gyrase, B subunit  43.12 
 
 		 642 aa  510  1e-143  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000235506  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_4  DNA gyrase, B subunit  43.99 
 
 		 642 aa  512  1e-143  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2867  DNA topoisomerase IV subunit B  45.13 
 
 		 707 aa  511  1e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.018602 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2827  DNA topoisomerase IV subunit B  45.54 
 
 		 685 aa  510  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.116959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf800  DNA gyrase subunit B  42.19 
 
 		 647 aa  511  1e-143  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0004  DNA gyrase subunit B  44.3 
 
 		 642 aa  510  1e-143  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0036  DNA gyrase subunit B  43.19 
 
 		 643 aa  510  1e-143  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3685  DNA gyrase, B subunit  41.88 
 
 		 636 aa  509  1e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.50658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  43.78 
 
 		 644 aa  509  1e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0005  DNA gyrase, B subunit  45.32 
 
 		 636 aa  507  9.999999999999999e-143  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0130  DNA gyrase, B subunit  43.01 
 
 		 636 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.95821  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0016  DNA gyrase, B subunit  43.35 
 
 		 649 aa  507  9.999999999999999e-143  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00028541  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2710  DNA topoisomerase IV subunit B  44.19 
 
 		 665 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.24442  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2978  DNA topoisomerase IV subunit B  45.16 
 
 		 684 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.141952 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1048  DNA gyrase, B subunit  41.31 
 
 		 665 aa  508  9.999999999999999e-143  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.903378  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1836  DNA topoisomerase IV subunit B  45.29 
 
 		 656 aa  506  9.999999999999999e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0006  DNA gyrase, B subunit  42.61 
 
 		 642 aa  505  9.999999999999999e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.965796  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0005  DNA gyrase, B subunit  41.67 
 
 		 685 aa  502  1e-141  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1702  DNA gyrase, B subunit  42.77 
 
 		 654 aa  503  1e-141  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.118209 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4578  DNA topoisomerase IV subunit B  44.07 
 
 		 660 aa  502  1e-141  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.941273 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00050  DNA gyrase subunit B  43.28 
 
 		 645 aa  504  1e-141  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0377504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4352  DNA topoisomerase IV subunit B  44.89 
 
 		 682 aa  503  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.494271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2086  DNA topoisomerase IV subunit B  45.11 
 
 		 666 aa  503  1e-141  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0442115  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1925  DNA topoisomerase IV subunit B  44.82 
 
 		 653 aa  502  1e-141  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2484  DNA topoisomerase IV subunit B  44.85 
 
 		 684 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.185915 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0005  DNA gyrase, B subunit  43.24 
 
 		 633 aa  505  1e-141  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1091  DNA topoisomerase IV subunit B  45.06 
 
 		 659 aa  504  1e-141  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1109  hypothetical protein  42.13 
 
 		 651 aa  502  1e-141  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432981 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0006  DNA gyrase, B subunit  43.3 
 
 		 648 aa  504  1e-141  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000466462  hitchhiker  0.000000932752 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3307  DNA topoisomerase IV subunit B  44.58 
 
 		 684 aa  503  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0006  DNA gyrase, B subunit  42.97 
 
 		 657 aa  502  1e-141  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0640432  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2765  DNA topoisomerase IV subunit B  44.62 
 
 		 683 aa  502  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.170843  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0006  DNA gyrase subunit B  43.5 
 
 		 661 aa  504  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.925878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5315  DNA gyrase subunit B  43.55 
 
 		 640 aa  502  1e-141  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.021698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  42.95 
 
 		 641 aa  501  1e-140  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1003  DNA topoisomerase IV subunit B  45.13 
 
 		 686 aa  501  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.674809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0749  DNA topoisomerase IV subunit B  44.91 
 
 		 654 aa  501  1e-140  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.120428  normal  0.923958 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3119  DNA topoisomerase IV subunit B  45.75 
 
 		 701 aa  500  1e-140  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4986  DNA gyrase, B subunit  42.5 
 
 		 651 aa  499  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639656  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl006  DNA gyrase subunit B  43.13 
 
 		 635 aa  499  1e-140  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0006  DNA gyrase subunit B  45.22 
 
 		 661 aa  501  1e-140  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.60604  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0006  DNA gyrase subunit B  43.31 
 
 		 695 aa  501  1e-140  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000061906 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0047  DNA gyrase, B subunit  42.48 
 
 		 645 aa  500  1e-140  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109606 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00060  DNA gyrase, B subunit  42.19 
 
 		 642 aa  500  1e-140  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0132  DNA gyrase, B subunit  40.82 
 
 		 637 aa  501  1e-140  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.312038  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0006  DNA gyrase subunit B  43.46 
 
 		 638 aa  499  1e-140  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0006  DNA gyrase subunit B  43.46 
 
 		 638 aa  499  1e-140  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3250  DNA topoisomerase IV subunit B  44.89 
 
 		 679 aa  500  1e-140  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.629772  normal  0.680031 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0006  DNA gyrase subunit B  43.18 
 
 		 696 aa  499  1e-140  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248414  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00060  DNA gyrase subunit B  42.68 
 
 		 654 aa  499  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0159442  normal  0.243862 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4195  DNA gyrase, B subunit  42.33 
 
 		 653 aa  499  1e-140  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698411 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>